More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0901 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1317  CheA signal transduction histidine kinase  52.12 
 
 		 733 aa  678    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.460815  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  52.17 
 
 		 700 aa  674    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  51.45 
 
 		 705 aa  668    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  55.99 
 
 		 741 aa  768    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 		 720 aa  1456    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  52.93 
 
 		 733 aa  736    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  72.18 
 
 		 732 aa  1013    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  48.23 
 
 		 739 aa  630  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1533  CheA signal transduction histidine kinase  45.86 
 
 		 750 aa  589  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037058 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0332  CheA signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 756 aa  571  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 709 aa  514  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  42.55 
 
 		 707 aa  513  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 		 712 aa  499  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  41.29 
 
 		 709 aa  498  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 724 aa  492  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  40.79 
 
 		 701 aa  488  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 698 aa  486  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 		 702 aa  488  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.88 
 
 		 693 aa  485  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4676  CheA signal transduction histidine kinases  38.43 
 
 		 686 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  40.12 
 
 		 696 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  40.22 
 
 		 708 aa  485  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 		 697 aa  482  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  39.28 
 
 		 708 aa  479  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 		 682 aa  472  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  38.69 
 
 		 681 aa  468  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 686 aa  465  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 		 702 aa  456  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7839  CheA signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 691 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0145  CheA signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 688 aa  452  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 652 aa  443  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 686 aa  445  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  36.66 
 
 		 688 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 694 aa  432  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 679 aa  428  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 		 677 aa  429  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 695 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 699 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 702 aa  421  1e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 679 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4316  Chemotaxis protein histidine kinase  35 
 
 		 685 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 694 aa  390  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 654 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  35.26 
 
 		 720 aa  392  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 682 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 707 aa  385  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0578  chemotaxis histidine kinase  32.88 
 
 		 714 aa  377  1e-103  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  35.41 
 
 		 758 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3467  CheA signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 751 aa  371  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.124475 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  37.08 
 
 		 681 aa  369  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  35.59 
 
 		 684 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  39.89 
 
 		 806 aa  364  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  35.54 
 
 		 703 aa  363  5.0000000000000005e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 691 aa  363  7.0000000000000005e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2841  CheA signal transduction histidine kinases  34.13 
 
 		 748 aa  362  1e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.922689  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 		 747 aa  362  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 724 aa  361  3e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 		 724 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  36.3 
 
 		 669 aa  355  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  34.88 
 
 		 704 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 684 aa  352  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 759 aa  352  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3317  CheA signal transduction histidine kinase  45.43 
 
 		 536 aa  351  3e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  34.21 
 
 		 717 aa  350  6e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3206  CheA signal transduction histidine kinases  33.66 
 
 		 711 aa  347  5e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  46.43 
 
 		 673 aa  347  6e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 681 aa  347  6e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  33.61 
 
 		 717 aa  346  1e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 660 aa  344  4e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  33.79 
 
 		 727 aa  343  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  33.29 
 
 		 927 aa  343  8e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4815  CheA signal transduction histidine kinase  48.53 
 
 		 702 aa  343  9e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391755 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5775  CheA signal transduction histidine kinase  48.53 
 
 		 714 aa  343  9e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 713 aa  341  2.9999999999999998e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2478  CheA signal transduction histidine kinase  47.15 
 
 		 660 aa  339  9e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54146  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  32.97 
 
 		 685 aa  339  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 		 674 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2574  CheA signal transduction histidine kinase  46.61 
 
 		 661 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.12503  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1379  CheA signal transduction histidine kinase  46.34 
 
 		 658 aa  336  7e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0851844  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 701 aa  336  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 696 aa  333  6e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2176  CheA signal transduction histidine kinases  49.1 
 
 		 709 aa  332  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1794  CheA signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 686 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0585  chemotaxis protein histidine kinase  48.46 
 
 		 719 aa  330  8e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.648466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2436  chemotaxis histidine protein kinase, CheA1  32.6 
 
 		 686 aa  330  8e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.916157  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0603  CheA signal transduction histidine kinase  46.72 
 
 		 551 aa  328  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 656 aa  328  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1209  CheA signal transduction histidine kinases  32.38 
 
 		 697 aa  327  3e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0637  CheA signal transduction histidine kinase  46.84 
 
 		 551 aa  326  7e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1989  ATP-binding region ATPase domain protein  31.61 
 
 		 678 aa  327  7e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0628  CheA signal transduction histidine kinase  46.84 
 
 		 553 aa  326  7e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0156  chemotaxis protein CheA  47.04 
 
 		 747 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.93752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  47.17 
 
 		 732 aa  325  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  30.95 
 
 		 723 aa  325  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3064  CheA signal transduction histidine kinase  47.68 
 
 		 710 aa  324  3e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  47.58 
 
 		 625 aa  325  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  30.51 
 
 		 677 aa  324  3e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3790  CheA signal transduction histidine kinases  47.68 
 
 		 710 aa  324  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  30.62 
 
 		 667 aa  324  4e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  30.62 
 
 		 667 aa  324  4e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>