More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2004 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 796 aa  1581    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30990  chemotaxis protein histidine kinase-like protein  77.22 
 
 		 819 aa  826    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5007  CheA signal transduction histidine kinase  60.49 
 
 		 792 aa  671    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0579075  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  47.65 
 
 		 870 aa  648    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  44.37 
 
 		 766 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0314  CheA signal transduction histidine kinase  56.96 
 
 		 822 aa  595  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181126  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  56.42 
 
 		 760 aa  590  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  38.78 
 
 		 801 aa  530  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  40.57 
 
 		 910 aa  507  9.999999999999999e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 921 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 		 921 aa  501  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 		 878 aa  496  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 		 934 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.09 
 
 		 942 aa  491  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 728 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 		 911 aa  431  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  43.14 
 
 		 937 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  43.14 
 
 		 937 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3678  ATP-binding region, ATPase-like  43.34 
 
 		 925 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0781071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  41.93 
 
 		 888 aa  425  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  42.73 
 
 		 927 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  41.95 
 
 		 934 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  41.95 
 
 		 922 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  42.36 
 
 		 927 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  43.19 
 
 		 916 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  43.19 
 
 		 916 aa  416  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 		 935 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 598 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  41.14 
 
 		 928 aa  406  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  39.73 
 
 		 1063 aa  398  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  36.75 
 
 		 769 aa  394  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 604 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 603 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  36.45 
 
 		 769 aa  390  1e-107  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  36.69 
 
 		 769 aa  390  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  36.47 
 
 		 774 aa  391  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 		 770 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  36.95 
 
 		 770 aa  387  1e-106  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  37.75 
 
 		 610 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 607 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  35.8 
 
 		 785 aa  379  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  35.83 
 
 		 770 aa  377  1e-103  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  35.82 
 
 		 803 aa  375  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  36.36 
 
 		 601 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 652 aa  366  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 694 aa  362  2e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  35.12 
 
 		 669 aa  353  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  34.19 
 
 		 681 aa  352  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  34.78 
 
 		 662 aa  351  3e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 871 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 681 aa  343  9e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1540  chemotaxis protein CheA  34.82 
 
 		 672 aa  340  8e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0565086  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  32.86 
 
 		 702 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  34.76 
 
 		 654 aa  339  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  34.32 
 
 		 669 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  33.24 
 
 		 704 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  34.25 
 
 		 654 aa  338  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 654 aa  338  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  34.25 
 
 		 654 aa  338  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  34.25 
 
 		 654 aa  338  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  34.25 
 
 		 652 aa  338  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  34.1 
 
 		 654 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  34.18 
 
 		 669 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  34.18 
 
 		 669 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  34.18 
 
 		 669 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  35.1 
 
 		 674 aa  337  5e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  34.18 
 
 		 669 aa  337  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  32.51 
 
 		 639 aa  334  3e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  35.5 
 
 		 1104 aa  335  3e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 		 660 aa  334  4e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 		 691 aa  333  5e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  31.18 
 
 		 677 aa  333  7.000000000000001e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 688 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  42.78 
 
 		 739 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  45.81 
 
 		 614 aa  328  2.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  42.78 
 
 		 747 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 		 606 aa  327  6e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  42.53 
 
 		 743 aa  326  9e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 		 713 aa  326  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  42.53 
 
 		 747 aa  326  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  43.56 
 
 		 748 aa  326  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 745 aa  325  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  43.56 
 
 		 753 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 649 aa  323  6e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  33.43 
 
 		 655 aa  322  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 664 aa  322  1.9999999999999998e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  44.08 
 
 		 701 aa  321  3e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  33.52 
 
 		 654 aa  321  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  42.78 
 
 		 737 aa  320  6e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  42.82 
 
 		 754 aa  320  7.999999999999999e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  34.14 
 
 		 652 aa  319  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  43.42 
 
 		 715 aa  318  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 		 709 aa  318  3e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 733 aa  317  4e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  43.54 
 
 		 552 aa  318  4e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  37.45 
 
 		 767 aa  318  4e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  43.54 
 
 		 552 aa  318  4e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 655 aa  316  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  42.39 
 
 		 783 aa  315  1.9999999999999998e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  36.55 
 
 		 751 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>