More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1906 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  49.33 
 
 		 937 aa  638    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  45.12 
 
 		 888 aa  734    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  44.91 
 
 		 937 aa  736    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 910 aa  1848    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  49.85 
 
 		 927 aa  644    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  45.21 
 
 		 942 aa  747    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  42.3 
 
 		 878 aa  689    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  44.76 
 
 		 934 aa  734    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  43.21 
 
 		 934 aa  720    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  43.91 
 
 		 922 aa  723    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3678  ATP-binding region, ATPase-like  44.34 
 
 		 925 aa  716    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0781071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  45.09 
 
 		 911 aa  743    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  49.7 
 
 		 927 aa  644    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 		 921 aa  640    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 916 aa  627  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 		 921 aa  628  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  46.44 
 
 		 935 aa  585  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  43.38 
 
 		 766 aa  570  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  47.85 
 
 		 928 aa  546  1e-154  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  43.7 
 
 		 916 aa  548  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  39.5 
 
 		 801 aa  538  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 		 796 aa  528  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 728 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 1063 aa  476  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  44.07 
 
 		 760 aa  462  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5007  CheA signal transduction histidine kinase  44.87 
 
 		 792 aa  461  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0579075  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  45.61 
 
 		 742 aa  457  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0314  CheA signal transduction histidine kinase  44.97 
 
 		 822 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181126  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  47.45 
 
 		 870 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  39.17 
 
 		 769 aa  427  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  39.23 
 
 		 803 aa  428  1e-118  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  39.11 
 
 		 769 aa  429  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30990  chemotaxis protein histidine kinase-like protein  43.33 
 
 		 819 aa  428  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  38.39 
 
 		 769 aa  423  1e-117  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  39.59 
 
 		 774 aa  425  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 		 770 aa  420  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  38.98 
 
 		 770 aa  415  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  34.96 
 
 		 1104 aa  406  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  39.12 
 
 		 770 aa  409  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  37.29 
 
 		 785 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  37.58 
 
 		 783 aa  405  1e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 598 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 604 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 		 607 aa  392  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  38.42 
 
 		 610 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 603 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  38.33 
 
 		 601 aa  385  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  37.09 
 
 		 685 aa  379  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 681 aa  375  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 652 aa  366  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 694 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 664 aa  347  7e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  42.53 
 
 		 691 aa  345  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 660 aa  342  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 719 aa  342  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  34.13 
 
 		 639 aa  340  5.9999999999999996e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 686 aa  340  9e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 1031 aa  338  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 		 675 aa  336  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  35.72 
 
 		 669 aa  335  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 		 713 aa  333  7.000000000000001e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 		 673 aa  332  1e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0065  CheA signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 812 aa  333  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 		 666 aa  333  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1740  CheA signal transduction histidine kinases  30.37 
 
 		 807 aa  332  2e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0607216 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 686 aa  331  3e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 		 697 aa  331  4e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  35.73 
 
 		 625 aa  330  6e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  42.93 
 
 		 715 aa  330  8e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  35.44 
 
 		 662 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  42.6 
 
 		 650 aa  328  3e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  34.85 
 
 		 681 aa  327  5e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 653 aa  327  6e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 		 666 aa  327  8.000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  43.18 
 
 		 701 aa  326  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  36.12 
 
 		 655 aa  325  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0755  CheA signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 688 aa  325  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0128541 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  42.78 
 
 		 1089 aa  325  3e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 		 745 aa  324  4e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  43.41 
 
 		 954 aa  324  5e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  45.5 
 
 		 957 aa  323  8e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  43.41 
 
 		 677 aa  323  8e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0984  chemotaxis sensor histidine kinase  31.64 
 
 		 598 aa  323  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  34.61 
 
 		 654 aa  322  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 		 671 aa  323  9.999999999999999e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0361  CheW-like protein  44.19 
 
 		 897 aa  323  9.999999999999999e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30104  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  44.36 
 
 		 729 aa  323  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 656 aa  322  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  43.92 
 
 		 691 aa  322  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 654 aa  321  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  35.17 
 
 		 652 aa  321  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  34.82 
 
 		 654 aa  320  5e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  34.66 
 
 		 654 aa  320  6e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  43.86 
 
 		 919 aa  320  6e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 		 920 aa  320  6e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  34.66 
 
 		 654 aa  320  6e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  44.27 
 
 		 806 aa  320  7e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  34.66 
 
 		 654 aa  320  7e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  34.66 
 
 		 652 aa  320  7.999999999999999e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 		 673 aa  320  1e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>