More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3576 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 
1104 aa  2236    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0990  CheA signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
1085 aa  547  1e-154  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
1063 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 
916 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
878 aa  412  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.95 
 
 
942 aa  412  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  34.74 
 
 
916 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
921 aa  406  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 
937 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 
937 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
935 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  35.78 
 
 
888 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
770 aa  399  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
934 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3678  ATP-binding region, ATPase-like  34.73 
 
 
925 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0781071  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
911 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  38.81 
 
 
801 aa  398  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 
921 aa  398  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  35.03 
 
 
934 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  34.99 
 
 
922 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  38.51 
 
 
766 aa  392  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  34.54 
 
 
927 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  35.09 
 
 
910 aa  380  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  34.72 
 
 
927 aa  382  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 
760 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  38.9 
 
 
742 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5007  CheA signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 
792 aa  366  1e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0579075  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  43.49 
 
 
785 aa  365  3e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 
728 aa  362  3e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  42.13 
 
 
783 aa  361  4e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  32.76 
 
 
928 aa  356  1e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  38.46 
 
 
769 aa  353  7e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  41.42 
 
 
770 aa  353  1e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  38.09 
 
 
769 aa  352  2e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  35.51 
 
 
770 aa  352  2e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  38.09 
 
 
769 aa  349  2e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0314  CheA signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 
822 aa  347  5e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181126  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  39.05 
 
 
870 aa  347  8e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 
691 aa  346  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30990  chemotaxis protein histidine kinase-like protein  39.64 
 
 
819 aa  347  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  36.43 
 
 
803 aa  346  1e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  34.38 
 
 
774 aa  345  2e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  29.99 
 
 
697 aa  343  1e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
702 aa  337  5.999999999999999e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
796 aa  336  2e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  30.68 
 
 
702 aa  335  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
719 aa  335  3e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  28.68 
 
 
702 aa  333  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
650 aa  332  2e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 
724 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 
701 aa  331  5.0000000000000004e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  30.17 
 
 
720 aa  328  4.0000000000000003e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  30.67 
 
 
704 aa  327  6e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  30.38 
 
 
685 aa  325  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
604 aa  325  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 
696 aa  324  5e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
603 aa  324  7e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  39.78 
 
 
767 aa  323  8e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  39.41 
 
 
601 aa  320  7e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
733 aa  320  9e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  39.64 
 
 
610 aa  317  7e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  31.34 
 
 
669 aa  317  9e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  31.74 
 
 
681 aa  317  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 
743 aa  315  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  40.41 
 
 
607 aa  313  9e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 
606 aa  313  9e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 
598 aa  313  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 
737 aa  313  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 
739 aa  312  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 
691 aa  312  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 
679 aa  310  8e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  40.65 
 
 
753 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  40.65 
 
 
748 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 
747 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 
745 aa  309  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 
746 aa  308  3e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 
747 aa  308  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 
747 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 
738 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  30.62 
 
 
758 aa  307  6e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.49 
 
 
754 aa  307  8.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  35.3 
 
 
754 aa  307  8.000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  38.84 
 
 
734 aa  307  9.000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 
741 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  39.01 
 
 
714 aa  306  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 
919 aa  306  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
687 aa  304  7.000000000000001e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  38.9 
 
 
759 aa  304  7.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 
709 aa  304  7.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 
690 aa  303  8.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  38.83 
 
 
760 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  38.8 
 
 
748 aa  303  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
713 aa  303  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  38.8 
 
 
758 aa  303  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  38.83 
 
 
762 aa  302  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  38.6 
 
 
762 aa  302  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  38.39 
 
 
744 aa  301  4e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  38.62 
 
 
744 aa  300  8e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 
681 aa  300  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 
614 aa  300  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>