More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0988 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  52.02 
 
 
744 aa  683    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  52.47 
 
 
744 aa  702    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  52.6 
 
 
714 aa  701    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3207  chemotaxis protein  52.26 
 
 
758 aa  709    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  51.61 
 
 
748 aa  671    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  53.09 
 
 
737 aa  694    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  51.92 
 
 
758 aa  683    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  53.88 
 
 
751 aa  733    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  51.96 
 
 
746 aa  693    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  52.67 
 
 
754 aa  682    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  52.82 
 
 
747 aa  711    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  50.91 
 
 
733 aa  684    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  51.5 
 
 
741 aa  708    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  51.09 
 
 
745 aa  694    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  52.03 
 
 
741 aa  713    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  52.61 
 
 
767 aa  711    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  50.52 
 
 
733 aa  694    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  53.57 
 
 
739 aa  691    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  52.01 
 
 
734 aa  677    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  52.38 
 
 
723 aa  714    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  53.54 
 
 
738 aa  701    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  50.59 
 
 
754 aa  693    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  54.59 
 
 
760 aa  729    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  52.44 
 
 
715 aa  663    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  54.45 
 
 
762 aa  712    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0988  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 
734 aa  1450    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.581275 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  53.28 
 
 
736 aa  715    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  50.14 
 
 
719 aa  688    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  52.76 
 
 
746 aa  704    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  53 
 
 
762 aa  706    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  52.88 
 
 
747 aa  710    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  51.99 
 
 
759 aa  700    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  53.6 
 
 
709 aa  719    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  49.94 
 
 
785 aa  676    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  65.55 
 
 
739 aa  884    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  45.91 
 
 
650 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  67.34 
 
 
691 aa  536  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  65.68 
 
 
748 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  66.08 
 
 
753 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
687 aa  416  9.999999999999999e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  54.12 
 
 
552 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  54.12 
 
 
552 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  47.03 
 
 
614 aa  391  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  36.44 
 
 
685 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 
697 aa  363  5.0000000000000005e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 
770 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  46.8 
 
 
696 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  40.65 
 
 
770 aa  358  1.9999999999999998e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  44.13 
 
 
639 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  39.76 
 
 
803 aa  353  8e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  40.41 
 
 
785 aa  351  3e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  39.49 
 
 
783 aa  350  5e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  41.67 
 
 
769 aa  350  6e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  43.96 
 
 
652 aa  350  7e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  45.79 
 
 
681 aa  348  2e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  42.01 
 
 
774 aa  348  2e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  44.15 
 
 
770 aa  347  4e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  41.22 
 
 
769 aa  347  5e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  37.8 
 
 
769 aa  347  5e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3221  CheA signal transduction histidine kinase  46.17 
 
 
635 aa  346  7e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  43.66 
 
 
606 aa  345  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 
598 aa  342  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 
701 aa  342  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  45.59 
 
 
610 aa  340  4e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  32.63 
 
 
720 aa  339  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  42.43 
 
 
801 aa  338  1.9999999999999998e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 
607 aa  338  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 
671 aa  338  2.9999999999999997e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 
673 aa  337  7e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 
604 aa  337  7e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  42.58 
 
 
601 aa  335  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  33.29 
 
 
681 aa  334  3e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 
660 aa  335  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  43.29 
 
 
674 aa  334  3e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
724 aa  334  4e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  32.12 
 
 
704 aa  333  5e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 
603 aa  333  6e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  42.82 
 
 
691 aa  333  9e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  30.34 
 
 
801 aa  332  2e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  44.04 
 
 
671 aa  331  3e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  31.96 
 
 
660 aa  330  4e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  33.11 
 
 
700 aa  330  6e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2888  CheA signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
671 aa  330  6e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  45.8 
 
 
701 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  42.43 
 
 
729 aa  327  5e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  42.42 
 
 
677 aa  325  1e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
690 aa  325  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  40.56 
 
 
1031 aa  323  7e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  42.68 
 
 
1089 aa  323  7e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  46.27 
 
 
702 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  39.74 
 
 
766 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0810  CheA signal transduction histidine kinases  30.53 
 
 
715 aa  321  3e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  32.24 
 
 
715 aa  321  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 
728 aa  321  3.9999999999999996e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 
695 aa  320  5e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
724 aa  320  5e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
728 aa  320  5e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  34.2 
 
 
758 aa  319  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 
558 aa  318  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 
954 aa  318  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>