More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0990 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  53.44 
 
 
1063 aa  752    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0990  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1085 aa  2190    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  38.09 
 
 
1104 aa  478  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.17 
 
 
942 aa  456  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  40.99 
 
 
766 aa  448  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  36.35 
 
 
934 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  41.77 
 
 
801 aa  444  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  43.06 
 
 
870 aa  436  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 
760 aa  428  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5007  CheA signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 
792 aa  419  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0579075  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
916 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  36.02 
 
 
916 aa  410  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  38.51 
 
 
742 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  44.65 
 
 
728 aa  328  5e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 
770 aa  327  7e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0314  CheA signal transduction histidine kinase  47.5 
 
 
822 aa  320  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181126  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
675 aa  319  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 
691 aa  311  4e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
729 aa  309  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
724 aa  303  9e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 
691 aa  301  4e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  45.87 
 
 
937 aa  301  5e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
660 aa  300  7e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
719 aa  300  8e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  45.87 
 
 
937 aa  300  8e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
724 aa  300  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
713 aa  299  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
728 aa  298  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30990  chemotaxis protein histidine kinase-like protein  46.65 
 
 
819 aa  296  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
671 aa  296  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  44.65 
 
 
911 aa  296  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  44.88 
 
 
922 aa  295  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  46.35 
 
 
928 aa  294  5e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  44.88 
 
 
934 aa  294  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  36.4 
 
 
610 aa  293  9e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  36.63 
 
 
803 aa  293  9e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  44.65 
 
 
888 aa  292  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3678  ATP-binding region, ATPase-like  44.82 
 
 
925 aa  292  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0781071  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  43.98 
 
 
927 aa  291  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  46.65 
 
 
796 aa  291  4e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  45.17 
 
 
671 aa  290  9e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  35.7 
 
 
744 aa  290  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
696 aa  290  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  43.43 
 
 
673 aa  288  4e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  29.82 
 
 
700 aa  288  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  43.67 
 
 
927 aa  288  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
878 aa  287  7e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  35.52 
 
 
785 aa  287  7e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  46.33 
 
 
935 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  44.68 
 
 
785 aa  286  2.0000000000000002e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 
604 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  44.38 
 
 
783 aa  285  3.0000000000000004e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  35.48 
 
 
744 aa  285  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  45.25 
 
 
671 aa  285  4.0000000000000003e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
607 aa  284  5.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  36.88 
 
 
601 aa  284  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  42.63 
 
 
774 aa  284  7.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 
603 aa  284  7.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  45.59 
 
 
770 aa  284  7.000000000000001e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  38.93 
 
 
685 aa  283  9e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 
921 aa  283  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  36.3 
 
 
734 aa  282  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  36.91 
 
 
754 aa  283  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
690 aa  282  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
664 aa  281  4e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  40.14 
 
 
769 aa  281  6e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
759 aa  280  7e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  44.95 
 
 
769 aa  280  8e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
733 aa  280  9e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  44.95 
 
 
769 aa  279  2e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
673 aa  280  2e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 
921 aa  278  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  36.04 
 
 
762 aa  278  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  37.36 
 
 
806 aa  278  5e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 
655 aa  278  5e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  35.81 
 
 
760 aa  277  7e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 
741 aa  277  8e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  35.59 
 
 
762 aa  277  9e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  44.65 
 
 
770 aa  276  1.0000000000000001e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  34.54 
 
 
692 aa  276  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  47.64 
 
 
910 aa  276  2.0000000000000002e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  31.08 
 
 
681 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  31.67 
 
 
674 aa  276  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  37 
 
 
606 aa  275  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
709 aa  275  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  36.18 
 
 
767 aa  274  7e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
733 aa  273  9e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0065  CheA signal transduction histidine kinase  44.59 
 
 
812 aa  273  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
746 aa  273  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
614 aa  273  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  43.37 
 
 
954 aa  273  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 
715 aa  273  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  37.53 
 
 
552 aa  272  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  37.53 
 
 
552 aa  272  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
598 aa  271  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 
674 aa  271  4e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 
682 aa  271  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  35.56 
 
 
739 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  31.79 
 
 
669 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  37.7 
 
 
639 aa  268  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>