More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0474 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  49.67 
 
 		 714 aa  669    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3207  chemotaxis protein  47.72 
 
 		 758 aa  665    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  48.22 
 
 		 747 aa  675    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  49.2 
 
 		 719 aa  662    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  51.01 
 
 		 715 aa  667    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  49.55 
 
 		 741 aa  695    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 		 739 aa  1457    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  47.46 
 
 		 723 aa  665    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  47.01 
 
 		 745 aa  646    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  48.91 
 
 		 741 aa  672    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  48.15 
 
 		 733 aa  669    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  46.62 
 
 		 767 aa  655    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  47.78 
 
 		 734 aa  640    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  48.79 
 
 		 744 aa  678    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  48.73 
 
 		 751 aa  682    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  47.78 
 
 		 746 aa  671    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  49.03 
 
 		 754 aa  672    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  49.56 
 
 		 760 aa  692    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  48.34 
 
 		 746 aa  664    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  47.97 
 
 		 762 aa  671    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0988  CheA signal transduction histidine kinases  66.84 
 
 		 734 aa  910    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581275 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  49.36 
 
 		 736 aa  671    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  50.85 
 
 		 739 aa  659    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  48.99 
 
 		 762 aa  667    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  47.96 
 
 		 738 aa  662    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  48.91 
 
 		 747 aa  675    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  48.74 
 
 		 759 aa  680    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  49.6 
 
 		 733 aa  673    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  51.58 
 
 		 709 aa  691    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  47.67 
 
 		 785 aa  657    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  47.95 
 
 		 744 aa  657    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  47.57 
 
 		 650 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  64.41 
 
 		 691 aa  529  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  61.04 
 
 		 747 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  61.35 
 
 		 743 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  61.06 
 
 		 748 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  60.45 
 
 		 758 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  61.56 
 
 		 754 aa  498  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  60.55 
 
 		 747 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  61.29 
 
 		 737 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  60.64 
 
 		 748 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  60.95 
 
 		 753 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  38.24 
 
 		 639 aa  430  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  35 
 
 		 803 aa  421  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  36.14 
 
 		 770 aa  421  1e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 687 aa  414  1e-114  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 770 aa  415  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  34.38 
 
 		 769 aa  411  1e-113  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  34.06 
 
 		 769 aa  405  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 701 aa  390  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  51.66 
 
 		 552 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  51.66 
 
 		 552 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 696 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  50.64 
 
 		 614 aa  379  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  38.22 
 
 		 769 aa  354  4e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 954 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 729 aa  352  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 1031 aa  351  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  43.31 
 
 		 785 aa  350  6e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  43.24 
 
 		 770 aa  350  7e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  43.65 
 
 		 598 aa  346  8e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  40.17 
 
 		 774 aa  345  2e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  43.42 
 
 		 783 aa  345  2e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3221  CheA signal transduction histidine kinase  45.73 
 
 		 635 aa  345  2e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  32.1 
 
 		 720 aa  342  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 694 aa  342  2e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  44.75 
 
 		 610 aa  340  4e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  38.45 
 
 		 607 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  43.63 
 
 		 681 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 		 652 aa  337  5.999999999999999e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  33.47 
 
 		 700 aa  334  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 		 660 aa  333  5e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  42.27 
 
 		 685 aa  332  2e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  32.12 
 
 		 681 aa  331  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  43.15 
 
 		 673 aa  331  3e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  46.19 
 
 		 701 aa  331  4e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  47.46 
 
 		 702 aa  331  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  32.71 
 
 		 715 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 		 606 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  42.61 
 
 		 603 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 701 aa  327  5e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  42.08 
 
 		 601 aa  327  5e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 604 aa  326  8.000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  42.93 
 
 		 674 aa  326  1e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  42.93 
 
 		 677 aa  326  1e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 690 aa  325  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  36.9 
 
 		 801 aa  324  3e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  39.03 
 
 		 919 aa  323  5e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  31.23 
 
 		 660 aa  323  5e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 		 713 aa  323  9.000000000000001e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  32.25 
 
 		 669 aa  322  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  41.57 
 
 		 728 aa  323  9.999999999999999e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 		 675 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  31.47 
 
 		 674 aa  322  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 		 671 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 724 aa  321  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  31.99 
 
 		 704 aa  319  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2920  CheA signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 685 aa  317  6e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.038084  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  44.25 
 
 		 712 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 		 695 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>