More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0740 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2222  chemotaxis protein CheA  65.15 
 
 		 692 aa  862    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 686 aa  1361    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  66.23 
 
 		 690 aa  882    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  70.61 
 
 		 671 aa  948    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0755  CheA signal transduction histidine kinase  95.35 
 
 		 688 aa  1284    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0128541 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  60.26 
 
 		 701 aa  775    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1729  CheA signal transduction histidine kinases  51.52 
 
 		 693 aa  622  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2920  CheA signal transduction histidine kinase  46.33 
 
 		 685 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.038084  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2828  CheA signal transduction histidine kinase  46.19 
 
 		 685 aa  535  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2736  CheA signal transduction histidine kinase  46.05 
 
 		 687 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 681 aa  397  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  36.14 
 
 		 774 aa  392  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 		 729 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 696 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  43.89 
 
 		 770 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 691 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  35.29 
 
 		 685 aa  372  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  34.43 
 
 		 692 aa  372  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  34.15 
 
 		 677 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 675 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  44.83 
 
 		 598 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 694 aa  366  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 701 aa  363  8e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  47.07 
 
 		 610 aa  360  3e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 		 655 aa  359  9.999999999999999e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  43.18 
 
 		 769 aa  358  1.9999999999999998e-97  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  44.96 
 
 		 606 aa  357  5e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 673 aa  356  6.999999999999999e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 702 aa  356  6.999999999999999e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 666 aa  355  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  42.5 
 
 		 769 aa  355  2e-96  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 660 aa  355  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  42.5 
 
 		 769 aa  354  2e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 699 aa  354  2.9999999999999997e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  44 
 
 		 601 aa  353  8.999999999999999e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 		 607 aa  352  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  45.01 
 
 		 604 aa  350  5e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  42.33 
 
 		 770 aa  349  8e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  41.48 
 
 		 803 aa  348  1e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 686 aa  349  1e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  44.15 
 
 		 603 aa  348  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 697 aa  347  5e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 695 aa  347  5e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 677 aa  346  8e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 688 aa  343  8e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  43.93 
 
 		 785 aa  342  1e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  30.69 
 
 		 670 aa  342  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  32.7 
 
 		 702 aa  342  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  44.17 
 
 		 770 aa  342  2e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  30.29 
 
 		 672 aa  342  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  30.25 
 
 		 667 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 653 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  29.97 
 
 		 667 aa  337  5e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  43.69 
 
 		 783 aa  337  5.999999999999999e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  30.27 
 
 		 667 aa  336  7e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  30.27 
 
 		 667 aa  336  7e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  34.27 
 
 		 700 aa  336  7.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  30.82 
 
 		 670 aa  336  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 684 aa  335  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 684 aa  335  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 671 aa  334  3e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 682 aa  334  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 650 aa  333  4e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 656 aa  333  6e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  33.11 
 
 		 720 aa  333  7.000000000000001e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1408  chemotaxis protein histidine kinase, CheA-like  32.55 
 
 		 846 aa  333  9e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0658876  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 719 aa  331  3e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  32.71 
 
 		 681 aa  328  3e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 713 aa  327  6e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  33.14 
 
 		 674 aa  325  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1856  CheA signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 658 aa  325  1e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1989  ATP-binding region ATPase domain protein  32.46 
 
 		 678 aa  324  4e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 		 558 aa  324  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  34.06 
 
 		 654 aa  323  6e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  42.72 
 
 		 954 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 707 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  31.61 
 
 		 714 aa  321  3e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 		 666 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1771  CheA signal transduction histidine kinases  41.33 
 
 		 727 aa  321  3.9999999999999996e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  33.58 
 
 		 654 aa  320  7e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 654 aa  320  7e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  33.58 
 
 		 654 aa  320  7e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  33.58 
 
 		 654 aa  320  7e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  33.43 
 
 		 654 aa  319  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  33.58 
 
 		 652 aa  318  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  33.43 
 
 		 652 aa  318  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  33.58 
 
 		 654 aa  318  3e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  32.9 
 
 		 662 aa  317  4e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 724 aa  316  9e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 		 674 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  41.75 
 
 		 673 aa  315  1.9999999999999998e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  32.26 
 
 		 660 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 		 1031 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  32.61 
 
 		 669 aa  314  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  32.61 
 
 		 669 aa  314  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  41.52 
 
 		 1089 aa  313  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  45.77 
 
 		 801 aa  313  1e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  32.61 
 
 		 669 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  32.61 
 
 		 669 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 686 aa  313  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>