More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0630 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  55.2 
 
 
682 aa  706    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  57.8 
 
 
698 aa  753    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  59 
 
 
701 aa  783    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  59.17 
 
 
712 aa  784    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  59.09 
 
 
702 aa  766    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  52.71 
 
 
709 aa  701    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  55.48 
 
 
697 aa  710    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  57.6 
 
 
696 aa  744    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  55.26 
 
 
686 aa  714    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  56.39 
 
 
709 aa  751    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  53.21 
 
 
724 aa  680    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
702 aa  1416    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  55.26 
 
 
707 aa  725    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  50.14 
 
 
708 aa  674    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  55.16 
 
 
708 aa  716    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  47.73 
 
 
693 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  45.88 
 
 
694 aa  585  1e-166  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  43.91 
 
 
652 aa  558  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1379  CheA signal transduction histidine kinase  44.25 
 
 
658 aa  554  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0851844  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  45.01 
 
 
681 aa  549  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  44.38 
 
 
679 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0145  CheA signal transduction histidine kinase  43.92 
 
 
688 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7839  CheA signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 
691 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4676  CheA signal transduction histidine kinases  41.51 
 
 
686 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4316  Chemotaxis protein histidine kinase  42.02 
 
 
685 aa  504  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 
732 aa  494  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 
679 aa  485  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  38.29 
 
 
720 aa  478  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  39.53 
 
 
741 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  38.94 
 
 
700 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0578  chemotaxis histidine kinase  37.94 
 
 
714 aa  468  9.999999999999999e-131  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  37.2 
 
 
733 aa  463  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  39.39 
 
 
705 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
699 aa  457  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 
654 aa  458  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1317  CheA signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
733 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.460815  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
739 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0332  CheA signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 
756 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 
677 aa  425  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
682 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  37.6 
 
 
720 aa  425  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 
688 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0619  CheA signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
794 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0110186 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
686 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1209  CheA signal transduction histidine kinases  35.91 
 
 
697 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 
707 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 
747 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
695 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
675 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 
759 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
702 aa  398  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  36.54 
 
 
669 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
684 aa  391  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  35.95 
 
 
684 aa  389  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5775  CheA signal transduction histidine kinase  52.86 
 
 
714 aa  388  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  35.84 
 
 
662 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4815  CheA signal transduction histidine kinase  53.12 
 
 
702 aa  389  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391755 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2478  CheA signal transduction histidine kinase  52.45 
 
 
660 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54146  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
666 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2574  CheA signal transduction histidine kinase  52.17 
 
 
661 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.12503  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  34.7 
 
 
681 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 
666 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  34.26 
 
 
677 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
660 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  38.45 
 
 
806 aa  375  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  35.16 
 
 
717 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  34.81 
 
 
715 aa  375  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 
696 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 
684 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
681 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  34.23 
 
 
758 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  35.32 
 
 
717 aa  369  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
697 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
691 aa  369  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  35 
 
 
727 aa  363  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0279  CheA signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
751 aa  362  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597552  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  33.19 
 
 
667 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  34.14 
 
 
685 aa  358  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
713 aa  356  7.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  33.29 
 
 
667 aa  355  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
655 aa  355  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  33.29 
 
 
667 aa  355  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 
701 aa  353  8.999999999999999e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  31.47 
 
 
670 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3206  CheA signal transduction histidine kinases  32.7 
 
 
711 aa  352  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136095  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  33.89 
 
 
654 aa  350  5e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  32.56 
 
 
670 aa  349  9e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0974  CheA signal transduction histidine kinases  33.38 
 
 
691 aa  348  2e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  34.08 
 
 
704 aa  348  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  33.38 
 
 
714 aa  347  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1584  chemotaxis histidine protein kinase  48.56 
 
 
654 aa  347  3e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.678464  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
695 aa  348  3e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  34 
 
 
652 aa  347  4e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0236  CheA signal transduction histidine kinases  48.3 
 
 
654 aa  347  5e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  33.19 
 
 
672 aa  346  8e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
679 aa  345  1e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  32.51 
 
 
667 aa  343  7e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
653 aa  343  8e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
741 aa  343  8e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
656 aa  342  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>