More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4316 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7839  CheA signal transduction histidine kinase  50.15 
 
 		 691 aa  645    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  62.65 
 
 		 652 aa  824    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  56.09 
 
 		 693 aa  705    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4676  CheA signal transduction histidine kinases  51.09 
 
 		 686 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0145  CheA signal transduction histidine kinase  51.08 
 
 		 688 aa  652    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  72.1 
 
 		 679 aa  934    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4316  Chemotaxis protein histidine kinase  100 
 
 		 685 aa  1381    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  50.8 
 
 		 681 aa  649    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  73.88 
 
 		 679 aa  945    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4815  CheA signal transduction histidine kinase  52.55 
 
 		 702 aa  628  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391755 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  46.81 
 
 		 654 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1584  chemotaxis histidine protein kinase  46.55 
 
 		 654 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.678464  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  46.02 
 
 		 686 aa  542  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0236  CheA signal transduction histidine kinases  46.7 
 
 		 654 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  45.52 
 
 		 709 aa  543  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  43.7 
 
 		 707 aa  541  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  45.03 
 
 		 701 aa  535  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  46.48 
 
 		 702 aa  537  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  45.58 
 
 		 682 aa  537  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  44.56 
 
 		 696 aa  526  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  44.18 
 
 		 698 aa  528  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  43.38 
 
 		 712 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 		 724 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 		 709 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 		 708 aa  503  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 		 694 aa  504  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  43.36 
 
 		 708 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1379  CheA signal transduction histidine kinase  44.77 
 
 		 658 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0851844  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  43.43 
 
 		 697 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  42.43 
 
 		 702 aa  494  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2574  CheA signal transduction histidine kinase  45.66 
 
 		 661 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.12503  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2478  CheA signal transduction histidine kinase  45.18 
 
 		 660 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54146  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5775  CheA signal transduction histidine kinase  63.45 
 
 		 714 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  40.06 
 
 		 700 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  38.71 
 
 		 741 aa  465  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 732 aa  451  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  37.39 
 
 		 733 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  36.67 
 
 		 720 aa  445  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  37.3 
 
 		 705 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  37.61 
 
 		 703 aa  426  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0578  chemotaxis histidine kinase  35.87 
 
 		 714 aa  419  9.999999999999999e-116  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 694 aa  412  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 686 aa  412  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1317  CheA signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 733 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.460815  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1533  CheA signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 750 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037058 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  35.73 
 
 		 720 aa  403  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1209  CheA signal transduction histidine kinases  37.54 
 
 		 697 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 707 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 695 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 		 682 aa  399  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 677 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  37.61 
 
 		 684 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 688 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 699 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0332  CheA signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 756 aa  391  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 702 aa  392  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 		 681 aa  387  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  36.35 
 
 		 747 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00032  chemotaxis protein CheA  36.72 
 
 		 669 aa  379  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 739 aa  378  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 759 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1852  CheA signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 664 aa  375  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.445859 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  39.56 
 
 		 806 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 675 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  36.48 
 
 		 669 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3206  CheA signal transduction histidine kinases  37.67 
 
 		 711 aa  371  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 696 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  36.44 
 
 		 662 aa  371  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  35.83 
 
 		 674 aa  369  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 		 684 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 684 aa  369  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 701 aa  368  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 954 aa  365  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  35.64 
 
 		 669 aa  364  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  34.89 
 
 		 681 aa  363  4e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  36.23 
 
 		 654 aa  363  8e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 654 aa  362  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  35.76 
 
 		 654 aa  362  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  35.61 
 
 		 654 aa  362  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2841  CheA signal transduction histidine kinases  35.99 
 
 		 748 aa  362  1e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.922689  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 		 666 aa  362  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  36.23 
 
 		 652 aa  362  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  36.09 
 
 		 654 aa  362  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  35.61 
 
 		 654 aa  362  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  35.5 
 
 		 669 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  34.37 
 
 		 758 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  36.53 
 
 		 715 aa  361  2e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  35.61 
 
 		 654 aa  362  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  34.98 
 
 		 655 aa  362  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  35.61 
 
 		 652 aa  362  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  35.5 
 
 		 669 aa  361  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  35.5 
 
 		 669 aa  361  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  35.35 
 
 		 669 aa  360  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3467  CheA signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 751 aa  358  1.9999999999999998e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.124475 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 655 aa  358  2.9999999999999997e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3689  CheA signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 671 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.296916  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 691 aa  357  5e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 713 aa  356  5.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0330  CheA signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 758 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.362553  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 673 aa  353  7e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>