More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1383 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  87.03 
 
 
1030 aa  687    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1031 aa  2073    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  61.6 
 
 
954 aa  1105    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  86.82 
 
 
1089 aa  713    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
770 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 
681 aa  402  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  39.54 
 
 
598 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  37.18 
 
 
770 aa  393  1e-108  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  37.18 
 
 
770 aa  394  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 
607 aa  392  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  35.26 
 
 
769 aa  390  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  35.5 
 
 
769 aa  392  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  34.95 
 
 
769 aa  388  1e-106  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  45.44 
 
 
774 aa  388  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  43.6 
 
 
713 aa  385  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 
603 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  47.7 
 
 
729 aa  383  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  36.98 
 
 
601 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
604 aa  383  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  38.79 
 
 
610 aa  378  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  46.54 
 
 
685 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1009  chemotaxis protein CheA  32.43 
 
 
761 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  48.97 
 
 
673 aa  379  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  49.37 
 
 
677 aa  378  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  46.5 
 
 
675 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  45.21 
 
 
606 aa  379  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  46.47 
 
 
783 aa  374  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
747 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  44.79 
 
 
785 aa  376  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  34.34 
 
 
720 aa  372  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  47.61 
 
 
655 aa  369  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  31.2 
 
 
801 aa  369  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
733 aa  369  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  45.55 
 
 
701 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  45.69 
 
 
927 aa  369  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  46.33 
 
 
660 aa  366  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  46.91 
 
 
666 aa  365  3e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  42.6 
 
 
691 aa  364  4e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  44.11 
 
 
803 aa  362  3e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
871 aa  361  4e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  46.45 
 
 
666 aa  361  5e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  47.81 
 
 
673 aa  359  9.999999999999999e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  47.42 
 
 
558 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  44.69 
 
 
695 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  46.39 
 
 
674 aa  358  2.9999999999999997e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  46.84 
 
 
920 aa  358  3.9999999999999996e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  42.99 
 
 
919 aa  358  3.9999999999999996e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  46.63 
 
 
671 aa  356  1e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  44.7 
 
 
767 aa  356  1e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
652 aa  356  1e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  44.63 
 
 
745 aa  354  5e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  43.94 
 
 
919 aa  354  5e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  47.69 
 
 
679 aa  354  5.9999999999999994e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  46.1 
 
 
692 aa  353  8e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  44.69 
 
 
719 aa  351  3e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
878 aa  350  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  42.25 
 
 
697 aa  348  2e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 
696 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  34.08 
 
 
801 aa  347  6e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  46.89 
 
 
671 aa  347  7e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
728 aa  346  1e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  45.84 
 
 
715 aa  347  1e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  44.61 
 
 
957 aa  345  2.9999999999999997e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  42.27 
 
 
701 aa  344  4e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  37.19 
 
 
639 aa  344  5e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
759 aa  344  5.999999999999999e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  40.48 
 
 
806 aa  343  8e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
694 aa  343  1e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 
650 aa  342  2.9999999999999998e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  40.38 
 
 
754 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  39.76 
 
 
751 aa  342  2.9999999999999998e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  35.82 
 
 
766 aa  341  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  41.86 
 
 
736 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  31.59 
 
 
887 aa  340  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  42.55 
 
 
760 aa  340  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 
738 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  43.44 
 
 
734 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  46.63 
 
 
724 aa  338  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2327  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  43.1 
 
 
862 aa  337  5e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  33.8 
 
 
910 aa  337  9e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 
741 aa  335  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  42.75 
 
 
1010 aa  335  3e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  45.5 
 
 
614 aa  334  6e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0577  putative CheA signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 
556 aa  333  8e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.482834  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
935 aa  333  9e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  44.76 
 
 
762 aa  333  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 
687 aa  332  2e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  31.11 
 
 
702 aa  332  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  44.96 
 
 
741 aa  332  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  46.25 
 
 
709 aa  332  3e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  39.76 
 
 
702 aa  331  4e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  45.97 
 
 
552 aa  331  4e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  45.97 
 
 
552 aa  331  4e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  44.5 
 
 
762 aa  330  6e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  42.25 
 
 
741 aa  330  8e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  33.67 
 
 
870 aa  330  8e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1336  CheA signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 
657 aa  330  9e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280744  normal  0.428976 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  42.02 
 
 
744 aa  330  9e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  45.52 
 
 
760 aa  329  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  39.96 
 
 
714 aa  329  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>