More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2315 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0611  CheA signal transduction histidine kinase  52.79 
 
 		 683 aa  716    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.527763 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0810  CheA signal transduction histidine kinases  52.09 
 
 		 715 aa  708    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2315  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 665 aa  1363    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1770  CheA signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 633 aa  421  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1332  putative CheA signal transduction histidine kinases  44.36 
 
 		 511 aa  410  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  36.24 
 
 		 887 aa  396  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  33.48 
 
 		 654 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  33.73 
 
 		 654 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  33.63 
 
 		 654 aa  340  4e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  33.48 
 
 		 654 aa  340  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 654 aa  340  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  33.48 
 
 		 652 aa  340  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 732 aa  340  5.9999999999999996e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  33.48 
 
 		 654 aa  340  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 702 aa  340  5.9999999999999996e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  33.48 
 
 		 654 aa  340  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  33.48 
 
 		 652 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 684 aa  336  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 671 aa  333  6e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 673 aa  332  2e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0156  chemotaxis protein CheA  43.85 
 
 		 747 aa  331  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.93752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 696 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  32.84 
 
 		 685 aa  330  6e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 701 aa  330  7e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 675 aa  330  7e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  43.38 
 
 		 784 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3790  CheA signal transduction histidine kinases  43.15 
 
 		 710 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  43.59 
 
 		 758 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3064  CheA signal transduction histidine kinase  43.15 
 
 		 710 aa  328  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 671 aa  327  3e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  31.5 
 
 		 681 aa  327  6e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0585  chemotaxis protein histidine kinase  42.18 
 
 		 719 aa  327  6e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.648466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  32.34 
 
 		 669 aa  325  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4378  CheA signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 725 aa  325  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2176  CheA signal transduction histidine kinases  41.18 
 
 		 709 aa  325  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  44.53 
 
 		 625 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3815  CheA signal transduction histidine kinase  43.23 
 
 		 766 aa  325  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 871 aa  324  3e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  32.44 
 
 		 662 aa  324  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0119  CheA Signal transduction histidine Kinases(STHK)  43.23 
 
 		 766 aa  324  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 681 aa  324  4e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  32.56 
 
 		 674 aa  322  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.91 
 
 		 691 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1989  ATP-binding region ATPase domain protein  32.21 
 
 		 678 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 682 aa  321  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 666 aa  321  3e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 		 688 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 709 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 707 aa  320  5e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2974  CheA signal transduction histidine kinase  42.71 
 
 		 772 aa  320  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131554 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 		 730 aa  319  9e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  44.27 
 
 		 639 aa  319  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  41.21 
 
 		 704 aa  319  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  31.3 
 
 		 669 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 729 aa  318  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  31.3 
 
 		 669 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0165  CheA signal transduction histidine kinase  42.71 
 
 		 761 aa  318  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.690811 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1599  CheA signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 		 722 aa  318  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  43.51 
 
 		 694 aa  318  2e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  43.08 
 
 		 684 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  31.3 
 
 		 669 aa  316  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0974  CheA signal transduction histidine kinases  31.87 
 
 		 691 aa  316  8e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  31.3 
 
 		 669 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2859  chemotaxis protein CheA  42.97 
 
 		 767 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 		 684 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  31.19 
 
 		 669 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3435  chemotaxis protein CheA  42.97 
 
 		 767 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3358  CheA signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 		 749 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.701672  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 686 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  41.15 
 
 		 783 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3116  chemotaxis protein CheA  42.97 
 
 		 767 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0182  CheA signal transduction histidine kinase  41.93 
 
 		 743 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1684  chemotaxis protein CheA  42.97 
 
 		 767 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.41407  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0169  CheA signal transduction histidine kinases  41.93 
 
 		 744 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454346  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0077  chemotaxis protein CheA  42.93 
 
 		 765 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3936  chemotaxis protein CheA  42.93 
 
 		 765 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3182  chemotaxis protein CheA  42.67 
 
 		 749 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.671944  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  42.2 
 
 		 729 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2851  CheA signal transduction histidine kinases  42.45 
 
 		 756 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1881  CheA signal transduction histidine kinases  41.45 
 
 		 736 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.254979 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3855  chemotaxis protein CheA  42.93 
 
 		 762 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0256  CheA signal transduction histidine kinases  42.45 
 
 		 756 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2093  CheA signal transduction histidine kinases  41.45 
 
 		 736 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.768244 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0238  CheA signal transduction histidine kinase  41.93 
 
 		 750 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 652 aa  313  7.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5608  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  40.1 
 
 		 673 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 697 aa  312  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  39.22 
 
 		 806 aa  311  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  31.07 
 
 		 677 aa  311  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 686 aa  312  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 660 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 671 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 709 aa  310  5e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  42.64 
 
 		 727 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  42.64 
 
 		 717 aa  309  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 673 aa  308  2.0000000000000002e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 		 724 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4048  CheA signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 		 724 aa  308  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4160  CheA signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 		 724 aa  308  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158924  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1408  chemotaxis sensor histidine kinase transcription regulator protein  42.45 
 
 		 726 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.146245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>