More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4838 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  68.09 
 
 
916 aa  1201    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
935 aa  1850    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  69.39 
 
 
921 aa  1226    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  42.55 
 
 
910 aa  669    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  59.44 
 
 
888 aa  1034    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  55.44 
 
 
927 aa  960    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  58.34 
 
 
934 aa  1029    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  56.91 
 
 
934 aa  1031    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  57.89 
 
 
922 aa  1024    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3678  ATP-binding region, ATPase-like  57.5 
 
 
925 aa  1015    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0781071  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  68.63 
 
 
916 aa  1206    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  49.42 
 
 
928 aa  790    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  69.06 
 
 
921 aa  1205    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  85.26 
 
 
878 aa  1535    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  40.8 
 
 
766 aa  525  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
796 aa  503  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  36.18 
 
 
801 aa  484  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 
1063 aa  456  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  48.04 
 
 
742 aa  457  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  46.01 
 
 
760 aa  436  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0314  CheA signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 
822 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181126  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30990  chemotaxis protein histidine kinase-like protein  44.26 
 
 
819 aa  424  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  39.85 
 
 
769 aa  418  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  39.85 
 
 
769 aa  416  1e-114  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  38.78 
 
 
785 aa  414  1e-114  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  39.21 
 
 
769 aa  415  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  46.94 
 
 
870 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  35.36 
 
 
1104 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 
728 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  38.23 
 
 
774 aa  406  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  38.66 
 
 
770 aa  405  1e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  38.69 
 
 
770 aa  406  1e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  37.44 
 
 
803 aa  394  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
687 aa  385  1e-105  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
650 aa  378  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 
770 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 
607 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 
709 aa  362  3e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
691 aa  360  5e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  34 
 
 
719 aa  359  9.999999999999999e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
598 aa  357  5e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  32.98 
 
 
760 aa  357  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  47.89 
 
 
783 aa  357  6.999999999999999e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
715 aa  356  1e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  33.74 
 
 
736 aa  354  5e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 
741 aa  353  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
652 aa  352  2e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  33.56 
 
 
714 aa  349  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
688 aa  348  3e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
673 aa  348  3e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
691 aa  347  5e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
696 aa  343  8e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
677 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
741 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
655 aa  338  2.9999999999999997e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
660 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  31.26 
 
 
675 aa  335  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
1031 aa  334  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 
694 aa  334  5e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 
666 aa  333  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0988  CheA signal transduction histidine kinases  33.29 
 
 
734 aa  332  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.581275 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
653 aa  330  7e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  33.92 
 
 
685 aa  329  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
695 aa  330  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  43.53 
 
 
745 aa  327  6e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 
666 aa  325  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
724 aa  323  6e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  33.28 
 
 
649 aa  323  8e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
871 aa  323  9.000000000000001e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
695 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  33.84 
 
 
639 aa  320  6e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 
686 aa  320  6e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 
656 aa  320  6e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  30.44 
 
 
670 aa  320  7e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 
681 aa  320  9e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  42.53 
 
 
767 aa  319  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  42.61 
 
 
1089 aa  319  1e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  30.35 
 
 
667 aa  318  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  30.35 
 
 
667 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  29.81 
 
 
670 aa  318  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 
713 aa  318  3e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  33.49 
 
 
625 aa  317  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  40.41 
 
 
806 aa  317  6e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 
747 aa  317  6e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0065  CheA signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
812 aa  317  7e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  32.91 
 
 
704 aa  317  9e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
728 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0942  CheA signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 
670 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  30.06 
 
 
667 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  34.86 
 
 
674 aa  315  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  34.24 
 
 
669 aa  315  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 
747 aa  313  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
686 aa  313  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  34.14 
 
 
662 aa  313  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 
919 aa  312  2e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  31.68 
 
 
702 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 
673 aa  311  2.9999999999999997e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 
954 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 
920 aa  311  4e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 
738 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.464654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>