More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0810 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0611  CheA signal transduction histidine kinase  57.38 
 
 		 683 aa  797    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.527763 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2315  CheA signal transduction histidine kinase  52.09 
 
 		 665 aa  708    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0810  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 		 715 aa  1444    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1332  putative CheA signal transduction histidine kinases  47.83 
 
 		 511 aa  485  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1770  CheA signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 633 aa  428  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  47.07 
 
 		 887 aa  395  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 684 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 682 aa  379  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 686 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  34.37 
 
 		 707 aa  372  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 684 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  33.01 
 
 		 677 aa  364  4e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 681 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 		 688 aa  362  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 709 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  47.24 
 
 		 625 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2176  CheA signal transduction histidine kinases  45.02 
 
 		 709 aa  357  3.9999999999999996e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 702 aa  355  1e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  46.72 
 
 		 639 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  44.61 
 
 		 732 aa  353  5.9999999999999994e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  45.43 
 
 		 871 aa  353  7e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  32.72 
 
 		 783 aa  353  8e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3790  CheA signal transduction histidine kinases  45.24 
 
 		 710 aa  353  8e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3064  CheA signal transduction histidine kinase  45.24 
 
 		 710 aa  352  1e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  34.33 
 
 		 674 aa  352  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  32.59 
 
 		 717 aa  352  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  46.35 
 
 		 758 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4378  CheA signal transduction histidine kinase  42.21 
 
 		 725 aa  352  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0585  chemotaxis protein histidine kinase  45.88 
 
 		 719 aa  349  1e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.648466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  31.54 
 
 		 704 aa  349  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  44.58 
 
 		 729 aa  347  4e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 686 aa  347  5e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  32.83 
 
 		 717 aa  347  5e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0156  chemotaxis protein CheA  45.83 
 
 		 747 aa  346  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.93752  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 675 aa  345  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  45.29 
 
 		 691 aa  345  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 682 aa  345  2e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 666 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  45.17 
 
 		 784 aa  343  5e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 652 aa  343  7e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 724 aa  343  8e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  44.33 
 
 		 806 aa  342  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  32.01 
 
 		 715 aa  342  1e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1599  CheA signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 		 722 aa  342  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 660 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 699 aa  340  4e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5608  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  43.11 
 
 		 673 aa  340  5.9999999999999996e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0165  CheA signal transduction histidine kinase  44.94 
 
 		 761 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.690811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  42.82 
 
 		 677 aa  339  8e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3358  CheA signal transduction histidine kinase  44.65 
 
 		 749 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.701672  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  43.44 
 
 		 703 aa  339  9.999999999999999e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0238  CheA signal transduction histidine kinase  42.72 
 
 		 750 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 724 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  31.6 
 
 		 801 aa  337  3.9999999999999995e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0169  CheA signal transduction histidine kinases  44.42 
 
 		 744 aa  337  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454346  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2851  CheA signal transduction histidine kinases  44.42 
 
 		 756 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0256  CheA signal transduction histidine kinases  44.42 
 
 		 756 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0182  CheA signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 		 743 aa  336  9e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  43.48 
 
 		 655 aa  335  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1408  chemotaxis sensor histidine kinase transcription regulator protein  44.47 
 
 		 726 aa  334  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.146245 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 697 aa  334  3e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  33.29 
 
 		 708 aa  334  3e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4156  CheA signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 684 aa  334  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.847585  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 728 aa  334  4e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  32.41 
 
 		 692 aa  334  4e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2093  CheA signal transduction histidine kinases  42.89 
 
 		 736 aa  333  6e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.768244 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1881  CheA signal transduction histidine kinases  42.89 
 
 		 736 aa  333  6e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.254979 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4048  CheA signal transduction histidine kinase  42.97 
 
 		 724 aa  333  8e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4160  CheA signal transduction histidine kinase  42.97 
 
 		 724 aa  333  8e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  42.82 
 
 		 727 aa  333  9e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2859  chemotaxis protein CheA  42.43 
 
 		 767 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1684  chemotaxis protein CheA  42.43 
 
 		 767 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.41407  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 701 aa  332  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3116  chemotaxis protein CheA  42.43 
 
 		 767 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3435  chemotaxis protein CheA  42.43 
 
 		 767 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  41.92 
 
 		 681 aa  332  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 691 aa  330  4e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  41.5 
 
 		 669 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  41.67 
 
 		 662 aa  329  9e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 666 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  43.97 
 
 		 720 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3689  CheA signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 671 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.296916  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2974  CheA signal transduction histidine kinase  43.38 
 
 		 772 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131554 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 696 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  43.08 
 
 		 654 aa  328  3e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3182  chemotaxis protein CheA  43.34 
 
 		 749 aa  328  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.671944  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  43.08 
 
 		 652 aa  328  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  43.08 
 
 		 654 aa  327  3e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  33.19 
 
 		 707 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 713 aa  327  5e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1989  ATP-binding region ATPase domain protein  30.94 
 
 		 678 aa  327  6e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  41.75 
 
 		 669 aa  327  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1540  chemotaxis protein CheA  41.81 
 
 		 672 aa  327  6e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0565086  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  41.75 
 
 		 669 aa  327  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0077  chemotaxis protein CheA  43.34 
 
 		 765 aa  327  7e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3936  chemotaxis protein CheA  43.34 
 
 		 765 aa  327  7e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  42.82 
 
 		 654 aa  326  8.000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 712 aa  326  8.000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3855  chemotaxis protein CheA  43.34 
 
 		 762 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 		 730 aa  326  8.000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>