More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1336 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  56.29 
 
 		 660 aa  720    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1336  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 657 aa  1329    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280744  normal  0.428976 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1856  CheA signal transduction histidine kinase  59.31 
 
 		 658 aa  778    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  55.49 
 
 		 1010 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  36.66 
 
 		 660 aa  426  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  37.02 
 
 		 677 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 666 aa  412  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 675 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 681 aa  404  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 697 aa  396  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 673 aa  395  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 691 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  36.87 
 
 		 685 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 679 aa  395  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 713 aa  395  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 666 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  35.56 
 
 		 692 aa  392  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 653 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 671 aa  380  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  33.73 
 
 		 670 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  33.63 
 
 		 670 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 656 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  34.27 
 
 		 667 aa  379  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  34.02 
 
 		 672 aa  378  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 655 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  33.73 
 
 		 667 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  33.58 
 
 		 667 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 671 aa  369  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  33.73 
 
 		 667 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 673 aa  369  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 649 aa  371  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 729 aa  371  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 696 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 674 aa  360  6e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0942  CheA signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 670 aa  359  8e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 957 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 695 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 701 aa  357  3.9999999999999996e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 920 aa  353  5e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 694 aa  352  8.999999999999999e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  32.75 
 
 		 702 aa  352  1e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 919 aa  352  2e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 		 919 aa  351  2e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 664 aa  349  8e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  31.3 
 
 		 769 aa  341  2.9999999999999998e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  31.21 
 
 		 769 aa  339  8e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  31.55 
 
 		 769 aa  339  9.999999999999999e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 677 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  34.86 
 
 		 887 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 687 aa  334  3e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2888  CheA signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 671 aa  334  3e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 702 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0361  CheW-like protein  42.41 
 
 		 897 aa  327  3e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30104  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 688 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1771  CheA signal transduction histidine kinases  32.25 
 
 		 727 aa  326  9e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 686 aa  326  9e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 719 aa  325  1e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0059  CheA signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 675 aa  325  2e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.850831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 654 aa  324  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  30.76 
 
 		 639 aa  323  6e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  31.88 
 
 		 700 aa  323  9.000000000000001e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 671 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 		 770 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 		 1031 aa  320  5e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  32.36 
 
 		 703 aa  317  4e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  29.99 
 
 		 733 aa  317  5e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  41.34 
 
 		 806 aa  316  8e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0984  chemotaxis sensor histidine kinase  41.19 
 
 		 598 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  31.54 
 
 		 720 aa  313  4.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  30.96 
 
 		 681 aa  313  5.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  30.6 
 
 		 669 aa  313  5.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 686 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  31.08 
 
 		 705 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 652 aa  310  5e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 		 954 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0974  CheA signal transduction histidine kinases  31.5 
 
 		 691 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  32.65 
 
 		 654 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  32.4 
 
 		 654 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 690 aa  307  5.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  32.55 
 
 		 654 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  32.4 
 
 		 652 aa  306  6e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 701 aa  306  6e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  32.4 
 
 		 654 aa  306  7e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  32.4 
 
 		 654 aa  306  7e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  32.4 
 
 		 654 aa  306  7e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  32.4 
 
 		 652 aa  306  7e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 654 aa  306  8.000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 		 695 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  40.87 
 
 		 1089 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  30.07 
 
 		 714 aa  305  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 694 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  30.01 
 
 		 715 aa  303  6.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 699 aa  303  6.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  31.39 
 
 		 655 aa  303  8.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4461  CheA signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 662 aa  303  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  31.63 
 
 		 674 aa  303  9e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0958  CheA signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 		 1286 aa  303  9e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  30.55 
 
 		 662 aa  302  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2222  chemotaxis protein CheA  30.47 
 
 		 692 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 		 598 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>