More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1209 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1209  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 
697 aa  1386    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0619  CheA signal transduction histidine kinase  48.21 
 
 
794 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0110186 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 
709 aa  445  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 
686 aa  444  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  38.45 
 
 
682 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  39.28 
 
 
708 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  40.84 
 
 
724 aa  438  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  39.05 
 
 
701 aa  434  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 
698 aa  425  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  39.03 
 
 
702 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 
694 aa  424  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  37.52 
 
 
712 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 
709 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 
696 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 
708 aa  413  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 
697 aa  411  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 
652 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
702 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  36.82 
 
 
707 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7839  CheA signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 
691 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0145  CheA signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 
688 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  38.01 
 
 
681 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4676  CheA signal transduction histidine kinases  37.03 
 
 
686 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1379  CheA signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 
658 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0851844  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4316  Chemotaxis protein histidine kinase  37.01 
 
 
685 aa  388  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2574  CheA signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 
661 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.12503  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  37.03 
 
 
679 aa  382  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 
679 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.15 
 
 
693 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4815  CheA signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 
702 aa  365  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391755 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 
666 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
654 aa  357  5e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
675 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  34.18 
 
 
700 aa  348  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  32.93 
 
 
720 aa  345  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  33.85 
 
 
705 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  33.75 
 
 
720 aa  342  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  33.7 
 
 
741 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0578  chemotaxis histidine kinase  30.52 
 
 
714 aa  336  1e-90  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  33.19 
 
 
733 aa  335  2e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00032  chemotaxis protein CheA  34.83 
 
 
669 aa  334  4e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
694 aa  330  4e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
713 aa  326  7e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  31.18 
 
 
677 aa  325  1e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  31.08 
 
 
692 aa  325  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
688 aa  323  5e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
699 aa  323  7e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 
686 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2478  CheA signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 
660 aa  321  3e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54146  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
677 aa  321  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
724 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
666 aa  318  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
724 aa  318  3e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  34.14 
 
 
655 aa  315  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
707 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1852  CheA signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
664 aa  313  5.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.445859 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 
691 aa  311  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0974  CheA signal transduction histidine kinases  32.1 
 
 
691 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  33.47 
 
 
715 aa  310  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 
671 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  33.29 
 
 
681 aa  310  6.999999999999999e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
732 aa  309  9e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
728 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 
702 aa  309  1.0000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  31.79 
 
 
704 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 
695 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  33.25 
 
 
758 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  33.66 
 
 
717 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
696 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  33.19 
 
 
654 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
682 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  33.14 
 
 
669 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  33.19 
 
 
652 aa  304  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
654 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  33.19 
 
 
654 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  33.19 
 
 
654 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  33.19 
 
 
654 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  33.19 
 
 
654 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5775  CheA signal transduction histidine kinase  46.97 
 
 
714 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  33.05 
 
 
654 aa  303  8.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  33.29 
 
 
662 aa  301  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1584  chemotaxis histidine protein kinase  43.64 
 
 
654 aa  300  6e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.678464  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0236  CheA signal transduction histidine kinases  43.38 
 
 
654 aa  299  9e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0810  CheA signal transduction histidine kinases  29.39 
 
 
715 aa  298  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  33.01 
 
 
717 aa  298  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  32.92 
 
 
727 aa  296  8e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
686 aa  296  9e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  35.1 
 
 
806 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 
655 aa  292  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3206  CheA signal transduction histidine kinases  32.1 
 
 
711 aa  293  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136095  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 
730 aa  293  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  33.05 
 
 
703 aa  293  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3317  CheA signal transduction histidine kinase  42.71 
 
 
536 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 
660 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  43.85 
 
 
681 aa  291  2e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  42.24 
 
 
691 aa  290  9e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  28.92 
 
 
667 aa  289  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0755  CheA signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
688 aa  289  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0128541 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1989  ATP-binding region ATPase domain protein  31.44 
 
 
678 aa  289  1e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 
739 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>