More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1282 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  54.07 
 
 		 682 aa  669    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  65.19 
 
 		 701 aa  840    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  52.56 
 
 		 724 aa  671    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  94.26 
 
 		 708 aa  1282    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  63.31 
 
 		 712 aa  861    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  64.61 
 
 		 702 aa  828    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  53.23 
 
 		 709 aa  701    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 697 aa  1400    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  64.23 
 
 		 696 aa  834    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  63.82 
 
 		 698 aa  838    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  55.9 
 
 		 686 aa  686    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  59.54 
 
 		 709 aa  778    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  55.48 
 
 		 702 aa  706    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  60.39 
 
 		 707 aa  802    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  50.78 
 
 		 708 aa  667    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  46.29 
 
 		 694 aa  595  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  48.96 
 
 		 693 aa  595  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1379  CheA signal transduction histidine kinase  46.97 
 
 		 658 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0851844  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  46.14 
 
 		 652 aa  539  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  43.58 
 
 		 681 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  45.6 
 
 		 679 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  44.56 
 
 		 679 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7839  CheA signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 		 691 aa  505  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4316  Chemotaxis protein histidine kinase  44.1 
 
 		 685 aa  499  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0145  CheA signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 		 688 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  40.25 
 
 		 720 aa  502  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 		 732 aa  495  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  41.78 
 
 		 700 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  40.19 
 
 		 741 aa  493  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4676  CheA signal transduction histidine kinases  40.58 
 
 		 686 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  41.01 
 
 		 654 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 		 699 aa  473  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  41.99 
 
 		 705 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0578  chemotaxis histidine kinase  38.78 
 
 		 714 aa  468  9.999999999999999e-131  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  38.02 
 
 		 733 aa  464  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1317  CheA signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 		 733 aa  456  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.460815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 707 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1533  CheA signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 750 aa  439  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037058 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 682 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  38.26 
 
 		 720 aa  428  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 686 aa  426  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1209  CheA signal transduction histidine kinases  37.62 
 
 		 697 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 739 aa  420  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 688 aa  420  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0332  CheA signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 756 aa  422  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 677 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 684 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 		 684 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 695 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.94 
 
 		 691 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 675 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  41.61 
 
 		 806 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2574  CheA signal transduction histidine kinase  57.25 
 
 		 661 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.12503  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 		 747 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2478  CheA signal transduction histidine kinase  56.42 
 
 		 660 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54146  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 702 aa  397  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  37.61 
 
 		 715 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  35.53 
 
 		 703 aa  393  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  36.61 
 
 		 662 aa  392  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  36.38 
 
 		 681 aa  391  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  35.73 
 
 		 669 aa  388  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 759 aa  385  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  36.75 
 
 		 685 aa  381  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0330  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 758 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.362553  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0619  CheA signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 794 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0110186 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 666 aa  375  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5775  CheA signal transduction histidine kinase  53 
 
 		 714 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  35.57 
 
 		 669 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  36.19 
 
 		 717 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4815  CheA signal transduction histidine kinase  53 
 
 		 702 aa  372  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391755 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  35.8 
 
 		 758 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3206  CheA signal transduction histidine kinases  35.71 
 
 		 711 aa  366  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  34.79 
 
 		 729 aa  364  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  35.72 
 
 		 717 aa  364  3e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  35.2 
 
 		 727 aa  362  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  31.97 
 
 		 677 aa  360  5e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 691 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2708  CheA signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 735 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972076  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1446  CheA signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 760 aa  357  5e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  33.2 
 
 		 751 aa  356  6.999999999999999e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 719 aa  356  7.999999999999999e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 701 aa  355  1e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0279  CheA signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 751 aa  355  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597552  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  34.72 
 
 		 723 aa  355  2e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 696 aa  354  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 660 aa  353  5e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3467  CheA signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 751 aa  352  1e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.124475 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  31.68 
 
 		 927 aa  351  3e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0766  CheA signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 		 802 aa  349  1e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 673 aa  348  2e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1584  chemotaxis histidine protein kinase  49.09 
 
 		 654 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.678464  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0236  CheA signal transduction histidine kinases  48.83 
 
 		 654 aa  345  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0810  CheA signal transduction histidine kinases  33.42 
 
 		 715 aa  343  8e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 697 aa  342  1e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  45.15 
 
 		 681 aa  342  1e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  44.55 
 
 		 783 aa  340  4e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  48.19 
 
 		 639 aa  340  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  47.93 
 
 		 625 aa  340  7e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  47.8 
 
 		 784 aa  339  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3815  CheA signal transduction histidine kinase  46.77 
 
 		 766 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>