More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1530 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  63.2 
 
 
783 aa  976    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  63.59 
 
 
769 aa  1007    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  62.58 
 
 
770 aa  993    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 
803 aa  1613    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  64.59 
 
 
774 aa  1009    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  64.09 
 
 
769 aa  1013    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  63.84 
 
 
769 aa  1009    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  64.33 
 
 
770 aa  991    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  64.18 
 
 
785 aa  1001    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  44.32 
 
 
604 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  45.67 
 
 
601 aa  513  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  43.63 
 
 
598 aa  505  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 
650 aa  456  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  53.21 
 
 
770 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 
719 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  37.05 
 
 
754 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 
675 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  39.26 
 
 
685 aa  448  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 
687 aa  439  1e-121  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 
701 aa  422  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
696 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  52.94 
 
 
606 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  36.51 
 
 
667 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  36.51 
 
 
667 aa  413  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  51.94 
 
 
610 aa  411  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  35.94 
 
 
670 aa  411  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  49.5 
 
 
603 aa  412  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  36.87 
 
 
667 aa  412  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  39.24 
 
 
766 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  35.79 
 
 
670 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
673 aa  408  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  34.86 
 
 
672 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
655 aa  405  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  36.5 
 
 
801 aa  405  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  38.3 
 
 
910 aa  405  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  52.71 
 
 
607 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 
656 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
653 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  35.41 
 
 
667 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
690 aa  395  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
686 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
878 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  35.57 
 
 
639 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  45.52 
 
 
681 aa  387  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.99 
 
 
942 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  47.69 
 
 
677 aa  388  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 
679 aa  386  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
701 aa  385  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  50.63 
 
 
729 aa  385  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 
935 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
652 aa  381  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  42.23 
 
 
751 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 
934 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 
921 aa  382  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0755  CheA signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
688 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0128541 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  47.51 
 
 
714 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  42.19 
 
 
723 aa  378  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 
741 aa  376  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
921 aa  375  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 
759 aa  375  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  47.31 
 
 
660 aa  371  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  47.84 
 
 
733 aa  372  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  44.32 
 
 
767 aa  372  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  36.39 
 
 
934 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  43.89 
 
 
691 aa  372  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  42 
 
 
736 aa  372  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  46.85 
 
 
744 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 
796 aa  372  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  44.6 
 
 
745 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  46.25 
 
 
744 aa  372  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 
747 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  46.72 
 
 
746 aa  369  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  47.46 
 
 
691 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  46.63 
 
 
733 aa  369  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  41.14 
 
 
760 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  47.21 
 
 
709 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  42.07 
 
 
806 aa  365  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  35.6 
 
 
625 aa  365  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  45.91 
 
 
747 aa  365  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  45.91 
 
 
746 aa  365  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  45.91 
 
 
738 aa  364  3e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  46.7 
 
 
762 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  46.29 
 
 
739 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  46.36 
 
 
954 aa  363  8e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  34.11 
 
 
704 aa  363  8e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3207  chemotaxis protein  40.78 
 
 
758 aa  363  9e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  44.27 
 
 
734 aa  363  9e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  44.66 
 
 
713 aa  362  1e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  45.78 
 
 
747 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  46.45 
 
 
762 aa  362  1e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  46 
 
 
785 aa  362  1e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  45.78 
 
 
743 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  45.52 
 
 
737 aa  362  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3299  CheA signal transduction histidine kinase  34 
 
 
671 aa  362  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  47.21 
 
 
671 aa  362  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  45.78 
 
 
747 aa  361  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 
741 aa  360  5e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  46.74 
 
 
666 aa  360  8e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  41.39 
 
 
702 aa  359  9.999999999999999e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  44.66 
 
 
697 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>