More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0611 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2315  CheA signal transduction histidine kinase  52.79 
 
 
665 aa  716    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0611  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
683 aa  1382    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.527763 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0810  CheA signal transduction histidine kinases  57.38 
 
 
715 aa  797    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1332  putative CheA signal transduction histidine kinases  51.49 
 
 
511 aa  485  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1770  CheA signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 
633 aa  434  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  36.55 
 
 
887 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  46.42 
 
 
625 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 
684 aa  369  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
684 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  49.87 
 
 
639 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
702 aa  369  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
682 aa  362  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1989  ATP-binding region ATPase domain protein  34.62 
 
 
678 aa  355  2e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
681 aa  351  3e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
701 aa  348  1e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  33.28 
 
 
686 aa  348  2e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  45.76 
 
 
703 aa  347  6e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  45.57 
 
 
784 aa  346  8.999999999999999e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  34.04 
 
 
677 aa  346  8.999999999999999e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
688 aa  345  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  42.89 
 
 
732 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  45.34 
 
 
758 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
660 aa  343  7e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  31.22 
 
 
681 aa  342  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  34.72 
 
 
652 aa  342  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  44 
 
 
806 aa  342  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
675 aa  342  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0156  chemotaxis protein CheA  44.82 
 
 
747 aa  340  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.93752  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  34.76 
 
 
654 aa  340  4e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
654 aa  340  5e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  32.21 
 
 
702 aa  340  7e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
707 aa  339  8e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  45.13 
 
 
691 aa  339  9e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  34.47 
 
 
654 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  34.47 
 
 
652 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
696 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  34.32 
 
 
654 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  34.47 
 
 
654 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  34.47 
 
 
654 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 
695 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2176  CheA signal transduction histidine kinases  42.64 
 
 
709 aa  338  2.9999999999999997e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749003  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
677 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  44.62 
 
 
871 aa  337  5.999999999999999e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  34.93 
 
 
674 aa  336  9e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
666 aa  336  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 
694 aa  335  2e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  44.27 
 
 
724 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  43.53 
 
 
783 aa  335  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  44.17 
 
 
654 aa  334  3e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
673 aa  334  3e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
652 aa  333  4e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
666 aa  333  5e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3064  CheA signal transduction histidine kinase  42.97 
 
 
710 aa  333  6e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  32.11 
 
 
704 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3790  CheA signal transduction histidine kinases  42.97 
 
 
710 aa  333  8e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  43.23 
 
 
730 aa  333  9e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4378  CheA signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 
725 aa  333  9e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0238  CheA signal transduction histidine kinase  45.03 
 
 
750 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119172  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3815  CheA signal transduction histidine kinase  44.76 
 
 
766 aa  332  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0182  CheA signal transduction histidine kinase  44.5 
 
 
743 aa  332  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2974  CheA signal transduction histidine kinase  44.5 
 
 
772 aa  332  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131554 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2851  CheA signal transduction histidine kinases  45.03 
 
 
756 aa  332  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0169  CheA signal transduction histidine kinases  44.5 
 
 
744 aa  332  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454346  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0256  CheA signal transduction histidine kinases  45.03 
 
 
756 aa  332  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  33.14 
 
 
717 aa  331  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  31.96 
 
 
669 aa  331  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  33.66 
 
 
700 aa  331  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0119  CheA Signal transduction histidine Kinases(STHK)  44.5 
 
 
766 aa  331  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  45.04 
 
 
724 aa  330  4e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0165  CheA signal transduction histidine kinase  45.03 
 
 
761 aa  330  4e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.690811 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3358  CheA signal transduction histidine kinase  44.47 
 
 
749 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.701672  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2859  chemotaxis protein CheA  43.17 
 
 
767 aa  330  6e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1684  chemotaxis protein CheA  43.17 
 
 
767 aa  330  6e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.41407  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3116  chemotaxis protein CheA  43.17 
 
 
767 aa  330  6e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3435  chemotaxis protein CheA  43.17 
 
 
767 aa  330  6e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0585  chemotaxis protein histidine kinase  43.75 
 
 
719 aa  330  7e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.648466  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  44.77 
 
 
728 aa  329  9e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
691 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4156  CheA signal transduction histidine kinase  44.97 
 
 
684 aa  328  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.847585  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3182  chemotaxis protein CheA  44.13 
 
 
749 aa  328  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.671944  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
655 aa  328  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  33.05 
 
 
705 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
695 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3936  chemotaxis protein CheA  44.13 
 
 
765 aa  327  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0077  chemotaxis protein CheA  44.13 
 
 
765 aa  327  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3299  CheA signal transduction histidine kinase  45.52 
 
 
671 aa  327  7e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3855  chemotaxis protein CheA  44.13 
 
 
762 aa  327  7e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1599  CheA signal transduction histidine kinase  42.2 
 
 
722 aa  326  9e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
673 aa  325  1e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
697 aa  326  1e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  32.35 
 
 
655 aa  325  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  44.3 
 
 
669 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
699 aa  325  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  44.3 
 
 
669 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  42.89 
 
 
729 aa  324  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  44.3 
 
 
669 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  44.3 
 
 
669 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5608  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  42.49 
 
 
673 aa  323  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00032  chemotaxis protein CheA  42.89 
 
 
669 aa  323  5e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4048  CheA signal transduction histidine kinase  42.27 
 
 
724 aa  323  5e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507068  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>