More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1729 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2222  chemotaxis protein CheA  52.64 
 
 
692 aa  666    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  51.73 
 
 
690 aa  678    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  52.55 
 
 
671 aa  691    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  51.52 
 
 
686 aa  658    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0755  CheA signal transduction histidine kinase  51.13 
 
 
688 aa  656    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0128541 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1729  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 
693 aa  1377    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  54.26 
 
 
701 aa  687    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2920  CheA signal transduction histidine kinase  45.68 
 
 
685 aa  512  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.038084  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2828  CheA signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 
685 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2736  CheA signal transduction histidine kinase  45.28 
 
 
687 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  37.44 
 
 
685 aa  375  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 
681 aa  372  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
696 aa  354  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
666 aa  348  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
729 aa  347  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
701 aa  342  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
691 aa  341  2.9999999999999998e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  33.53 
 
 
702 aa  340  5e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
655 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  32.65 
 
 
785 aa  338  2.9999999999999997e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  31.91 
 
 
692 aa  332  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
660 aa  331  3e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
666 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  34.01 
 
 
652 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 
695 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 
675 aa  326  8.000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  33.72 
 
 
681 aa  326  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
697 aa  325  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
713 aa  325  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
673 aa  325  2e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  33.62 
 
 
654 aa  325  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  33.29 
 
 
674 aa  325  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  33.62 
 
 
654 aa  325  3e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
654 aa  324  3e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  33.62 
 
 
654 aa  325  3e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  33.62 
 
 
652 aa  325  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  33.24 
 
 
654 aa  324  3e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  33.48 
 
 
654 aa  324  4e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  32.7 
 
 
677 aa  323  7e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
694 aa  323  8e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  30.11 
 
 
801 aa  322  9.999999999999999e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  33.09 
 
 
654 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  33.82 
 
 
669 aa  317  5e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 
699 aa  316  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  40 
 
 
558 aa  313  9e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 
682 aa  312  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  33.14 
 
 
662 aa  309  9e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
679 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
686 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  33.29 
 
 
720 aa  309  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1856  CheA signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
658 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  37.87 
 
 
601 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
652 aa  308  3e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
770 aa  306  6e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  34.11 
 
 
717 aa  306  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  31.99 
 
 
702 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  32.75 
 
 
700 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  31.57 
 
 
702 aa  306  1.0000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  38.3 
 
 
769 aa  305  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
719 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 
673 aa  304  3.0000000000000004e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  33.61 
 
 
717 aa  304  4.0000000000000003e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  41.31 
 
 
674 aa  303  7.000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 
653 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 
679 aa  303  9e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  38.3 
 
 
769 aa  301  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  37.83 
 
 
769 aa  301  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
733 aa  301  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3299  CheA signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
671 aa  300  6e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  30.3 
 
 
670 aa  300  7e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 
1031 aa  300  7e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  32.5 
 
 
639 aa  300  8e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  43.08 
 
 
1089 aa  299  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  37.41 
 
 
770 aa  298  2e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
684 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  40.51 
 
 
610 aa  298  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  28.9 
 
 
667 aa  296  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 
954 aa  296  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  29.87 
 
 
670 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
598 aa  295  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  30.89 
 
 
714 aa  294  4e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  28.75 
 
 
667 aa  294  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  28.75 
 
 
667 aa  294  4e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  34.56 
 
 
727 aa  293  6e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  38.17 
 
 
783 aa  293  7e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1408  chemotaxis protein histidine kinase, CheA-like  31.26 
 
 
846 aa  293  8e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0658876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
656 aa  293  9e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 
604 aa  292  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4676  CheA signal transduction histidine kinases  32.47 
 
 
686 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  36.15 
 
 
774 aa  291  3e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
684 aa  291  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  32.82 
 
 
660 aa  291  3e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  36.83 
 
 
770 aa  291  3e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 
603 aa  291  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
688 aa  291  4e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 
606 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
695 aa  290  8e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0984  chemotaxis sensor histidine kinase  29.67 
 
 
598 aa  288  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  28.51 
 
 
672 aa  288  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  42.93 
 
 
1030 aa  288  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>