More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0520 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  58.72 
 
 
935 aa  1025    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  58.13 
 
 
921 aa  1001    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  77.27 
 
 
927 aa  1382    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  76.19 
 
 
937 aa  1396    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  100 
 
 
888 aa  1788    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  58.07 
 
 
916 aa  994    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  57.74 
 
 
916 aa  988    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  55.76 
 
 
942 aa  948    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  77.53 
 
 
934 aa  1414    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  77.26 
 
 
934 aa  1429    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  78.38 
 
 
922 aa  1431    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  62.09 
 
 
878 aa  1060    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3678  ATP-binding region, ATPase-like  77.55 
 
 
925 aa  1395    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0781071  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  87.05 
 
 
911 aa  1551    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  57.62 
 
 
921 aa  992    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  76.41 
 
 
937 aa  1402    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  49.74 
 
 
928 aa  798    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  44.9 
 
 
910 aa  722    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  76.91 
 
 
927 aa  1378    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  42.73 
 
 
766 aa  570  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 
796 aa  503  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
1063 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  36.62 
 
 
801 aa  495  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  39.97 
 
 
728 aa  473  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  46.69 
 
 
742 aa  462  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5007  CheA signal transduction histidine kinase  44.85 
 
 
792 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0579075  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 
760 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0314  CheA signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 
822 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181126  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  41.17 
 
 
769 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  40.51 
 
 
769 aa  419  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  40.68 
 
 
769 aa  416  1e-114  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  46.97 
 
 
870 aa  416  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  37.23 
 
 
770 aa  405  1e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  35.78 
 
 
1104 aa  402  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  35.68 
 
 
783 aa  392  1e-107  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0065  CheA signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
812 aa  392  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  36.02 
 
 
774 aa  387  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
598 aa  389  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  38.44 
 
 
785 aa  388  1e-106  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 
770 aa  385  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 
607 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1740  CheA signal transduction histidine kinases  32.48 
 
 
807 aa  382  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0607216 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  37.68 
 
 
770 aa  381  1e-104  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  36.46 
 
 
610 aa  378  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  37.25 
 
 
803 aa  377  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
666 aa  373  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 
604 aa  372  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  36.76 
 
 
601 aa  372  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
687 aa  367  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 
603 aa  369  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
652 aa  363  7.0000000000000005e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
650 aa  361  3e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
730 aa  345  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  35.66 
 
 
639 aa  342  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  35.93 
 
 
625 aa  342  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
871 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
688 aa  336  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  41.98 
 
 
745 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 
660 aa  329  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 
654 aa  329  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
679 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  41.63 
 
 
806 aa  327  7e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  42.65 
 
 
606 aa  324  5e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  43.77 
 
 
691 aa  324  6e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  33.43 
 
 
674 aa  323  8e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  39.87 
 
 
736 aa  323  9.000000000000001e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 
686 aa  321  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 
715 aa  321  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  41.72 
 
 
677 aa  320  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  30 
 
 
653 aa  319  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  38 
 
 
759 aa  319  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 
697 aa  318  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  30.95 
 
 
667 aa  318  3e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  41.65 
 
 
747 aa  318  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  30.95 
 
 
667 aa  318  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 
691 aa  318  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  40.41 
 
 
681 aa  318  4e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  40.61 
 
 
767 aa  317  4e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
746 aa  317  5e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 
656 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 
746 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 
747 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 
673 aa  316  1.9999999999999998e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  39.81 
 
 
754 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 
701 aa  315  2.9999999999999996e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  42.89 
 
 
737 aa  314  4.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  42.63 
 
 
743 aa  314  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  42.63 
 
 
747 aa  314  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
690 aa  314  5.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  42.63 
 
 
747 aa  313  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
664 aa  313  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  33.44 
 
 
654 aa  313  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  37.55 
 
 
760 aa  313  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  40.63 
 
 
723 aa  311  2e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 
733 aa  312  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 
709 aa  311  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 
738 aa  312  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  33.28 
 
 
654 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 
739 aa  311  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  33.28 
 
 
652 aa  311  4e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>