More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0755 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2222  chemotaxis protein CheA  64.82 
 
 
692 aa  855    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  65.2 
 
 
690 aa  868    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  60.26 
 
 
701 aa  773    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  95.35 
 
 
686 aa  1295    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  70.12 
 
 
671 aa  940    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0755  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
688 aa  1369    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0128541 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1729  CheA signal transduction histidine kinases  51.36 
 
 
693 aa  623  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2828  CheA signal transduction histidine kinase  45.34 
 
 
685 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2920  CheA signal transduction histidine kinase  45.34 
 
 
685 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.038084  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2736  CheA signal transduction histidine kinase  44.27 
 
 
687 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
729 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
681 aa  392  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  36.08 
 
 
774 aa  390  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
696 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  35.32 
 
 
685 aa  378  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
691 aa  376  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 
770 aa  373  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  34.66 
 
 
692 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
694 aa  369  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  34.2 
 
 
677 aa  366  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
675 aa  365  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
673 aa  362  1e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  44.55 
 
 
598 aa  360  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
699 aa  361  3e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  46.82 
 
 
610 aa  360  5e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 
666 aa  359  9e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
666 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  43.76 
 
 
769 aa  358  2.9999999999999997e-97  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
702 aa  355  1e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
701 aa  355  1e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  43.25 
 
 
769 aa  355  2e-96  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
655 aa  355  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  43.08 
 
 
769 aa  355  2e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  42.53 
 
 
770 aa  354  2.9999999999999997e-96  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  41.65 
 
 
607 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  44.72 
 
 
606 aa  353  8e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  33 
 
 
697 aa  350  4e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
695 aa  350  7e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  41.88 
 
 
601 aa  348  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
660 aa  348  2e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
686 aa  348  3e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  45.08 
 
 
604 aa  347  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
688 aa  345  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  43.72 
 
 
785 aa  345  1e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  44.82 
 
 
603 aa  345  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  30.26 
 
 
670 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  32.28 
 
 
702 aa  343  5.999999999999999e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  30.91 
 
 
667 aa  343  7e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  41.5 
 
 
803 aa  343  8e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  30.5 
 
 
672 aa  342  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  43.65 
 
 
770 aa  341  2e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  30.92 
 
 
667 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  30.92 
 
 
667 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  30.61 
 
 
667 aa  340  5e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  34 
 
 
671 aa  339  9e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 
650 aa  339  9.999999999999999e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  43 
 
 
783 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  33.33 
 
 
720 aa  339  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  30.46 
 
 
670 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
653 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
656 aa  337  5.999999999999999e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1408  chemotaxis protein histidine kinase, CheA-like  33.28 
 
 
846 aa  335  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0658876  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
671 aa  334  3e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
682 aa  333  6e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  34.65 
 
 
700 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
684 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  32.9 
 
 
681 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
707 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 
719 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
684 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
679 aa  326  7e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1856  CheA signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
658 aa  326  8.000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
687 aa  325  2e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  41.69 
 
 
713 aa  324  3e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1989  ATP-binding region ATPase domain protein  31.88 
 
 
678 aa  323  4e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  32.94 
 
 
639 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  42.14 
 
 
954 aa  321  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 
558 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1771  CheA signal transduction histidine kinases  42.07 
 
 
727 aa  320  7e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  33.09 
 
 
662 aa  319  9e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 
1031 aa  318  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  32.33 
 
 
669 aa  317  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  42.27 
 
 
673 aa  318  3e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 
674 aa  317  4e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  32.08 
 
 
660 aa  317  4e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  32.85 
 
 
654 aa  317  5e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  32.53 
 
 
674 aa  316  9e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0766  CheA signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 
802 aa  315  1.9999999999999998e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  41.77 
 
 
1089 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
654 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  32.55 
 
 
654 aa  313  6.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 
724 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  32.55 
 
 
654 aa  313  6.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  32.55 
 
 
654 aa  313  6.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  32.55 
 
 
652 aa  312  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  32.41 
 
 
654 aa  312  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  32.4 
 
 
652 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  46.79 
 
 
801 aa  311  2e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  32.61 
 
 
654 aa  312  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  41.62 
 
 
695 aa  310  5e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>