More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0433 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
730 aa  1447    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  43.69 
 
 
871 aa  464  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 
598 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  36.94 
 
 
769 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  37.18 
 
 
769 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  40.63 
 
 
610 aa  399  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  36.97 
 
 
769 aa  398  1e-109  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 
604 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 
607 aa  399  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  37.77 
 
 
669 aa  398  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  36.45 
 
 
770 aa  397  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 
603 aa  399  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  36.93 
 
 
774 aa  396  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  36.46 
 
 
770 aa  389  1e-107  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  37.31 
 
 
674 aa  391  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
654 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  38.18 
 
 
662 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  37.75 
 
 
601 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  37.19 
 
 
654 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  37.19 
 
 
654 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  37.19 
 
 
652 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  36.18 
 
 
783 aa  385  1e-105  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 
682 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  36.88 
 
 
654 aa  385  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  36.88 
 
 
652 aa  385  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  37.03 
 
 
654 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  36.88 
 
 
654 aa  385  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  37.19 
 
 
654 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
770 aa  385  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  38.2 
 
 
655 aa  381  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
606 aa  379  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  34.83 
 
 
785 aa  377  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1989  ATP-binding region ATPase domain protein  44.11 
 
 
678 aa  370  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  38.74 
 
 
625 aa  369  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 
878 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  35.71 
 
 
803 aa  365  2e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2583  CheA signal transduction histidine kinase  49.87 
 
 
711 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2487  CheA signal transduction histidine kinase  49.87 
 
 
725 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430185  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  45.39 
 
 
703 aa  362  2e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4048  CheA signal transduction histidine kinase  48.45 
 
 
724 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507068  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4160  CheA signal transduction histidine kinase  48.45 
 
 
724 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158924  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  37.4 
 
 
639 aa  361  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1408  chemotaxis sensor histidine kinase transcription regulator protein  48.29 
 
 
726 aa  359  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.146245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1599  CheA signal transduction histidine kinase  46.21 
 
 
722 aa  359  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  44 
 
 
702 aa  358  1.9999999999999998e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 
694 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  42.67 
 
 
783 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  46.34 
 
 
806 aa  357  5e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5608  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  47.07 
 
 
673 aa  357  5.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  47.64 
 
 
671 aa  353  4e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 
699 aa  354  4e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
921 aa  353  5e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  45.76 
 
 
673 aa  352  1e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0165  CheA signal transduction histidine kinase  47.91 
 
 
761 aa  352  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.690811 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  45.12 
 
 
681 aa  351  3e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0238  CheA signal transduction histidine kinase  47.91 
 
 
750 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119172  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 
660 aa  350  4e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2851  CheA signal transduction histidine kinases  47.91 
 
 
756 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  42.17 
 
 
720 aa  350  4e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0169  CheA signal transduction histidine kinases  47.91 
 
 
744 aa  350  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454346  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0256  CheA signal transduction histidine kinases  47.91 
 
 
756 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  36.1 
 
 
888 aa  349  8e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0182  CheA signal transduction histidine kinase  47.64 
 
 
743 aa  349  8e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  43.11 
 
 
695 aa  349  9e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0984  chemotaxis sensor histidine kinase  33.83 
 
 
598 aa  349  1e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  43.81 
 
 
681 aa  349  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  36.75 
 
 
766 aa  349  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1684  chemotaxis protein CheA  46.48 
 
 
767 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.41407  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2859  chemotaxis protein CheA  46.48 
 
 
767 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3116  chemotaxis protein CheA  46.48 
 
 
767 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 
666 aa  348  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  41.76 
 
 
688 aa  348  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3435  chemotaxis protein CheA  46.48 
 
 
767 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 
677 aa  347  3e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  46.72 
 
 
684 aa  347  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  37.1 
 
 
639 aa  347  4e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0119  CheA Signal transduction histidine Kinases(STHK)  47.24 
 
 
766 aa  347  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3815  CheA signal transduction histidine kinase  47.23 
 
 
766 aa  347  5e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  46.07 
 
 
673 aa  346  7e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3358  CheA signal transduction histidine kinase  48.02 
 
 
749 aa  346  8e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.701672  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2974  CheA signal transduction histidine kinase  46.72 
 
 
772 aa  346  8e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131554 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
934 aa  346  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  43.27 
 
 
715 aa  346  8.999999999999999e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3689  CheA signal transduction histidine kinase  46.05 
 
 
671 aa  345  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.296916  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  42.82 
 
 
686 aa  345  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  47.12 
 
 
671 aa  345  2e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3182  chemotaxis protein CheA  47.23 
 
 
749 aa  345  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.671944  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  44.81 
 
 
729 aa  345  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  41.15 
 
 
717 aa  345  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  47.63 
 
 
684 aa  345  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4378  CheA signal transduction histidine kinase  44.58 
 
 
725 aa  345  2e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  46.21 
 
 
887 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  45.36 
 
 
691 aa  343  5e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0585  chemotaxis protein histidine kinase  46.19 
 
 
719 aa  343  5e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.648466  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  44.27 
 
 
713 aa  343  5e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  47.46 
 
 
724 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  41.2 
 
 
717 aa  343  7e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  43.54 
 
 
732 aa  343  8e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  37.69 
 
 
742 aa  343  8e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
728 aa  343  9e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>