More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0332 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0332  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 756 aa  1510    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  46.05 
 
 		 741 aa  591  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  45.14 
 
 		 720 aa  591  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  46.16 
 
 		 700 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  44.31 
 
 		 733 aa  586  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  46.58 
 
 		 732 aa  577  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1533  CheA signal transduction histidine kinase  45.59 
 
 		 750 aa  570  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037058 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1317  CheA signal transduction histidine kinase  47.78 
 
 		 733 aa  569  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.460815  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  44.95 
 
 		 705 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  42.88 
 
 		 739 aa  520  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 		 709 aa  487  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  41.19 
 
 		 708 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 		 724 aa  458  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 694 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.45 
 
 		 693 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 		 702 aa  441  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 		 708 aa  436  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 712 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 		 709 aa  436  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  38.02 
 
 		 707 aa  436  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 698 aa  430  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 697 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  39.28 
 
 		 702 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  37.57 
 
 		 701 aa  423  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 652 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 686 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 696 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 		 699 aa  418  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 682 aa  414  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0145  CheA signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 		 688 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  37.34 
 
 		 681 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4676  CheA signal transduction histidine kinases  34.29 
 
 		 686 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 679 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7839  CheA signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 691 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 688 aa  389  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 702 aa  384  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  36.38 
 
 		 654 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  37.41 
 
 		 720 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 686 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 677 aa  365  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  34.63 
 
 		 681 aa  364  4e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 707 aa  363  9e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0578  chemotaxis histidine kinase  33.24 
 
 		 714 aa  362  2e-98  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 724 aa  360  7e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 695 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 682 aa  357  5.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1852  CheA signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 		 664 aa  355  2e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.445859 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 728 aa  352  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 675 aa  350  4e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 691 aa  348  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 684 aa  348  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  35.39 
 
 		 717 aa  344  4e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  33.65 
 
 		 669 aa  343  7e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  33.61 
 
 		 704 aa  343  7e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  34.36 
 
 		 662 aa  342  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 713 aa  339  9.999999999999999e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  36.96 
 
 		 806 aa  339  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  30.83 
 
 		 677 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 681 aa  335  2e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  46.41 
 
 		 625 aa  333  8e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  33.92 
 
 		 727 aa  332  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 697 aa  332  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  46.21 
 
 		 639 aa  331  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  34.97 
 
 		 717 aa  331  3e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3317  CheA signal transduction histidine kinase  47.61 
 
 		 536 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 747 aa  329  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 694 aa  327  7e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  45.77 
 
 		 679 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 673 aa  325  2e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0279  CheA signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 751 aa  325  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597552  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2841  CheA signal transduction histidine kinases  32.95 
 
 		 748 aa  325  3e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.922689  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1209  CheA signal transduction histidine kinases  33.33 
 
 		 697 aa  324  4e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4316  Chemotaxis protein histidine kinase  45.5 
 
 		 685 aa  324  5e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  30.23 
 
 		 692 aa  323  7e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 660 aa  323  7e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  30.54 
 
 		 667 aa  321  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  30.54 
 
 		 667 aa  321  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  31.57 
 
 		 715 aa  321  3.9999999999999996e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 696 aa  321  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  33.75 
 
 		 655 aa  320  7.999999999999999e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 759 aa  319  9e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3467  CheA signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 751 aa  319  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.124475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4156  CheA signal transduction histidine kinase  45.26 
 
 		 684 aa  319  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.847585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  30.48 
 
 		 667 aa  318  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1989  ATP-binding region ATPase domain protein  30.36 
 
 		 678 aa  318  2e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 701 aa  317  4e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0647  CheA signal transduction histidine kinase  48.83 
 
 		 558 aa  317  5e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  43.46 
 
 		 669 aa  317  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  43.46 
 
 		 669 aa  317  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0628  CheA signal transduction histidine kinase  48.16 
 
 		 553 aa  317  8e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2574  CheA signal transduction histidine kinase  47.68 
 
 		 661 aa  316  8e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.12503  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0637  CheA signal transduction histidine kinase  48.16 
 
 		 551 aa  316  9e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  30.08 
 
 		 670 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2478  CheA signal transduction histidine kinase  47.68 
 
 		 660 aa  316  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54146  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4378  CheA signal transduction histidine kinase  45.71 
 
 		 725 aa  316  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  41.69 
 
 		 674 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0603  CheA signal transduction histidine kinase  47.88 
 
 		 551 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  29.85 
 
 		 670 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2708  CheA signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 735 aa  315  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972076  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  43.21 
 
 		 669 aa  315  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>