More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1859 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  88.59 
 
 		 552 aa  667    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  88.59 
 
 		 552 aa  667    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 614 aa  1212    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  49.85 
 
 		 691 aa  559  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  42.9 
 
 		 767 aa  560  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  44.44 
 
 		 723 aa  545  1e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  44.31 
 
 		 751 aa  542  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  45.78 
 
 		 719 aa  535  1e-150  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  43.05 
 
 		 746 aa  533  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  43.63 
 
 		 754 aa  529  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  43.56 
 
 		 714 aa  527  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  42.66 
 
 		 733 aa  527  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  42.49 
 
 		 741 aa  525  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  42.96 
 
 		 736 aa  526  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  44.59 
 
 		 715 aa  524  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 		 733 aa  524  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0988  CheA signal transduction histidine kinases  43.66 
 
 		 734 aa  525  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581275 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  42.65 
 
 		 759 aa  520  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  46.08 
 
 		 650 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  41.71 
 
 		 747 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  41.52 
 
 		 760 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  41.58 
 
 		 747 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  42.09 
 
 		 738 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  42.46 
 
 		 734 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  53.54 
 
 		 745 aa  492  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  41.43 
 
 		 739 aa  490  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 		 709 aa  482  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  51.29 
 
 		 739 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  47.85 
 
 		 741 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  51.85 
 
 		 743 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3207  chemotaxis protein  45.81 
 
 		 758 aa  457  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  50.19 
 
 		 748 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  50.87 
 
 		 754 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  47.74 
 
 		 746 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  50.09 
 
 		 747 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  50.88 
 
 		 748 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  50.38 
 
 		 758 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  50.58 
 
 		 747 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  45.31 
 
 		 744 aa  449  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  46.15 
 
 		 762 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  49.16 
 
 		 753 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  45.98 
 
 		 762 aa  450  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  52.21 
 
 		 737 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  47.63 
 
 		 744 aa  449  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  45.96 
 
 		 785 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  38.42 
 
 		 769 aa  427  1e-118  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  38.42 
 
 		 769 aa  427  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  38.84 
 
 		 769 aa  427  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  41.3 
 
 		 639 aa  422  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  38.18 
 
 		 803 aa  417  9.999999999999999e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  38.85 
 
 		 774 aa  414  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  37.78 
 
 		 770 aa  415  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  37.99 
 
 		 785 aa  410  1e-113  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 		 598 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 604 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  37.42 
 
 		 783 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 		 603 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 607 aa  399  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  37.14 
 
 		 770 aa  398  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 		 796 aa  380  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 652 aa  381  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  33.7 
 
 		 801 aa  379  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 770 aa  379  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  37.06 
 
 		 766 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 681 aa  371  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  36.64 
 
 		 685 aa  365  1e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  37.39 
 
 		 674 aa  363  4e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 687 aa  363  5.0000000000000005e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  36.57 
 
 		 669 aa  363  6e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 701 aa  362  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 660 aa  360  3e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  35.59 
 
 		 681 aa  360  3e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  36.62 
 
 		 662 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 671 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  35.4 
 
 		 654 aa  353  5e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  35.4 
 
 		 654 aa  353  5e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 		 728 aa  353  5e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  35.4 
 
 		 654 aa  353  5e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  35.4 
 
 		 654 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  35.25 
 
 		 654 aa  353  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  35.42 
 
 		 652 aa  352  8e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  35.4 
 
 		 654 aa  352  8.999999999999999e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 654 aa  352  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  45.81 
 
 		 601 aa  352  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 919 aa  350  4e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  35.57 
 
 		 652 aa  350  4e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  34.61 
 
 		 690 aa  349  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  36.05 
 
 		 669 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  36.61 
 
 		 669 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  36.61 
 
 		 669 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  36.46 
 
 		 669 aa  347  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  36.46 
 
 		 669 aa  347  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 1031 aa  346  7e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 919 aa  345  2e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  33.69 
 
 		 660 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  35.27 
 
 		 888 aa  342  1e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 724 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  36.88 
 
 		 655 aa  342  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 878 aa  341  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3221  CheA signal transduction histidine kinase  47.81 
 
 		 635 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>