More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0314 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_5007  CheA signal transduction histidine kinase  62.56 
 
 		 792 aa  696    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0579075  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  46.86 
 
 		 766 aa  637    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  53.78 
 
 		 796 aa  776    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0314  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 822 aa  1603    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181126  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  49.29 
 
 		 870 aa  666    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  63.51 
 
 		 742 aa  670    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30990  chemotaxis protein histidine kinase-like protein  59.06 
 
 		 819 aa  620  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  58.21 
 
 		 760 aa  603  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  42.09 
 
 		 928 aa  545  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  42.48 
 
 		 910 aa  542  9.999999999999999e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  38.43 
 
 		 801 aa  538  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  40.8 
 
 		 942 aa  532  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 		 937 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 		 878 aa  519  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 		 911 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  40.22 
 
 		 934 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  40.34 
 
 		 888 aa  510  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  40.36 
 
 		 922 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  41.99 
 
 		 921 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 934 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  39.7 
 
 		 935 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  46.61 
 
 		 937 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  44.68 
 
 		 927 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3678  ATP-binding region, ATPase-like  43.92 
 
 		 925 aa  435  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0781071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  44.5 
 
 		 927 aa  433  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 		 921 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  38.28 
 
 		 803 aa  424  1e-117  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  44.13 
 
 		 728 aa  423  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  38.5 
 
 		 769 aa  419  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  38.19 
 
 		 769 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  38.5 
 
 		 769 aa  419  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  45.24 
 
 		 916 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  43.88 
 
 		 916 aa  416  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  38.51 
 
 		 785 aa  413  1e-114  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  37.79 
 
 		 770 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 770 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  39.97 
 
 		 783 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  37.56 
 
 		 770 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 		 1063 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  38.23 
 
 		 774 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 607 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 598 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 604 aa  395  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 603 aa  392  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  36.82 
 
 		 601 aa  391  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 650 aa  375  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 694 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  37.36 
 
 		 1104 aa  362  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 687 aa  360  4e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  31.97 
 
 		 736 aa  360  7e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 681 aa  356  6.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  36.52 
 
 		 639 aa  355  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 747 aa  355  2e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 728 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 652 aa  352  2e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  35.21 
 
 		 685 aa  348  3e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 738 aa  347  5e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  31.71 
 
 		 720 aa  344  2.9999999999999997e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 660 aa  343  5e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  35.67 
 
 		 674 aa  343  5.999999999999999e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  34.72 
 
 		 669 aa  342  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  33.48 
 
 		 681 aa  342  2e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  34.25 
 
 		 654 aa  342  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 654 aa  339  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 684 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  34.25 
 
 		 654 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  34.25 
 
 		 654 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  34.25 
 
 		 654 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  34.1 
 
 		 654 aa  338  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  34.25 
 
 		 652 aa  338  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  34.25 
 
 		 652 aa  338  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  35.17 
 
 		 655 aa  337  5.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  33.95 
 
 		 654 aa  337  5.999999999999999e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  35.58 
 
 		 625 aa  337  7e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  34.28 
 
 		 662 aa  336  7.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  31.93 
 
 		 714 aa  335  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 673 aa  334  4e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 684 aa  333  8e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 		 697 aa  332  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 871 aa  333  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 745 aa  331  3e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  34.02 
 
 		 669 aa  331  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  34.02 
 
 		 669 aa  331  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  33.97 
 
 		 669 aa  330  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 682 aa  330  8e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  34.02 
 
 		 669 aa  330  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  33.88 
 
 		 669 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  42.28 
 
 		 919 aa  327  7e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3299  CheA signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 671 aa  325  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  43.88 
 
 		 747 aa  324  5e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  45.34 
 
 		 614 aa  324  5e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  43.88 
 
 		 747 aa  323  7e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 		 919 aa  323  8e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  43.73 
 
 		 743 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 730 aa  323  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 		 671 aa  321  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  32.96 
 
 		 715 aa  321  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0990  CheA signal transduction histidine kinase  47.37 
 
 		 1085 aa  321  3e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 		 719 aa  321  3.9999999999999996e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 739 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>