More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0868 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0990  CheA signal transduction histidine kinase  47.35 
 
 		 1085 aa  945    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1063 aa  2123    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  33.71 
 
 		 1104 aa  531  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  40.11 
 
 		 942 aa  499  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  40.25 
 
 		 888 aa  493  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 		 911 aa  493  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  40.2 
 
 		 927 aa  489  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  38.45 
 
 		 937 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 878 aa  484  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  39.72 
 
 		 927 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3678  ATP-binding region, ATPase-like  39.54 
 
 		 925 aa  485  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0781071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  38.45 
 
 		 937 aa  486  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 		 934 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  38.26 
 
 		 922 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 921 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  38.26 
 
 		 934 aa  473  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 		 921 aa  465  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  39.33 
 
 		 910 aa  460  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 916 aa  458  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  39.49 
 
 		 916 aa  457  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  41.98 
 
 		 766 aa  451  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 935 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  43.4 
 
 		 801 aa  443  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  45.67 
 
 		 870 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5007  CheA signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 		 792 aa  429  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0579075  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 		 760 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30990  chemotaxis protein histidine kinase-like protein  41.65 
 
 		 819 aa  413  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  40.73 
 
 		 742 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  39.64 
 
 		 928 aa  407  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 		 728 aa  405  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0314  CheA signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 		 822 aa  402  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181126  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 		 796 aa  400  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 770 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  34.64 
 
 		 736 aa  382  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 675 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 709 aa  379  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  33.37 
 
 		 751 aa  372  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 733 aa  369  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  39.21 
 
 		 783 aa  358  1.9999999999999998e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  31.04 
 
 		 697 aa  357  5e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 673 aa  356  1e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  38.64 
 
 		 769 aa  354  5.9999999999999994e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  43.4 
 
 		 803 aa  353  8.999999999999999e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  34.54 
 
 		 681 aa  353  8.999999999999999e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  42.45 
 
 		 785 aa  353  8.999999999999999e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 674 aa  352  2e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  41.7 
 
 		 767 aa  352  3e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 701 aa  350  1e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  39.96 
 
 		 770 aa  349  1e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 747 aa  349  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  42.19 
 
 		 769 aa  348  3e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 702 aa  348  4e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  44.5 
 
 		 770 aa  348  4e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 		 747 aa  347  5e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  41.96 
 
 		 769 aa  347  1e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  34.3 
 
 		 741 aa  346  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  35.17 
 
 		 674 aa  345  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  42.46 
 
 		 774 aa  344  4e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 650 aa  344  5e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 666 aa  344  5e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  41.04 
 
 		 723 aa  343  7e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  45.43 
 
 		 691 aa  342  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 695 aa  341  4e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 738 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 664 aa  340  9.999999999999999e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 		 759 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  41.48 
 
 		 754 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  45.43 
 
 		 715 aa  338  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  43.34 
 
 		 681 aa  337  7e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 686 aa  337  7.999999999999999e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  42.52 
 
 		 785 aa  336  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  43.43 
 
 		 601 aa  335  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  44.68 
 
 		 744 aa  336  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 		 746 aa  334  4e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  43.03 
 
 		 744 aa  333  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 598 aa  333  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 741 aa  333  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  40.44 
 
 		 760 aa  332  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  32.59 
 
 		 700 aa  330  6e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  41.65 
 
 		 671 aa  330  9e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  45.04 
 
 		 610 aa  330  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 746 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 719 aa  330  1.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  41.57 
 
 		 685 aa  329  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  42.86 
 
 		 734 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 		 687 aa  329  2.0000000000000001e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 		 743 aa  328  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 		 741 aa  328  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  44.2 
 
 		 762 aa  328  3e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 606 aa  327  5e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 		 673 aa  327  7e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3467  CheA signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 751 aa  327  8.000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.124475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 		 747 aa  326  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  43.7 
 
 		 762 aa  325  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 		 747 aa  325  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 		 607 aa  325  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 671 aa  324  5e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  42.27 
 
 		 739 aa  324  7e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 		 671 aa  324  7e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 694 aa  324  7e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>