More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2940 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  64.9 
 
 
701 aa  835    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  63.09 
 
 
698 aa  824    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
708 aa  1432    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  55.31 
 
 
686 aa  682    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  63.23 
 
 
696 aa  819    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  52.11 
 
 
724 aa  670    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  94.26 
 
 
697 aa  1286    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  63.9 
 
 
702 aa  825    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  51.98 
 
 
709 aa  702    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  58.74 
 
 
709 aa  770    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  62.61 
 
 
712 aa  850    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  55.3 
 
 
702 aa  707    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  53.31 
 
 
682 aa  663    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  59.79 
 
 
707 aa  796    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  50.92 
 
 
708 aa  673    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  49.02 
 
 
693 aa  597  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  45.74 
 
 
694 aa  589  1e-167  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1379  CheA signal transduction histidine kinase  45.98 
 
 
658 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0851844  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  44.32 
 
 
652 aa  538  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  43.06 
 
 
681 aa  524  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  44.37 
 
 
679 aa  524  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  43.62 
 
 
679 aa  521  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4316  Chemotaxis protein histidine kinase  43.81 
 
 
685 aa  509  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7839  CheA signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 
691 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0145  CheA signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 
688 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  39.28 
 
 
720 aa  501  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4676  CheA signal transduction histidine kinases  41.07 
 
 
686 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  39.65 
 
 
741 aa  494  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  41.23 
 
 
700 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  41.62 
 
 
654 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  39 
 
 
732 aa  475  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 
699 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  41.03 
 
 
705 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  37.66 
 
 
733 aa  464  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1317  CheA signal transduction histidine kinase  39.28 
 
 
733 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.460815  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0578  chemotaxis histidine kinase  37.86 
 
 
714 aa  451  1e-125  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 
707 aa  445  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1533  CheA signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
750 aa  436  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037058 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  38.08 
 
 
720 aa  432  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0619  CheA signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
794 aa  430  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0110186 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0332  CheA signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 
756 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
682 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1209  CheA signal transduction histidine kinases  37.34 
 
 
697 aa  429  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
686 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  36 
 
 
739 aa  415  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 
688 aa  415  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  36.85 
 
 
684 aa  415  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 
675 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 
677 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.41 
 
 
691 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 
684 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
747 aa  405  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
695 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2574  CheA signal transduction histidine kinase  56.22 
 
 
661 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.12503  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2478  CheA signal transduction histidine kinase  55.35 
 
 
660 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54146  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  40.22 
 
 
806 aa  395  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  36.8 
 
 
681 aa  392  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
681 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  35.25 
 
 
703 aa  389  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
702 aa  386  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  36.47 
 
 
662 aa  388  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  37.13 
 
 
715 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  35.75 
 
 
669 aa  385  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  36.53 
 
 
654 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 
654 aa  381  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  36.53 
 
 
654 aa  381  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  36.53 
 
 
654 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  36.55 
 
 
654 aa  380  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  36.53 
 
 
652 aa  381  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
666 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  35.96 
 
 
652 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
759 aa  382  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  36.39 
 
 
654 aa  381  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  36.53 
 
 
654 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  37.66 
 
 
669 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  37.48 
 
 
669 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  36.82 
 
 
669 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  37.34 
 
 
669 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  37.48 
 
 
669 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  36.59 
 
 
717 aa  372  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4815  CheA signal transduction histidine kinase  52.22 
 
 
702 aa  371  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391755 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5775  CheA signal transduction histidine kinase  52.22 
 
 
714 aa  372  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  35.67 
 
 
758 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  35.96 
 
 
727 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  36.35 
 
 
717 aa  368  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  34.75 
 
 
685 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3206  CheA signal transduction histidine kinases  35.85 
 
 
711 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136095  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0279  CheA signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
751 aa  361  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597552  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
691 aa  361  3e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1446  CheA signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
760 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2708  CheA signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 
735 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972076  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  32.16 
 
 
677 aa  358  2.9999999999999997e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3467  CheA signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
751 aa  355  1e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.124475 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1584  chemotaxis histidine protein kinase  50.53 
 
 
654 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.678464  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0236  CheA signal transduction histidine kinases  50.27 
 
 
654 aa  354  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
679 aa  354  4e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 
696 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 
660 aa  351  2e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2093  CheA signal transduction histidine kinases  33.56 
 
 
736 aa  349  9e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.768244 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0766  CheA signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
802 aa  349  1e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>