More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1197 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  100 
 
 
887 aa  1800    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0611  CheA signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
683 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.527763 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0810  CheA signal transduction histidine kinases  47.07 
 
 
715 aa  395  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2315  CheA signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
665 aa  396  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  38.14 
 
 
654 aa  373  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
688 aa  376  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  37.99 
 
 
654 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
654 aa  372  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  37.78 
 
 
652 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  38.02 
 
 
654 aa  371  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  37.84 
 
 
654 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  37.99 
 
 
654 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 
694 aa  372  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  38.02 
 
 
652 aa  371  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  37.99 
 
 
654 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  47.36 
 
 
806 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
677 aa  372  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4378  CheA signal transduction histidine kinase  48.28 
 
 
725 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  36.68 
 
 
669 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  36.68 
 
 
669 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  36.68 
 
 
669 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  36.68 
 
 
669 aa  364  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  36.68 
 
 
669 aa  363  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 
699 aa  360  9e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
770 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  45.2 
 
 
732 aa  357  5.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
673 aa  355  2e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3790  CheA signal transduction histidine kinases  47.19 
 
 
710 aa  354  2.9999999999999997e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3064  CheA signal transduction histidine kinase  47.19 
 
 
710 aa  353  5.9999999999999994e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  46.76 
 
 
686 aa  352  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  35.25 
 
 
704 aa  353  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  50 
 
 
695 aa  351  4e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2176  CheA signal transduction histidine kinases  46.9 
 
 
709 aa  350  7e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749003  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
598 aa  350  8e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
675 aa  348  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  36.3 
 
 
700 aa  346  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1599  CheA signal transduction histidine kinase  46.85 
 
 
722 aa  346  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  34.74 
 
 
769 aa  345  2e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 
682 aa  345  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  45.93 
 
 
729 aa  345  2.9999999999999997e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  44.36 
 
 
871 aa  344  4e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  33.74 
 
 
769 aa  344  4e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 
709 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  47.11 
 
 
625 aa  343  7e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  45.98 
 
 
639 aa  343  7e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  42.24 
 
 
693 aa  343  8e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  46.21 
 
 
730 aa  341  2.9999999999999998e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  47.63 
 
 
783 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  34.43 
 
 
769 aa  341  4e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4160  CheA signal transduction histidine kinase  47.96 
 
 
724 aa  341  4e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158924  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4048  CheA signal transduction histidine kinase  47.96 
 
 
724 aa  341  4e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507068  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  42.63 
 
 
703 aa  340  7e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0585  chemotaxis protein histidine kinase  46.82 
 
 
719 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.648466  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 
724 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  48.97 
 
 
684 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1408  chemotaxis sensor histidine kinase transcription regulator protein  48.3 
 
 
726 aa  338  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.146245 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  46.07 
 
 
702 aa  338  2.9999999999999997e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5608  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  44.8 
 
 
673 aa  337  5.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  44.53 
 
 
674 aa  337  7e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1370  CheA signal transduction histidine kinase  48.03 
 
 
687 aa  337  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0938961  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  41.67 
 
 
681 aa  337  7.999999999999999e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  33.7 
 
 
770 aa  337  7.999999999999999e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2974  CheA signal transduction histidine kinase  46.44 
 
 
772 aa  336  9e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131554 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  34.59 
 
 
701 aa  336  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  45.25 
 
 
655 aa  336  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  45.91 
 
 
784 aa  336  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  46.58 
 
 
691 aa  335  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  45.32 
 
 
669 aa  335  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  44.39 
 
 
728 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 
709 aa  335  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  46.68 
 
 
715 aa  335  3e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3815  CheA signal transduction histidine kinase  46.17 
 
 
766 aa  334  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  33.96 
 
 
770 aa  333  7.000000000000001e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0156  chemotaxis protein CheA  47.24 
 
 
747 aa  333  8e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.93752  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3689  CheA signal transduction histidine kinase  44.53 
 
 
671 aa  333  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.296916  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2487  CheA signal transduction histidine kinase  47.24 
 
 
725 aa  332  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
684 aa  332  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  46.7 
 
 
724 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  45.04 
 
 
662 aa  332  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3358  CheA signal transduction histidine kinase  46.17 
 
 
749 aa  331  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.701672  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2583  CheA signal transduction histidine kinase  47.24 
 
 
711 aa  331  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  29.87 
 
 
927 aa  331  3e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  42.95 
 
 
707 aa  331  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  40.33 
 
 
758 aa  331  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  45.5 
 
 
679 aa  331  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  34.95 
 
 
774 aa  330  5.0000000000000004e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  33.24 
 
 
677 aa  331  5.0000000000000004e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1336  CheA signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 
657 aa  330  6e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280744  normal  0.428976 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0119  CheA Signal transduction histidine Kinases(STHK)  45.91 
 
 
766 aa  330  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1540  chemotaxis protein CheA  44 
 
 
672 aa  330  6e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0565086  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3182  chemotaxis protein CheA  46.44 
 
 
749 aa  330  7e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.671944  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  47.66 
 
 
720 aa  330  7e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0169  CheA signal transduction histidine kinases  46.17 
 
 
744 aa  330  8e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454346  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0182  CheA signal transduction histidine kinase  46.17 
 
 
743 aa  330  9e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  45.13 
 
 
717 aa  329  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 
684 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0165  CheA signal transduction histidine kinase  45.91 
 
 
761 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.690811 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  45.13 
 
 
727 aa  329  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  45.25 
 
 
679 aa  330  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  33.48 
 
 
685 aa  328  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>