More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1740 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0065  CheA signal transduction histidine kinase  47.5 
 
 		 812 aa  636    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1740  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 		 807 aa  1584    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0607216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  32.85 
 
 		 888 aa  396  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 878 aa  385  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 760 aa  343  8e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  33.58 
 
 		 766 aa  335  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  30.69 
 
 		 910 aa  326  1e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  35.64 
 
 		 742 aa  326  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 728 aa  323  5e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  31.78 
 
 		 927 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  31.82 
 
 		 927 aa  321  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.18 
 
 		 942 aa  321  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 937 aa  316  9e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 937 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 934 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3678  ATP-binding region, ATPase-like  32.41 
 
 		 925 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0781071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 770 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 911 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  31.98 
 
 		 934 aa  310  8e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  31.98 
 
 		 922 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0314  CheA signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 		 822 aa  307  4.0000000000000004e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181126  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 921 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 604 aa  302  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 598 aa  301  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 603 aa  300  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30990  chemotaxis protein histidine kinase-like protein  35.42 
 
 		 819 aa  298  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  33.05 
 
 		 928 aa  296  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 607 aa  294  5e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 916 aa  292  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 921 aa  292  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 606 aa  291  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  32.17 
 
 		 916 aa  291  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 935 aa  288  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  32.27 
 
 		 601 aa  287  5e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 796 aa  286  1.0000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  29.23 
 
 		 801 aa  282  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 		 1063 aa  280  9e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5007  CheA signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 792 aa  277  6e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0579075  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 558 aa  265  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  36.82 
 
 		 870 aa  260  9e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  36.59 
 
 		 785 aa  256  1.0000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0721  CheA signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 544 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159017  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  37.87 
 
 		 610 aa  255  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  32.44 
 
 		 1104 aa  254  4.0000000000000004e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 650 aa  254  5.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  34.4 
 
 		 769 aa  254  7e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 673 aa  253  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  37.5 
 
 		 774 aa  253  1e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 660 aa  252  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3221  CheA signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 635 aa  252  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  34.05 
 
 		 769 aa  252  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0622  CheA signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 543 aa  251  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  36.07 
 
 		 770 aa  251  4e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3199  chemotaxis protein CheA  33.87 
 
 		 561 aa  250  6e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  33.76 
 
 		 769 aa  250  6e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 686 aa  250  6e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 747 aa  250  7e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 743 aa  250  7e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 759 aa  250  7e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  36.04 
 
 		 770 aa  249  1e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 737 aa  249  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  35.84 
 
 		 783 aa  248  3e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  36.93 
 
 		 739 aa  248  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0636  CheA signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 544 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.83539e-26 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  36.18 
 
 		 754 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 719 aa  248  4.9999999999999997e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 747 aa  247  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  37.69 
 
 		 639 aa  246  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  36.66 
 
 		 747 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 739 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  38.9 
 
 		 748 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  38.9 
 
 		 753 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  37.86 
 
 		 748 aa  245  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 746 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  37.56 
 
 		 734 aa  244  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  38.01 
 
 		 760 aa  245  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 738 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  38.01 
 
 		 762 aa  244  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 741 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.12 
 
 		 754 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 747 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  37.86 
 
 		 758 aa  244  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  36.92 
 
 		 744 aa  244  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  34.26 
 
 		 736 aa  244  6e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2736  CheA signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 687 aa  243  7e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  37.76 
 
 		 762 aa  243  7e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0628  CheA signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 553 aa  243  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  37.34 
 
 		 744 aa  243  9e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  35.59 
 
 		 1089 aa  243  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2828  CheA signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 685 aa  242  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 		 691 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2920  CheA signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 685 aa  241  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.038084  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 745 aa  241  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 697 aa  241  5e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 681 aa  240  5.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 691 aa  240  6.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 655 aa  240  6.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 746 aa  240  8e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 690 aa  239  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 709 aa  240  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>