More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4247 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  57.1 
 
 		 916 aa  996    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  77.63 
 
 		 927 aa  1398    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  78.82 
 
 		 937 aa  1439    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  79.39 
 
 		 888 aa  1438    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  59.18 
 
 		 942 aa  806    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  56.98 
 
 		 935 aa  1013    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  77.2 
 
 		 927 aa  1385    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  81.74 
 
 		 934 aa  1471    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  96.58 
 
 		 934 aa  1783    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 		 922 aa  1855    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3678  ATP-binding region, ATPase-like  81.23 
 
 		 925 aa  1451    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0781071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  78.6 
 
 		 911 aa  1427    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  57.39 
 
 		 916 aa  994    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  43.83 
 
 		 910 aa  707    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  49.52 
 
 		 928 aa  803    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  59.13 
 
 		 878 aa  1047    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  57.2 
 
 		 921 aa  996    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  56.84 
 
 		 921 aa  993    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  79.64 
 
 		 937 aa  1451    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  39.6 
 
 		 766 aa  538  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 796 aa  488  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  35.46 
 
 		 801 aa  483  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 1063 aa  474  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 728 aa  464  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  46.13 
 
 		 742 aa  464  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30990  chemotaxis protein histidine kinase-like protein  44.96 
 
 		 819 aa  443  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5007  CheA signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 		 792 aa  440  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0579075  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0314  CheA signal transduction histidine kinase  44.46 
 
 		 822 aa  439  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181126  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  42.83 
 
 		 760 aa  436  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  45.19 
 
 		 870 aa  412  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  39.4 
 
 		 769 aa  402  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  39.75 
 
 		 769 aa  402  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  39.63 
 
 		 769 aa  401  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  34.99 
 
 		 1104 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  37.09 
 
 		 770 aa  389  1e-106  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  36.52 
 
 		 770 aa  387  1e-106  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  37.54 
 
 		 803 aa  381  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  37.89 
 
 		 785 aa  382  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  37.85 
 
 		 774 aa  379  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  36.84 
 
 		 783 aa  377  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 598 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  36.01 
 
 		 610 aa  373  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 		 687 aa  370  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 607 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  35.58 
 
 		 601 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 770 aa  366  1e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 719 aa  360  8e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 650 aa  359  9.999999999999999e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 604 aa  352  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 660 aa  352  2e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 666 aa  351  4e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 677 aa  337  7.999999999999999e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  34.35 
 
 		 625 aa  334  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  34.98 
 
 		 639 aa  334  5e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 686 aa  331  4e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 696 aa  330  7e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  32.8 
 
 		 685 aa  328  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 656 aa  323  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 653 aa  321  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  39.62 
 
 		 806 aa  322  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 694 aa  321  3.9999999999999996e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  30.03 
 
 		 667 aa  320  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  30.16 
 
 		 672 aa  319  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 654 aa  319  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 		 759 aa  319  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  40.5 
 
 		 751 aa  319  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  33.78 
 
 		 674 aa  318  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  31 
 
 		 667 aa  318  4e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  44.04 
 
 		 733 aa  318  4e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  32.34 
 
 		 704 aa  317  4e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 		 745 aa  317  6e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0065  CheA signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 812 aa  317  9e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 		 673 aa  315  1.9999999999999998e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  33.69 
 
 		 654 aa  316  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  30.24 
 
 		 667 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 		 715 aa  315  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  30.24 
 
 		 667 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  42.19 
 
 		 754 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  37.83 
 
 		 736 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  33.54 
 
 		 652 aa  314  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  33.69 
 
 		 654 aa  314  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  33.54 
 
 		 654 aa  314  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  33.54 
 
 		 654 aa  314  4.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  33.54 
 
 		 654 aa  314  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  33.54 
 
 		 652 aa  314  4.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 		 681 aa  314  4.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 654 aa  314  5.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  33.38 
 
 		 654 aa  313  7.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 871 aa  313  9e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 652 aa  313  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  32.95 
 
 		 669 aa  312  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 664 aa  312  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  38.41 
 
 		 760 aa  312  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 		 733 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 		 743 aa  311  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 		 747 aa  311  4e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  34.18 
 
 		 669 aa  311  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  34.18 
 
 		 669 aa  311  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 		 747 aa  310  8e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  34.18 
 
 		 669 aa  310  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>