More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1714 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  68.94 
 
 		 935 aa  1199    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  60.36 
 
 		 937 aa  799    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  75.27 
 
 		 921 aa  1288    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  57.68 
 
 		 888 aa  988    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 921 aa  1816    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  51 
 
 		 942 aa  867    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  57 
 
 		 927 aa  969    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  60.36 
 
 		 937 aa  799    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  58.26 
 
 		 934 aa  997    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  57.16 
 
 		 927 aa  968    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  57.05 
 
 		 934 aa  998    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  57.63 
 
 		 922 aa  996    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3678  ATP-binding region, ATPase-like  56.81 
 
 		 925 aa  978    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0781071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  56.97 
 
 		 911 aa  971    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  90.7 
 
 		 916 aa  1575    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  91.14 
 
 		 916 aa  1584    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  46.6 
 
 		 928 aa  747    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  70.47 
 
 		 878 aa  1245    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  41.2 
 
 		 910 aa  626  1e-178  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  42.71 
 
 		 766 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  36.85 
 
 		 801 aa  516  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 796 aa  518  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 		 1063 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 728 aa  456  1.0000000000000001e-126  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5007  CheA signal transduction histidine kinase  43.73 
 
 		 792 aa  438  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0579075  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30990  chemotaxis protein histidine kinase-like protein  44.55 
 
 		 819 aa  428  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0314  CheA signal transduction histidine kinase  45.4 
 
 		 822 aa  415  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181126  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  39.5 
 
 		 769 aa  416  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  47.06 
 
 		 870 aa  415  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  39.5 
 
 		 769 aa  414  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  39.5 
 
 		 769 aa  411  1e-113  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  34.54 
 
 		 1104 aa  412  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  38.82 
 
 		 774 aa  403  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  39.16 
 
 		 770 aa  402  9.999999999999999e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  38.2 
 
 		 770 aa  403  9.999999999999999e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  36.21 
 
 		 803 aa  390  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  38.98 
 
 		 785 aa  392  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  37.56 
 
 		 783 aa  382  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 770 aa  371  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 598 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 		 607 aa  362  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 666 aa  360  6e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  36.39 
 
 		 610 aa  355  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 604 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 603 aa  351  3e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  34.61 
 
 		 650 aa  348  3e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  34.48 
 
 		 601 aa  348  3e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 		 730 aa  345  2.9999999999999997e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 660 aa  334  4e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 652 aa  334  5e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 694 aa  333  1e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 747 aa  330  8e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  30.01 
 
 		 673 aa  330  1.0000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  33.99 
 
 		 639 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 677 aa  327  7e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 1031 aa  327  9e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  34.16 
 
 		 685 aa  326  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  37.55 
 
 		 806 aa  322  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0065  CheA signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 		 812 aa  321  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 		 713 aa  321  3.9999999999999996e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 695 aa  320  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 		 747 aa  319  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  36.36 
 
 		 625 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 920 aa  318  2e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 686 aa  317  7e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 871 aa  317  8e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 		 919 aa  317  8e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 919 aa  317  9e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 653 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  32.73 
 
 		 704 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  30.03 
 
 		 670 aa  312  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 687 aa  312  2e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  36.25 
 
 		 639 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  32.77 
 
 		 887 aa  310  6.999999999999999e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 		 681 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 		 745 aa  310  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  34.51 
 
 		 674 aa  309  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  32.21 
 
 		 702 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  34.87 
 
 		 654 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 673 aa  307  5.0000000000000004e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0942  CheA signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 670 aa  307  7e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  34.72 
 
 		 654 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 654 aa  306  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  34.72 
 
 		 654 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 		 957 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  37.45 
 
 		 720 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  34.72 
 
 		 654 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  34.72 
 
 		 652 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  39.59 
 
 		 767 aa  305  3.0000000000000004e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  34.72 
 
 		 654 aa  305  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  34.56 
 
 		 654 aa  304  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 690 aa  305  4.0000000000000003e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  34.87 
 
 		 652 aa  304  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  37.38 
 
 		 736 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  38.72 
 
 		 714 aa  304  6.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  38.48 
 
 		 692 aa  304  6.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 		 655 aa  304  6.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  33.82 
 
 		 681 aa  304  6.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  29.34 
 
 		 667 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  29.34 
 
 		 667 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>