More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2311 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2222  chemotaxis protein CheA  78.61 
 
 		 692 aa  1083    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0755  CheA signal transduction histidine kinase  65.5 
 
 		 688 aa  876    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0128541 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  61.3 
 
 		 701 aa  815    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 690 aa  1381    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  67.68 
 
 		 671 aa  919    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  66.67 
 
 		 686 aa  890    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1729  CheA signal transduction histidine kinases  51.88 
 
 		 693 aa  648    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2736  CheA signal transduction histidine kinase  44.74 
 
 		 687 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2920  CheA signal transduction histidine kinase  44.51 
 
 		 685 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.038084  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2828  CheA signal transduction histidine kinase  44.36 
 
 		 685 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  36.86 
 
 		 774 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 		 681 aa  404  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 770 aa  398  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  37.04 
 
 		 803 aa  395  1e-109  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 691 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 		 666 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 696 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 673 aa  384  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  49.75 
 
 		 610 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 675 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  47.46 
 
 		 601 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  36.12 
 
 		 692 aa  379  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  45.11 
 
 		 598 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  36.34 
 
 		 685 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 713 aa  376  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 701 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 666 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 729 aa  375  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 		 607 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 		 694 aa  371  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  48.9 
 
 		 606 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 671 aa  369  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  35.26 
 
 		 677 aa  365  1e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 660 aa  365  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  30.5 
 
 		 801 aa  365  2e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 697 aa  362  2e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 695 aa  360  4e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  46.12 
 
 		 769 aa  359  8e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  45.67 
 
 		 769 aa  359  9.999999999999999e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  45.15 
 
 		 770 aa  358  1.9999999999999998e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  47.58 
 
 		 785 aa  357  3.9999999999999996e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  45.65 
 
 		 769 aa  356  6.999999999999999e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 652 aa  355  1e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  42.61 
 
 		 604 aa  355  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  46.95 
 
 		 783 aa  355  2e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 655 aa  354  2.9999999999999997e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 702 aa  353  5e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  45.22 
 
 		 770 aa  353  7e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  44.99 
 
 		 603 aa  352  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  34.58 
 
 		 703 aa  352  2e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 679 aa  348  2e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  30.94 
 
 		 702 aa  348  3e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 686 aa  347  4e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0766  CheA signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 802 aa  344  2.9999999999999997e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  32.62 
 
 		 681 aa  343  5e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 699 aa  343  9e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  46.91 
 
 		 673 aa  342  1e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 687 aa  341  2.9999999999999998e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  32.95 
 
 		 700 aa  339  8e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  31.94 
 
 		 670 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 653 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  46.88 
 
 		 674 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 650 aa  337  5.999999999999999e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  31.91 
 
 		 672 aa  336  9e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  31.98 
 
 		 667 aa  335  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  31.98 
 
 		 667 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 		 558 aa  336  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  34.07 
 
 		 654 aa  335  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 724 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  31.65 
 
 		 670 aa  335  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  32.75 
 
 		 758 aa  333  5e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 688 aa  333  5e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  33.04 
 
 		 674 aa  333  7.000000000000001e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  33.92 
 
 		 652 aa  333  7.000000000000001e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  33.77 
 
 		 654 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 654 aa  332  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  33.04 
 
 		 654 aa  332  1e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 677 aa  332  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  31.77 
 
 		 667 aa  332  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 656 aa  332  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  33.77 
 
 		 652 aa  332  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  33.77 
 
 		 654 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  33.77 
 
 		 654 aa  332  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  33.63 
 
 		 654 aa  332  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  31.47 
 
 		 667 aa  332  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 682 aa  331  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  32.31 
 
 		 720 aa  331  3e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  32.99 
 
 		 669 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  34.17 
 
 		 662 aa  330  7e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  33.96 
 
 		 625 aa  329  8e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 719 aa  329  1.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 695 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 707 aa  327  6e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1408  chemotaxis protein histidine kinase, CheA-like  31.38 
 
 		 846 aa  325  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0658876  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  32.44 
 
 		 736 aa  325  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 684 aa  323  6e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  33.23 
 
 		 639 aa  323  9.000000000000001e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  45.24 
 
 		 671 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  33.89 
 
 		 669 aa  321  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  33.43 
 
 		 669 aa  321  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>