More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0521 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  59.63 
 
 		 927 aa  808    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  53.89 
 
 		 916 aa  730    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  53.21 
 
 		 878 aa  894    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  55.71 
 
 		 888 aa  939    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  100 
 
 		 942 aa  1888    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  60.09 
 
 		 937 aa  812    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  55.08 
 
 		 934 aa  941    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  54.18 
 
 		 934 aa  954    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  54.88 
 
 		 922 aa  951    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  45.67 
 
 		 910 aa  730    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3678  ATP-binding region, ATPase-like  59.06 
 
 		 925 aa  796    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0781071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  60 
 
 		 911 aa  811    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  59.77 
 
 		 927 aa  811    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  55.13 
 
 		 937 aa  950    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  48.96 
 
 		 928 aa  786    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  53.08 
 
 		 921 aa  730    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  53.29 
 
 		 921 aa  728    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  53.89 
 
 		 916 aa  731    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  42.93 
 
 		 766 aa  570  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 796 aa  500  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  37.59 
 
 		 801 aa  499  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  41.17 
 
 		 1063 aa  492  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  39.95 
 
 		 870 aa  488  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 728 aa  486  1e-136  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5007  CheA signal transduction histidine kinase  44.8 
 
 		 792 aa  462  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0579075  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0990  CheA signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 1085 aa  456  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  47.1 
 
 		 742 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0314  CheA signal transduction histidine kinase  44.54 
 
 		 822 aa  438  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181126  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 		 760 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30990  chemotaxis protein histidine kinase-like protein  44.48 
 
 		 819 aa  430  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  38.73 
 
 		 769 aa  427  1e-118  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  38.54 
 
 		 769 aa  425  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  37.82 
 
 		 769 aa  425  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  39.91 
 
 		 770 aa  415  1e-114  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  38.88 
 
 		 770 aa  412  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  35.61 
 
 		 1104 aa  412  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  38.59 
 
 		 770 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  37.27 
 
 		 803 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  37.54 
 
 		 785 aa  396  1e-109  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 		 598 aa  395  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  36.7 
 
 		 783 aa  392  1e-107  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  38.67 
 
 		 774 aa  389  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 687 aa  377  1e-103  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 607 aa  379  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 604 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 603 aa  369  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 697 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  35.06 
 
 		 601 aa  365  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 650 aa  359  9.999999999999999e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  35.27 
 
 		 639 aa  357  5.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  32.4 
 
 		 667 aa  342  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  32.4 
 
 		 667 aa  342  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 671 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  34.44 
 
 		 685 aa  339  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 653 aa  339  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  32.05 
 
 		 667 aa  336  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  35.94 
 
 		 674 aa  335  3e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0065  CheA signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 812 aa  335  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  32.13 
 
 		 677 aa  335  3e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  31.35 
 
 		 692 aa  334  6e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  31.94 
 
 		 670 aa  333  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 654 aa  333  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 656 aa  332  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 664 aa  329  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  41.29 
 
 		 666 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 		 660 aa  328  4.0000000000000003e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  31.44 
 
 		 702 aa  327  8.000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 673 aa  327  8.000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  31.07 
 
 		 672 aa  326  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  34.46 
 
 		 669 aa  325  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 686 aa  325  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  31.38 
 
 		 667 aa  325  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 694 aa  323  7e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  30.78 
 
 		 670 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  34.06 
 
 		 681 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 696 aa  322  3e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 655 aa  320  7.999999999999999e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  34.31 
 
 		 654 aa  319  1e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 654 aa  320  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  34.31 
 
 		 654 aa  319  1e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  34.31 
 
 		 654 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  34.21 
 
 		 662 aa  318  3e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  34.16 
 
 		 654 aa  318  3e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  33.97 
 
 		 654 aa  318  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  34.02 
 
 		 654 aa  318  4e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  33.24 
 
 		 652 aa  317  5e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  34.16 
 
 		 652 aa  317  5e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  33.28 
 
 		 669 aa  317  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  33.28 
 
 		 669 aa  317  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  33.28 
 
 		 669 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  33.14 
 
 		 669 aa  315  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  42.53 
 
 		 666 aa  315  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  33.33 
 
 		 669 aa  314  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  40.75 
 
 		 691 aa  313  7.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  32.66 
 
 		 887 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1740  CheA signal transduction histidine kinases  31.69 
 
 		 807 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0607216 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 686 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 695 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  34.74 
 
 		 655 aa  309  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 		 681 aa  308  3e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>