More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1416 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  58.28 
 
 
701 aa  725    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  54.52 
 
 
708 aa  687    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  56.45 
 
 
724 aa  734    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  57.14 
 
 
698 aa  728    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  57.64 
 
 
696 aa  728    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  56.18 
 
 
709 aa  718    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  58.01 
 
 
702 aa  715    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  56.69 
 
 
709 aa  747    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  57.57 
 
 
712 aa  730    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  88.48 
 
 
682 aa  1182    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  55.9 
 
 
697 aa  687    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  55.7 
 
 
702 aa  714    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  56.37 
 
 
707 aa  718    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  55.73 
 
 
708 aa  741    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
686 aa  1378    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  49.85 
 
 
693 aa  617  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  47.61 
 
 
694 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  46.41 
 
 
679 aa  549  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  44.62 
 
 
652 aa  547  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4676  CheA signal transduction histidine kinases  43.62 
 
 
686 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4316  Chemotaxis protein histidine kinase  45.49 
 
 
685 aa  538  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  45.39 
 
 
679 aa  535  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7839  CheA signal transduction histidine kinase  43.9 
 
 
691 aa  529  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0145  CheA signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 
688 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  43.02 
 
 
681 aa  524  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  40.7 
 
 
741 aa  497  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0578  chemotaxis histidine kinase  40.19 
 
 
714 aa  494  9.999999999999999e-139  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  42.84 
 
 
654 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  39.11 
 
 
733 aa  485  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  41.99 
 
 
700 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  40.54 
 
 
720 aa  478  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  41.01 
 
 
732 aa  478  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1317  CheA signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 
733 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.460815  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1533  CheA signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 
750 aa  461  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037058 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  39.97 
 
 
720 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1209  CheA signal transduction histidine kinases  38.94 
 
 
697 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
699 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  40.51 
 
 
705 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
739 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
677 aa  422  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 
707 aa  422  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 
688 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 
682 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 
686 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  36.35 
 
 
694 aa  414  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  38.47 
 
 
662 aa  415  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  37.03 
 
 
747 aa  413  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 
695 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
759 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0332  CheA signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
756 aa  408  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  38.52 
 
 
681 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  38.18 
 
 
669 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
654 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1379  CheA signal transduction histidine kinase  55.04 
 
 
658 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0851844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2574  CheA signal transduction histidine kinase  55.04 
 
 
661 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.12503  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2478  CheA signal transduction histidine kinase  55.31 
 
 
660 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54146  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  38.32 
 
 
654 aa  402  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  38.03 
 
 
654 aa  399  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  38.03 
 
 
652 aa  398  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  37.88 
 
 
654 aa  398  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  38.03 
 
 
654 aa  399  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  38.03 
 
 
654 aa  399  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  38.17 
 
 
654 aa  398  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  38.17 
 
 
652 aa  399  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  36.57 
 
 
717 aa  393  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5775  CheA signal transduction histidine kinase  54.91 
 
 
714 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4815  CheA signal transduction histidine kinase  54.91 
 
 
702 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391755 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 
684 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  36.33 
 
 
727 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  36.51 
 
 
703 aa  393  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
675 aa  392  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0330  CheA signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
758 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.362553  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  36.57 
 
 
717 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0298  CheA signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
763 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265941  normal  0.326442 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  37.5 
 
 
669 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0236  CheA signal transduction histidine kinases  51.7 
 
 
654 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0279  CheA signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
751 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597552  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1584  chemotaxis histidine protein kinase  51.96 
 
 
654 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.678464  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 
666 aa  379  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  40.04 
 
 
806 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  35.51 
 
 
715 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  37.19 
 
 
758 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  35.71 
 
 
729 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2093  CheA signal transduction histidine kinases  35.52 
 
 
736 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.768244 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1881  CheA signal transduction histidine kinases  35.52 
 
 
736 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.254979 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 
681 aa  371  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0619  CheA signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 
794 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0110186 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  36.73 
 
 
704 aa  369  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
702 aa  369  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3467  CheA signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 
751 aa  369  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.124475 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
666 aa  364  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3206  CheA signal transduction histidine kinases  33.67 
 
 
711 aa  361  3e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136095  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0810  CheA signal transduction histidine kinases  35.16 
 
 
715 aa  360  4e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  33.86 
 
 
677 aa  356  5.999999999999999e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  49.36 
 
 
674 aa  355  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2841  CheA signal transduction histidine kinases  34.92 
 
 
748 aa  355  2e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.922689  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1540  chemotaxis protein CheA  48.37 
 
 
672 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0565086  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 
660 aa  352  1e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  48.21 
 
 
669 aa  349  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  48.21 
 
 
669 aa  349  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>