More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3146 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2222  chemotaxis protein CheA  66.28 
 
 
692 aa  907    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  60.47 
 
 
701 aa  816    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  67.29 
 
 
690 aa  917    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0755  CheA signal transduction histidine kinase  70.12 
 
 
688 aa  939    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0128541 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  70.61 
 
 
686 aa  948    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
671 aa  1336    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1729  CheA signal transduction histidine kinases  52.55 
 
 
693 aa  657    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2736  CheA signal transduction histidine kinase  44.61 
 
 
687 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2828  CheA signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 
685 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2920  CheA signal transduction histidine kinase  43.42 
 
 
685 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.038084  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
681 aa  412  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
666 aa  389  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  35.8 
 
 
685 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  36.12 
 
 
785 aa  388  1e-106  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
666 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
675 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
691 aa  383  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
696 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 
655 aa  375  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
697 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
660 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  34.02 
 
 
677 aa  373  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
702 aa  375  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  47.81 
 
 
610 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
701 aa  372  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 
673 aa  372  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  32.18 
 
 
801 aa  366  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  47.81 
 
 
770 aa  369  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  35.97 
 
 
692 aa  365  1e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  47.21 
 
 
803 aa  362  1e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 
671 aa  361  3e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  44.52 
 
 
770 aa  360  3e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  43.16 
 
 
601 aa  360  3e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  45.3 
 
 
606 aa  360  4e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  44.87 
 
 
598 aa  360  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 
694 aa  360  5e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
673 aa  359  7e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  44.71 
 
 
769 aa  358  1.9999999999999998e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  45.52 
 
 
769 aa  358  2.9999999999999997e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  45.19 
 
 
769 aa  357  2.9999999999999997e-97  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  47.42 
 
 
607 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  34.06 
 
 
702 aa  354  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  44.84 
 
 
729 aa  352  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
699 aa  350  4e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  45.16 
 
 
770 aa  350  5e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  43.99 
 
 
774 aa  348  2e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  44.25 
 
 
783 aa  348  2e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
682 aa  346  8e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 
604 aa  346  8e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  34.39 
 
 
625 aa  345  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
679 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 
603 aa  343  4e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  32.77 
 
 
700 aa  343  7e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  33.48 
 
 
705 aa  343  7e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1408  chemotaxis protein histidine kinase, CheA-like  33.89 
 
 
846 aa  342  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0658876  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
687 aa  341  2e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  31.81 
 
 
670 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
686 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
653 aa  339  9e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  34.08 
 
 
654 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  34.08 
 
 
654 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
654 aa  337  5e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  34.08 
 
 
652 aa  337  5e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  34.08 
 
 
654 aa  337  5e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  33.93 
 
 
654 aa  336  7e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  34.08 
 
 
652 aa  336  7e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3299  CheA signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
671 aa  335  1e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  33.93 
 
 
654 aa  335  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 
558 aa  334  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  33.83 
 
 
654 aa  334  3e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  33.28 
 
 
674 aa  334  3e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
719 aa  333  7.000000000000001e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
684 aa  332  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  32.36 
 
 
669 aa  331  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  33.08 
 
 
639 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
684 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
682 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  32.9 
 
 
669 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  32.9 
 
 
669 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  32.9 
 
 
669 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  32.65 
 
 
662 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
656 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
954 aa  327  5e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  32.75 
 
 
669 aa  327  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  32.75 
 
 
669 aa  327  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
679 aa  326  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
713 aa  325  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  44.04 
 
 
1089 aa  325  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  31.14 
 
 
723 aa  324  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  44.91 
 
 
674 aa  324  3e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 
715 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  32.69 
 
 
655 aa  321  3e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
652 aa  320  6e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  31.51 
 
 
801 aa  320  6e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0766  CheA signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
802 aa  319  1e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  32.45 
 
 
887 aa  318  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1336  CheA signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
657 aa  318  3e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280744  normal  0.428976 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  42.6 
 
 
724 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1989  ATP-binding region ATPase domain protein  31.8 
 
 
678 aa  317  7e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 
671 aa  316  8e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>