More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0197 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  58.64 
 
 
652 aa  733    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
687 aa  1366    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
719 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
650 aa  442  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  35.2 
 
 
751 aa  438  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  37.59 
 
 
803 aa  435  1e-120  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  37.46 
 
 
774 aa  421  1e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  35.73 
 
 
736 aa  421  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  35.88 
 
 
723 aa  414  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
598 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  35.79 
 
 
685 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
691 aa  385  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
673 aa  382  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
666 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
713 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  34.14 
 
 
677 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 
660 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
694 aa  369  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
655 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  33.99 
 
 
720 aa  368  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  42.99 
 
 
770 aa  365  1e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  44.36 
 
 
744 aa  365  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  32.87 
 
 
702 aa  365  2e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  43.97 
 
 
754 aa  365  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  44.42 
 
 
748 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  46.58 
 
 
681 aa  362  9e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  46.7 
 
 
783 aa  362  1e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  44.69 
 
 
785 aa  361  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  45.52 
 
 
747 aa  361  3e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  45.52 
 
 
746 aa  361  3e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  44.95 
 
 
753 aa  361  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  45.52 
 
 
747 aa  360  4e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  45.52 
 
 
738 aa  360  6e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  44.78 
 
 
754 aa  360  7e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  45.73 
 
 
762 aa  359  7e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  38.98 
 
 
769 aa  359  9e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3207  chemotaxis protein  45.73 
 
 
758 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  45.59 
 
 
741 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  45.48 
 
 
760 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  43.14 
 
 
744 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  45.27 
 
 
747 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  45.48 
 
 
762 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 
746 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 
743 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  46.45 
 
 
785 aa  357  3.9999999999999996e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  45.2 
 
 
737 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  44.94 
 
 
741 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  44.09 
 
 
758 aa  357  5e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  44.47 
 
 
733 aa  356  7.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 
747 aa  356  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  43.87 
 
 
748 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  45.15 
 
 
770 aa  355  1e-96  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  44.78 
 
 
739 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  38.61 
 
 
769 aa  355  1e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  41.13 
 
 
767 aa  355  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  38.98 
 
 
769 aa  355  2e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  45.09 
 
 
759 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  42.78 
 
 
709 aa  353  8.999999999999999e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 
745 aa  352  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  44.42 
 
 
691 aa  350  5e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  45.66 
 
 
770 aa  350  5e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  34.85 
 
 
715 aa  350  7e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  32.41 
 
 
660 aa  349  1e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  44.39 
 
 
734 aa  349  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 
675 aa  348  3e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  44.58 
 
 
733 aa  345  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 
701 aa  343  5e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
649 aa  343  5e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1856  CheA signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
658 aa  342  1e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
697 aa  342  1e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
671 aa  341  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 
696 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0988  CheA signal transduction histidine kinases  42.34 
 
 
734 aa  340  8e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.581275 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2888  CheA signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
671 aa  338  2.9999999999999997e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  41.28 
 
 
610 aa  337  5e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 
606 aa  335  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0942  CheA signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
670 aa  336  1e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 
695 aa  335  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
724 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  41.98 
 
 
739 aa  335  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  44.1 
 
 
671 aa  334  3e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
664 aa  333  6e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  44.1 
 
 
671 aa  332  1e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 
878 aa  331  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  32.9 
 
 
669 aa  331  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
686 aa  331  3e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2828  CheA signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
685 aa  331  3e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2920  CheA signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
685 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.038084  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  41.71 
 
 
1031 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  31.75 
 
 
704 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  38.77 
 
 
601 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  31.64 
 
 
801 aa  327  3e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 
607 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  42.45 
 
 
1089 aa  327  6e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  33.72 
 
 
652 aa  327  6e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  41.75 
 
 
673 aa  327  7e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
707 aa  326  8.000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 
728 aa  325  1e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  32.03 
 
 
674 aa  326  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  33.43 
 
 
654 aa  325  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>