More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3907 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  58.05 
 
 		 741 aa  825    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  93.17 
 
 		 747 aa  1235    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  93.71 
 
 		 747 aa  1252    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  57.25 
 
 		 747 aa  817    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  56.88 
 
 		 714 aa  789    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3207  chemotaxis protein  57.23 
 
 		 758 aa  808    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  79.07 
 
 		 748 aa  1065    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  78.02 
 
 		 737 aa  1049    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  88.34 
 
 		 739 aa  1179    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  58.19 
 
 		 741 aa  828    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  79.42 
 
 		 758 aa  1077    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  73.73 
 
 		 748 aa  1011    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  59.9 
 
 		 744 aa  793    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  57.9 
 
 		 747 aa  810    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  79.05 
 
 		 754 aa  1078    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  59.26 
 
 		 746 aa  830    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  59.06 
 
 		 744 aa  811    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  52.13 
 
 		 719 aa  679    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  60.29 
 
 		 723 aa  846    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  62.91 
 
 		 745 aa  887    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  57.27 
 
 		 785 aa  808    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 743 aa  1486    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  59.97 
 
 		 691 aa  777    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  64.61 
 
 		 767 aa  918    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  62.7 
 
 		 738 aa  655    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  58.7 
 
 		 751 aa  837    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  58.62 
 
 		 734 aa  811    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  57.22 
 
 		 733 aa  801    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  56.78 
 
 		 754 aa  806    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  57.85 
 
 		 760 aa  827    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  51.42 
 
 		 715 aa  667    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  57.36 
 
 		 762 aa  807    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  58.82 
 
 		 736 aa  836    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  72.67 
 
 		 753 aa  1005    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  57.67 
 
 		 733 aa  812    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  57.62 
 
 		 762 aa  803    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  60.69 
 
 		 746 aa  651    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  58.02 
 
 		 759 aa  813    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  51.05 
 
 		 739 aa  677    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  55.1 
 
 		 650 aa  523  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 770 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  51.19 
 
 		 614 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  58.29 
 
 		 552 aa  432  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  58.29 
 
 		 552 aa  432  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 687 aa  424  1e-117  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 696 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  36.72 
 
 		 685 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  46.34 
 
 		 701 aa  390  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  46.19 
 
 		 769 aa  383  1e-105  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  43.89 
 
 		 785 aa  383  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  46.67 
 
 		 769 aa  384  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  46.19 
 
 		 769 aa  382  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 691 aa  381  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  43.22 
 
 		 770 aa  379  1e-104  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  45.95 
 
 		 774 aa  381  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  46.91 
 
 		 603 aa  378  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 		 598 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  47 
 
 		 783 aa  379  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  47.18 
 
 		 681 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  43.97 
 
 		 639 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 697 aa  375  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  41.96 
 
 		 803 aa  375  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 724 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 666 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  47.25 
 
 		 604 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  48.45 
 
 		 606 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 713 aa  372  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  46.88 
 
 		 601 aa  372  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  44.62 
 
 		 607 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  46.06 
 
 		 770 aa  368  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 724 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 		 652 aa  365  2e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  44.08 
 
 		 695 aa  365  2e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  47.64 
 
 		 610 aa  364  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 728 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 954 aa  359  9e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  35.14 
 
 		 704 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2222  chemotaxis protein CheA  31.61 
 
 		 692 aa  354  4e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  45.65 
 
 		 677 aa  353  7e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 675 aa  350  5e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0942  CheA signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 670 aa  348  2e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  44.18 
 
 		 673 aa  348  3e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  45.12 
 
 		 673 aa  347  6e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 		 728 aa  345  1e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  33.33 
 
 		 702 aa  345  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3221  CheA signal transduction histidine kinase  45.74 
 
 		 635 aa  345  2e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  42.42 
 
 		 766 aa  344  4e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 		 671 aa  344  4e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 		 660 aa  343  5e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  32.49 
 
 		 729 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  46.63 
 
 		 701 aa  340  5e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  34.18 
 
 		 784 aa  339  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  33.98 
 
 		 783 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 686 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1881  CheA signal transduction histidine kinases  33.46 
 
 		 736 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.254979 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 919 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  44.85 
 
 		 671 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  43.73 
 
 		 692 aa  338  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  34.94 
 
 		 715 aa  337  5e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 		 920 aa  336  7e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>