More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1408 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1408  chemotaxis protein histidine kinase, CheA-like  100 
 
 		 846 aa  1700    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0658876  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 671 aa  347  7e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2222  chemotaxis protein CheA  32.99 
 
 		 692 aa  340  4e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 701 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0755  CheA signal transduction histidine kinase  33.28 
 
 		 688 aa  336  7.999999999999999e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0128541 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 686 aa  336  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  31.04 
 
 		 690 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2920  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 685 aa  290  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.038084  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2828  CheA signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 685 aa  290  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 681 aa  288  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2736  CheA signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 687 aa  283  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1729  CheA signal transduction histidine kinases  31.45 
 
 		 693 aa  270  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 		 696 aa  265  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 673 aa  259  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 675 aa  257  5e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  30.69 
 
 		 785 aa  257  6e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  37.13 
 
 		 748 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 660 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  30.42 
 
 		 803 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 666 aa  252  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 666 aa  251  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  36.93 
 
 		 753 aa  251  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 		 691 aa  249  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 737 aa  248  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.69 
 
 		 754 aa  248  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  35.57 
 
 		 714 aa  247  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  36 
 
 		 758 aa  247  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  29.86 
 
 		 769 aa  246  9e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  35.75 
 
 		 748 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  35.28 
 
 		 785 aa  246  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  35.53 
 
 		 723 aa  246  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 650 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1856  CheA signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 658 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  29.6 
 
 		 769 aa  246  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 739 aa  245  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  34.87 
 
 		 744 aa  244  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 695 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 741 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 743 aa  244  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 747 aa  244  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 747 aa  244  6e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  35.04 
 
 		 744 aa  243  7.999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  37.19 
 
 		 610 aa  243  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  29.56 
 
 		 769 aa  243  1e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 746 aa  243  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 733 aa  242  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 741 aa  241  5.999999999999999e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  34.77 
 
 		 767 aa  239  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  33.96 
 
 		 736 aa  239  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 679 aa  239  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  36.15 
 
 		 734 aa  239  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  26.8 
 
 		 677 aa  239  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 		 759 aa  239  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 770 aa  238  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  33.92 
 
 		 751 aa  238  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 747 aa  238  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  34.23 
 
 		 754 aa  238  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 733 aa  237  6e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 709 aa  237  6e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4077  Chemotaxis protein histidine kinase  36.7 
 
 		 662 aa  237  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 745 aa  237  7e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  32.52 
 
 		 760 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4316  Chemotaxis protein histidine kinase  39.16 
 
 		 685 aa  236  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 		 655 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3207  chemotaxis protein  35.61 
 
 		 758 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  28.53 
 
 		 639 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 738 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 671 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 747 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 746 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  35.19 
 
 		 806 aa  234  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  35.26 
 
 		 762 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 671 aa  234  5e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  30.22 
 
 		 685 aa  234  5e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 652 aa  234  5e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 701 aa  234  7.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  34.76 
 
 		 762 aa  234  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 759 aa  233  9e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 558 aa  233  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 747 aa  233  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 729 aa  233  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 652 aa  232  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0298  CheA signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 		 763 aa  232  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265941  normal  0.326442 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  35.62 
 
 		 1010 aa  232  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  27.35 
 
 		 692 aa  232  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 691 aa  231  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0330  CheA signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 		 758 aa  232  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.362553  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  36.14 
 
 		 703 aa  231  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  37.11 
 
 		 601 aa  231  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 654 aa  230  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2708  CheA signal transduction histidine kinase  38.23 
 
 		 735 aa  230  8e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972076  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 674 aa  229  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 871 aa  229  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 679 aa  229  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 679 aa  229  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 739 aa  228  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 713 aa  228  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  28.47 
 
 		 674 aa  228  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 1031 aa  228  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0279  CheA signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 751 aa  228  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597552  normal  0.855639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>