More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2284 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2818  CheA signal transduction histidine kinases  83.61 
 
 		 602 aa  706    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 		 702 aa  1410    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  43.13 
 
 		 681 aa  531  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  42.88 
 
 		 685 aa  511  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  41.5 
 
 		 695 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 		 696 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  38.8 
 
 		 701 aa  477  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 		 660 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 666 aa  433  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 		 655 aa  429  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 713 aa  429  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 666 aa  429  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1856  CheA signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 658 aa  426  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 675 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 691 aa  425  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 729 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  37.19 
 
 		 692 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 671 aa  421  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  37.12 
 
 		 677 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 671 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 		 673 aa  400  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 679 aa  399  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 697 aa  394  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 674 aa  394  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 		 673 aa  394  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 653 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2920  CheA signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 685 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.038084  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2828  CheA signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 685 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 656 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  43.05 
 
 		 770 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  32.1 
 
 		 801 aa  375  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  34.41 
 
 		 670 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  35.04 
 
 		 667 aa  375  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  35.04 
 
 		 667 aa  375  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  33.9 
 
 		 660 aa  374  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  33.9 
 
 		 670 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  35.04 
 
 		 667 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  42.49 
 
 		 783 aa  369  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  33.61 
 
 		 672 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  43.78 
 
 		 785 aa  365  2e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 687 aa  365  2e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  33.1 
 
 		 667 aa  364  4e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2736  CheA signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 687 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  45.24 
 
 		 610 aa  360  5e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  44.01 
 
 		 774 aa  359  9e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  41.39 
 
 		 803 aa  359  9.999999999999999e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  42.86 
 
 		 769 aa  358  1.9999999999999998e-97  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  41.12 
 
 		 769 aa  358  1.9999999999999998e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  42.36 
 
 		 769 aa  357  5e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  43.11 
 
 		 770 aa  356  1e-96  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 671 aa  354  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  46.02 
 
 		 607 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  43 
 
 		 770 aa  354  2.9999999999999997e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 652 aa  353  4e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  45.9 
 
 		 606 aa  353  8e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  43.96 
 
 		 603 aa  350  4e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 		 604 aa  349  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3299  CheA signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 671 aa  348  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  44.62 
 
 		 601 aa  348  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 701 aa  348  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 690 aa  347  4e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  44.16 
 
 		 598 aa  345  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 686 aa  342  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  31.97 
 
 		 702 aa  341  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0059  CheA signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 675 aa  342  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.850831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0766  CheA signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 802 aa  341  2e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0755  CheA signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 688 aa  340  4e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0128541 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 919 aa  340  5e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1336  CheA signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 657 aa  340  5.9999999999999996e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280744  normal  0.428976 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2222  chemotaxis protein CheA  31 
 
 		 692 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 724 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  32.58 
 
 		 704 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 664 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 702 aa  337  5.999999999999999e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 919 aa  336  9e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 699 aa  335  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  28.92 
 
 		 1104 aa  333  6e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 920 aa  331  2e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 649 aa  331  3e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 		 558 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 957 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 1031 aa  328  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 694 aa  328  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  32.05 
 
 		 674 aa  325  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  41.12 
 
 		 762 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 		 759 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  31.42 
 
 		 662 aa  322  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  41.62 
 
 		 760 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  42.46 
 
 		 691 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  39.85 
 
 		 1089 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00412  probable two-component sensor (CheA)  31.87 
 
 		 674 aa  321  3e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  41.37 
 
 		 762 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  40.86 
 
 		 736 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 		 741 aa  320  6e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  40.82 
 
 		 806 aa  320  7.999999999999999e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 		 697 aa  319  9e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  37.97 
 
 		 701 aa  318  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3207  chemotaxis protein  40.86 
 
 		 758 aa  318  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  40.45 
 
 		 754 aa  319  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  31.53 
 
 		 669 aa  318  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>