More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2143 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  100 
 
 		 684 aa  1368    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  48.73 
 
 		 747 aa  602  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0279  CheA signal transduction histidine kinase  45.79 
 
 		 751 aa  573  1.0000000000000001e-162  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597552  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  43.52 
 
 		 759 aa  549  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2708  CheA signal transduction histidine kinase  47.43 
 
 		 735 aa  549  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972076  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  43.43 
 
 		 703 aa  527  1e-148  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 		 694 aa  522  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1794  CheA signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 686 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 		 684 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2436  chemotaxis histidine protein kinase, CheA1  43.66 
 
 		 686 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.916157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  43.93 
 
 		 682 aa  504  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1852  CheA signal transduction histidine kinase  43.29 
 
 		 664 aa  499  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.445859 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  43.66 
 
 		 684 aa  499  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  41.08 
 
 		 720 aa  501  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4077  Chemotaxis protein histidine kinase  43.44 
 
 		 662 aa  499  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 		 686 aa  500  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1100  CheA signal transduction histidine kinases  43.28 
 
 		 686 aa  498  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.748454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3206  CheA signal transduction histidine kinases  41.58 
 
 		 711 aa  497  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 707 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 		 677 aa  489  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00032  chemotaxis protein CheA  42.32 
 
 		 669 aa  487  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 		 688 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3467  CheA signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 751 aa  478  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.124475 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2841  CheA signal transduction histidine kinases  40.14 
 
 		 748 aa  474  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.922689  normal  0.260415 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  43.51 
 
 		 654 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  43.51 
 
 		 654 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  43.51 
 
 		 654 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  43.51 
 
 		 652 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  43.82 
 
 		 654 aa  468  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  43.66 
 
 		 652 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  43.93 
 
 		 654 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  43.51 
 
 		 654 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  43.66 
 
 		 654 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  42.31 
 
 		 655 aa  464  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  42.22 
 
 		 674 aa  463  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 695 aa  465  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  41.7 
 
 		 662 aa  465  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  41.39 
 
 		 681 aa  462  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  41.97 
 
 		 669 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  41.21 
 
 		 669 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  42.07 
 
 		 669 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  42.07 
 
 		 669 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  41.77 
 
 		 669 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  42.07 
 
 		 669 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  41.13 
 
 		 717 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1446  CheA signal transduction histidine kinase  61.27 
 
 		 760 aa  450  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 699 aa  451  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1540  chemotaxis protein CheA  41.32 
 
 		 672 aa  451  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0565086  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  39.55 
 
 		 727 aa  445  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  40.59 
 
 		 717 aa  445  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0298  CheA signal transduction histidine kinase  58.36 
 
 		 763 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265941  normal  0.326442 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  43.76 
 
 		 806 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 		 702 aa  436  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 709 aa  428  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2859  chemotaxis protein CheA  55.5 
 
 		 767 aa  422  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3182  chemotaxis protein CheA  56.32 
 
 		 749 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.671944  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3116  chemotaxis protein CheA  55.5 
 
 		 767 aa  422  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3435  chemotaxis protein CheA  55.5 
 
 		 767 aa  422  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1684  chemotaxis protein CheA  55.5 
 
 		 767 aa  422  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.41407  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 		 654 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4156  CheA signal transduction histidine kinase  54.35 
 
 		 684 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.847585  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2974  CheA signal transduction histidine kinase  55.91 
 
 		 772 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131554 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0238  CheA signal transduction histidine kinase  55.38 
 
 		 750 aa  415  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3855  chemotaxis protein CheA  55.79 
 
 		 762 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0077  chemotaxis protein CheA  55.79 
 
 		 765 aa  415  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3936  chemotaxis protein CheA  55.79 
 
 		 765 aa  415  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0182  CheA signal transduction histidine kinase  55.38 
 
 		 743 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0119  CheA Signal transduction histidine Kinases(STHK)  55.64 
 
 		 766 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 		 712 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2851  CheA signal transduction histidine kinases  55.38 
 
 		 756 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3815  CheA signal transduction histidine kinase  55.64 
 
 		 766 aa  415  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0169  CheA signal transduction histidine kinases  55.38 
 
 		 744 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454346  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0256  CheA signal transduction histidine kinases  55.38 
 
 		 756 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1408  chemotaxis sensor histidine kinase transcription regulator protein  54.74 
 
 		 726 aa  412  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.146245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  37.21 
 
 		 700 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4160  CheA signal transduction histidine kinase  54.36 
 
 		 724 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 694 aa  410  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3358  CheA signal transduction histidine kinase  55.26 
 
 		 749 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.701672  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4048  CheA signal transduction histidine kinase  54.36 
 
 		 724 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0165  CheA signal transduction histidine kinase  55.24 
 
 		 761 aa  411  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.690811 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24340  Chemotaxis sensory histidine protein kinase; CheA  53.18 
 
 		 697 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4316  Chemotaxis protein histidine kinase  38.39 
 
 		 685 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  53.12 
 
 		 715 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3689  CheA signal transduction histidine kinase  51.01 
 
 		 671 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.296916  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  52.36 
 
 		 691 aa  401  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  34.64 
 
 		 733 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 696 aa  399  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  51.32 
 
 		 784 aa  396  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 679 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 698 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  36.07 
 
 		 720 aa  398  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1599  CheA signal transduction histidine kinase  52.36 
 
 		 722 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0585  chemotaxis protein histidine kinase  52.2 
 
 		 719 aa  397  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.648466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  52.84 
 
 		 625 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  35.22 
 
 		 741 aa  395  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 679 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  50.77 
 
 		 783 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 708 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3064  CheA signal transduction histidine kinase  51.83 
 
 		 710 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3790  CheA signal transduction histidine kinases  52.36 
 
 		 710 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>