More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00954 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  100 
 
 
552 aa  1095    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  88.68 
 
 
614 aa  675    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  100 
 
 
552 aa  1095    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  55.48 
 
 
745 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  58.12 
 
 
754 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  58.27 
 
 
743 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  58.27 
 
 
747 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  58.05 
 
 
748 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  58.31 
 
 
758 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  58.01 
 
 
747 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  52.34 
 
 
767 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  58.01 
 
 
739 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  56.77 
 
 
733 aa  435  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  49.17 
 
 
747 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  47.5 
 
 
754 aa  437  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  55.67 
 
 
723 aa  433  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  49.26 
 
 
736 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  56.17 
 
 
709 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  58.42 
 
 
691 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  54.61 
 
 
733 aa  432  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  57.07 
 
 
748 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  55.21 
 
 
741 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  57.11 
 
 
753 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  49.69 
 
 
759 aa  429  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3207  chemotaxis protein  55.21 
 
 
758 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  50.76 
 
 
741 aa  428  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  56.84 
 
 
737 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  54.04 
 
 
747 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  54.46 
 
 
734 aa  428  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  53.72 
 
 
760 aa  428  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  54.04 
 
 
738 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  55.21 
 
 
762 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  54.04 
 
 
746 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  49.26 
 
 
751 aa  426  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  54.95 
 
 
762 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  55.21 
 
 
746 aa  423  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  54.66 
 
 
744 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  54.16 
 
 
744 aa  421  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  52.44 
 
 
719 aa  419  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  50.22 
 
 
714 aa  420  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  40.03 
 
 
598 aa  422  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  55.26 
 
 
785 aa  421  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 
770 aa  412  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  38.69 
 
 
769 aa  412  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  38.03 
 
 
769 aa  411  1e-113  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  40.69 
 
 
607 aa  411  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  38.52 
 
 
769 aa  412  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  38.94 
 
 
610 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0988  CheA signal transduction histidine kinases  52.94 
 
 
734 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.581275 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  40.61 
 
 
639 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  39.86 
 
 
601 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  53.58 
 
 
715 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
604 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  37.96 
 
 
774 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 
603 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  51.54 
 
 
650 aa  395  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  39.31 
 
 
766 aa  391  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  36.55 
 
 
785 aa  392  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  51.39 
 
 
739 aa  389  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  37.21 
 
 
770 aa  388  1e-106  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
606 aa  385  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  45.18 
 
 
770 aa  369  1e-101  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 
728 aa  367  1e-100  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  33.01 
 
 
801 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 
796 aa  367  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  38.64 
 
 
742 aa  360  5e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  44.94 
 
 
783 aa  353  4e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  42.65 
 
 
919 aa  349  7e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
760 aa  347  3e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3221  CheA signal transduction histidine kinase  47.7 
 
 
635 aa  345  2e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  43.49 
 
 
803 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  43.15 
 
 
919 aa  343  5.999999999999999e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  43.82 
 
 
681 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 
878 aa  340  4e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
1031 aa  340  4e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 
675 aa  340  5e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  42.2 
 
 
920 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  46.25 
 
 
954 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  41.49 
 
 
677 aa  337  2.9999999999999997e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  40.99 
 
 
701 aa  335  2e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 
691 aa  332  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  35.68 
 
 
888 aa  332  2e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 
957 aa  332  2e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30990  chemotaxis protein histidine kinase-like protein  44.5 
 
 
819 aa  331  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  32.95 
 
 
910 aa  330  3e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 
660 aa  330  4e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 
730 aa  330  5.0000000000000004e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  45.22 
 
 
1089 aa  329  6e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 
673 aa  328  1.0000000000000001e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0984  chemotaxis sensor histidine kinase  32.2 
 
 
598 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 
666 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  41.44 
 
 
692 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  43.38 
 
 
666 aa  326  6e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 
673 aa  326  8.000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 
729 aa  326  8.000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 
652 aa  325  1e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0622  CheA signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 
543 aa  324  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  46.37 
 
 
1030 aa  325  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  43.54 
 
 
671 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  45.55 
 
 
870 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>