More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2690 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  52.76 
 
 		 692 aa  682    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  52.35 
 
 		 691 aa  699    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 697 aa  1389    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  50.93 
 
 		 666 aa  655    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  48.28 
 
 		 660 aa  617  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 675 aa  587  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  43.37 
 
 		 713 aa  557  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  42.63 
 
 		 666 aa  558  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  43.62 
 
 		 677 aa  555  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 671 aa  521  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 655 aa  522  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  43.69 
 
 		 673 aa  514  1e-144  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 		 671 aa  511  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  40.14 
 
 		 685 aa  502  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  43.14 
 
 		 674 aa  499  1e-140  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 679 aa  497  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 681 aa  493  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 696 aa  488  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  40.25 
 
 		 667 aa  479  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  40.25 
 
 		 667 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  39.94 
 
 		 667 aa  477  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 		 695 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 		 673 aa  473  1e-132  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  39.19 
 
 		 670 aa  472  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 701 aa  474  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  39.52 
 
 		 670 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 		 656 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 		 653 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  39.22 
 
 		 667 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  39.08 
 
 		 672 aa  465  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 729 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 664 aa  431  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0059  CheA signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 675 aa  421  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.850831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1856  CheA signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 658 aa  414  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  32.95 
 
 		 660 aa  403  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  34.63 
 
 		 702 aa  394  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 688 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 649 aa  393  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  33.04 
 
 		 801 aa  392  1e-107  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 		 694 aa  389  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 686 aa  386  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 677 aa  386  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  34.37 
 
 		 681 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  47.46 
 
 		 606 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1336  CheA signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 657 aa  379  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280744  normal  0.428976 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  33.66 
 
 		 669 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 671 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  46.27 
 
 		 610 aa  372  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  46.14 
 
 		 598 aa  372  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 702 aa  371  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  47.44 
 
 		 607 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  33.81 
 
 		 662 aa  372  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  47.44 
 
 		 601 aa  372  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 		 603 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 682 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 		 604 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 695 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 920 aa  366  1e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  34.52 
 
 		 669 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 650 aa  364  2e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2888  CheA signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 671 aa  365  2e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 701 aa  364  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  32.16 
 
 		 741 aa  363  4e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  34.38 
 
 		 669 aa  362  9e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  42.82 
 
 		 770 aa  362  1e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 		 919 aa  362  1e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  33.42 
 
 		 720 aa  362  1e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  34.38 
 
 		 669 aa  362  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 719 aa  362  2e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  34.09 
 
 		 669 aa  362  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  44.58 
 
 		 774 aa  361  2e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  34.09 
 
 		 669 aa  362  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 690 aa  361  3e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  32.84 
 
 		 754 aa  360  4e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0766  CheA signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 802 aa  360  4e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  32.91 
 
 		 703 aa  359  9e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 		 919 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  43.15 
 
 		 769 aa  359  9.999999999999999e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  33.57 
 
 		 655 aa  358  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  43.15 
 
 		 769 aa  358  1.9999999999999998e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  44.66 
 
 		 803 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  31.96 
 
 		 758 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  32.72 
 
 		 715 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  33.15 
 
 		 729 aa  357  5e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  42.92 
 
 		 769 aa  357  5.999999999999999e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 		 770 aa  357  5.999999999999999e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 684 aa  356  7.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 707 aa  355  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0942  CheA signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 670 aa  355  2e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  33.56 
 
 		 717 aa  354  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 652 aa  353  5.9999999999999994e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 		 954 aa  353  8e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  33.15 
 
 		 705 aa  352  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  43.81 
 
 		 770 aa  352  1e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 741 aa  350  3e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  32.51 
 
 		 727 aa  350  5e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0755  CheA signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 688 aa  349  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0128541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  32.64 
 
 		 700 aa  348  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  44.96 
 
 		 783 aa  348  2e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  32.45 
 
 		 717 aa  348  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.286152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>