More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0786 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  88.79 
 
 		 700 aa  1248    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  100 
 
 		 705 aa  1421    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  50.13 
 
 		 741 aa  666    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  52.14 
 
 		 720 aa  681    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  50.41 
 
 		 732 aa  647    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  50.21 
 
 		 733 aa  664    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1317  CheA signal transduction histidine kinase  49.19 
 
 		 733 aa  625  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.460815  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  48.27 
 
 		 739 aa  587  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0332  CheA signal transduction histidine kinase  44.61 
 
 		 756 aa  551  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  43.32 
 
 		 707 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 709 aa  483  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  42.21 
 
 		 709 aa  483  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  42 
 
 		 701 aa  474  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4676  CheA signal transduction histidine kinases  40 
 
 		 686 aa  475  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 686 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 		 652 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 		 688 aa  463  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  40.63 
 
 		 698 aa  463  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  42.27 
 
 		 697 aa  465  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7839  CheA signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 691 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  39.2 
 
 		 681 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 708 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0145  CheA signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 688 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  40.48 
 
 		 693 aa  457  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 		 724 aa  458  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 		 694 aa  456  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 696 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 702 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 		 695 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 		 682 aa  452  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  39.54 
 
 		 708 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 712 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 		 702 aa  447  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  39.73 
 
 		 686 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1379  CheA signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 658 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0851844  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 699 aa  438  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2478  CheA signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 		 660 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2574  CheA signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 661 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.12503  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 		 677 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 679 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4316  Chemotaxis protein histidine kinase  38.51 
 
 		 685 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  38.4 
 
 		 720 aa  434  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4815  CheA signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 702 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391755 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 		 679 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  39.03 
 
 		 654 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  38.59 
 
 		 703 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 702 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 681 aa  397  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 675 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  38.94 
 
 		 806 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  37.94 
 
 		 681 aa  393  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 694 aa  392  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1852  CheA signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 		 664 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.445859 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 666 aa  389  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  35.82 
 
 		 684 aa  389  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 713 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0578  chemotaxis histidine kinase  34.31 
 
 		 714 aa  385  1e-105  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 707 aa  382  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  39.48 
 
 		 674 aa  382  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  37.03 
 
 		 669 aa  382  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0279  CheA signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 751 aa  378  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597552  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 682 aa  378  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  35.23 
 
 		 758 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  38.41 
 
 		 662 aa  379  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 729 aa  375  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  36.78 
 
 		 655 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 691 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  36.99 
 
 		 654 aa  372  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 654 aa  372  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 724 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 666 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  37.36 
 
 		 654 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  36.99 
 
 		 654 aa  372  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  36.85 
 
 		 654 aa  371  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  36.99 
 
 		 654 aa  372  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  36.85 
 
 		 654 aa  371  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 747 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  37.39 
 
 		 652 aa  368  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  36.78 
 
 		 685 aa  368  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  37.18 
 
 		 652 aa  368  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 		 697 aa  369  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 701 aa  369  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1540  chemotaxis protein CheA  38.29 
 
 		 672 aa  368  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0565086  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  36.38 
 
 		 717 aa  365  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  35.08 
 
 		 715 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  33.38 
 
 		 692 aa  362  9e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 759 aa  361  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 684 aa  360  7e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3317  CheA signal transduction histidine kinase  48.96 
 
 		 536 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  34.22 
 
 		 702 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2708  CheA signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 735 aa  357  3.9999999999999996e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972076  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  36.17 
 
 		 717 aa  356  7.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  32.85 
 
 		 667 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  36.29 
 
 		 727 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  32.95 
 
 		 667 aa  354  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  32.95 
 
 		 667 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  33.96 
 
 		 672 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  32.65 
 
 		 670 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0330  CheA signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 758 aa  353  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.362553  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 671 aa  352  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>