More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1856 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1856  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
658 aa  1325    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  56.13 
 
 
660 aa  728    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1336  CheA signal transduction histidine kinase  59.31 
 
 
657 aa  754    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280744  normal  0.428976 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  50.86 
 
 
1010 aa  526  1e-148  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 
681 aa  429  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 
675 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  37.22 
 
 
677 aa  430  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  37.37 
 
 
702 aa  426  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
666 aa  426  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
691 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
666 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
673 aa  420  1e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 
713 aa  420  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
660 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
697 aa  414  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  36.35 
 
 
692 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 
655 aa  409  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 
671 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
673 aa  402  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  35.21 
 
 
685 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0942  CheA signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
670 aa  397  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
649 aa  394  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
695 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
696 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
679 aa  395  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
671 aa  393  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 
919 aa  387  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 
701 aa  385  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 
919 aa  382  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  32.8 
 
 
670 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  33.24 
 
 
667 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
653 aa  382  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  32.94 
 
 
670 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 
920 aa  382  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 
957 aa  380  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  32.59 
 
 
667 aa  379  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  33.04 
 
 
667 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  32.59 
 
 
667 aa  379  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
674 aa  378  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  33.43 
 
 
672 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
656 aa  375  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2920  CheA signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 
685 aa  356  7.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.038084  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2828  CheA signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
685 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2263  CheA signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
741 aa  351  2e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0131466 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 
719 aa  350  4e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2736  CheA signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
687 aa  350  5e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  31.48 
 
 
801 aa  346  7e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
694 aa  345  2e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
687 aa  342  1e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
677 aa  341  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2888  CheA signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
671 aa  340  5.9999999999999996e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
694 aa  339  8e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  31.56 
 
 
769 aa  335  2e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0361  CheW-like protein  41.39 
 
 
897 aa  333  6e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30104  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
709 aa  332  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
652 aa  331  2e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0059  CheA signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
675 aa  331  3e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.850831  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  31.91 
 
 
700 aa  328  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
686 aa  325  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0755  CheA signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
688 aa  324  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0128541 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 
770 aa  323  4e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
688 aa  323  6e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
697 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
686 aa  321  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  32.6 
 
 
681 aa  320  6e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
745 aa  319  7.999999999999999e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
701 aa  318  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
664 aa  317  4e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 
954 aa  317  6e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  31.25 
 
 
705 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  31.77 
 
 
654 aa  315  9.999999999999999e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 
654 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
698 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
702 aa  315  1.9999999999999998e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  41.65 
 
 
1089 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
671 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  31.77 
 
 
654 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  31.53 
 
 
654 aa  314  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  31.62 
 
 
652 aa  314  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  31.62 
 
 
654 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
654 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  31.13 
 
 
720 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  31.62 
 
 
654 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  31.62 
 
 
654 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 
1031 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
652 aa  313  6.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 
699 aa  313  7.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0984  chemotaxis sensor histidine kinase  39.59 
 
 
598 aa  312  1e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  31.47 
 
 
652 aa  312  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  40.9 
 
 
715 aa  312  2e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
690 aa  311  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
708 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  30.73 
 
 
674 aa  311  2.9999999999999997e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 
1030 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  30.86 
 
 
669 aa  310  5e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  29.27 
 
 
639 aa  310  6.999999999999999e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 
558 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
679 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  39.21 
 
 
709 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  39.73 
 
 
785 aa  307  3e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>