More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0974 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0974  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 
691 aa  1380    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1989  ATP-binding region ATPase domain protein  44.01 
 
 
678 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
699 aa  379  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
702 aa  374  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  35.04 
 
 
700 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 
694 aa  366  1e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
682 aa  365  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
709 aa  364  4e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  33.14 
 
 
655 aa  363  5.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
759 aa  363  8e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
707 aa  362  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
747 aa  362  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  34.06 
 
 
681 aa  359  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 
671 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  32.86 
 
 
669 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  32.79 
 
 
684 aa  357  5e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  33.24 
 
 
662 aa  357  5e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
694 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  33.48 
 
 
669 aa  354  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  33.48 
 
 
669 aa  354  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
697 aa  353  4e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  32.51 
 
 
669 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  32.51 
 
 
669 aa  353  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  32.36 
 
 
669 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  32.41 
 
 
717 aa  351  2e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00032  chemotaxis protein CheA  32.19 
 
 
669 aa  351  3e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  32.41 
 
 
717 aa  350  5e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 
671 aa  349  1e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 
871 aa  349  1e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
695 aa  349  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  32.84 
 
 
652 aa  348  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
666 aa  348  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3467  CheA signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 
751 aa  348  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.124475 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
739 aa  347  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  32.69 
 
 
654 aa  348  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  32.05 
 
 
727 aa  348  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1794  CheA signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
686 aa  348  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
674 aa  346  7e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
660 aa  345  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  31.49 
 
 
715 aa  345  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
688 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  33.38 
 
 
681 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
677 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4676  CheA signal transduction histidine kinases  31.46 
 
 
686 aa  343  5e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1852  CheA signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
664 aa  343  5.999999999999999e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.445859 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0578  chemotaxis histidine kinase  34.72 
 
 
714 aa  343  5.999999999999999e-93  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  32.67 
 
 
705 aa  343  8e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
684 aa  342  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 
673 aa  342  2e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  31.99 
 
 
720 aa  341  2.9999999999999998e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0145  CheA signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 
688 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7839  CheA signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
691 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  31.4 
 
 
708 aa  339  9e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
702 aa  339  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  33.02 
 
 
741 aa  337  5e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3206  CheA signal transduction histidine kinases  31.49 
 
 
711 aa  337  5.999999999999999e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136095  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  43.38 
 
 
730 aa  336  7.999999999999999e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1100  CheA signal transduction histidine kinases  30.78 
 
 
686 aa  335  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.748454  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
684 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3689  CheA signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 
671 aa  332  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.296916  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  33.53 
 
 
692 aa  332  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
713 aa  332  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2436  chemotaxis histidine protein kinase, CheA1  30.64 
 
 
686 aa  331  3e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.916157  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0279  CheA signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 
751 aa  331  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597552  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  31.4 
 
 
703 aa  330  4e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0298  CheA signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 
763 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265941  normal  0.326442 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
675 aa  330  6e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
686 aa  330  8e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
709 aa  329  8e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  33.28 
 
 
686 aa  327  3e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
673 aa  327  5e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
679 aa  326  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
681 aa  325  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  33.14 
 
 
701 aa  325  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 
701 aa  325  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  32.77 
 
 
704 aa  325  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 
679 aa  324  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
691 aa  323  5e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2315  CheA signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
665 aa  323  5e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
702 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  32.56 
 
 
677 aa  322  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1379  CheA signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
658 aa  321  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0851844  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 
652 aa  320  5e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 
724 aa  319  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  32.3 
 
 
733 aa  318  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
732 aa  317  3e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  44.13 
 
 
784 aa  316  8e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1599  CheA signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 
722 aa  316  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
696 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2574  CheA signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 
661 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.12503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
712 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  30.76 
 
 
720 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.73 
 
 
693 aa  313  9e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1370  CheA signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 
687 aa  313  9e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0938961  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3299  CheA signal transduction histidine kinase  42.97 
 
 
671 aa  312  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 
682 aa  311  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
729 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2841  CheA signal transduction histidine kinases  30.06 
 
 
748 aa  311  2.9999999999999997e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.922689  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  36.81 
 
 
806 aa  311  2.9999999999999997e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  37.75 
 
 
654 aa  311  4e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>