More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4035 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  56.91 
 
 		 937 aa  988    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  59.1 
 
 		 888 aa  1004    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  41.13 
 
 		 910 aa  636    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  52.19 
 
 		 942 aa  729    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  57.02 
 
 		 927 aa  977    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  57.76 
 
 		 934 aa  997    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  57.48 
 
 		 934 aa  1001    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  57.65 
 
 		 922 aa  998    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 921 aa  1816    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3678  ATP-binding region, ATPase-like  57.42 
 
 		 925 aa  976    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0781071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  59.86 
 
 		 911 aa  806    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  57.13 
 
 		 927 aa  979    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  68.87 
 
 		 935 aa  1199    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  48.95 
 
 		 928 aa  791    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  70.09 
 
 		 878 aa  1237    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  57.45 
 
 		 937 aa  994    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  75.92 
 
 		 916 aa  1299    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  75.87 
 
 		 921 aa  1284    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  76.25 
 
 		 916 aa  1300    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  42.03 
 
 		 766 aa  551  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 796 aa  526  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  36.13 
 
 		 801 aa  484  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  39.97 
 
 		 1063 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 728 aa  450  1e-125  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30990  chemotaxis protein histidine kinase-like protein  45.62 
 
 		 819 aa  451  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5007  CheA signal transduction histidine kinase  45.82 
 
 		 792 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0579075  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 		 760 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0314  CheA signal transduction histidine kinase  46.44 
 
 		 822 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181126  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  40.16 
 
 		 769 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  39.94 
 
 		 769 aa  415  1e-114  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  39.84 
 
 		 769 aa  414  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  40.47 
 
 		 785 aa  408  1.0000000000000001e-112  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  46.83 
 
 		 870 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  39.22 
 
 		 770 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  39.72 
 
 		 774 aa  405  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  38.71 
 
 		 770 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  33.16 
 
 		 1104 aa  396  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  37 
 
 		 783 aa  394  1e-108  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  37.94 
 
 		 803 aa  390  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  37.36 
 
 		 610 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 687 aa  380  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 770 aa  381  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 607 aa  372  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 598 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 650 aa  365  2e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  35.19 
 
 		 601 aa  362  1e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 604 aa  358  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 603 aa  357  5e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 697 aa  352  2e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 666 aa  350  5e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 719 aa  350  9e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 677 aa  347  8e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 		 673 aa  345  2e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 660 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  35.66 
 
 		 639 aa  343  8e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 		 694 aa  342  1e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 652 aa  342  2e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 871 aa  332  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  36.81 
 
 		 625 aa  332  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  40.7 
 
 		 806 aa  332  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  34.93 
 
 		 685 aa  330  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 730 aa  327  6e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0065  CheA signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 812 aa  327  7e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 655 aa  327  9e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  35.53 
 
 		 654 aa  325  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 654 aa  323  9.000000000000001e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 747 aa  323  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  35.38 
 
 		 652 aa  323  9.000000000000001e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  35.38 
 
 		 654 aa  323  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 686 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  35.59 
 
 		 674 aa  323  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 1031 aa  323  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  35.38 
 
 		 654 aa  323  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 649 aa  323  9.999999999999999e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  35.38 
 
 		 654 aa  323  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  35.83 
 
 		 652 aa  322  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  31.35 
 
 		 677 aa  322  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  35.22 
 
 		 654 aa  322  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  34.32 
 
 		 681 aa  321  3e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 957 aa  322  3e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  35.08 
 
 		 654 aa  322  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  39 
 
 		 713 aa  321  3.9999999999999996e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 724 aa  321  5e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  33.69 
 
 		 887 aa  320  7e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 654 aa  320  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  39.7 
 
 		 736 aa  319  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 		 759 aa  318  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 		 709 aa  318  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 		 919 aa  317  8e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  43.57 
 
 		 681 aa  317  8e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  37.04 
 
 		 639 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 		 745 aa  315  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 747 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  34.31 
 
 		 669 aa  316  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  40.41 
 
 		 919 aa  315  2.9999999999999996e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 		 920 aa  315  3.9999999999999997e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  29.7 
 
 		 670 aa  314  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 746 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  43.41 
 
 		 754 aa  312  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 653 aa  312  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>