More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0636 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0636  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
544 aa  1092    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.83539e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0622  CheA signal transduction histidine kinase  96.32 
 
 
543 aa  1050    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0721  CheA signal transduction histidine kinase  56.62 
 
 
544 aa  620  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159017  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3199  chemotaxis protein CheA  47.71 
 
 
561 aa  480  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3196  CheA signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 
542 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3091  CheA signal transduction histidine kinases  44.4 
 
 
538 aa  442  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.832082  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0984  chemotaxis sensor histidine kinase  33 
 
 
598 aa  349  9e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
770 aa  348  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  33.05 
 
 
610 aa  334  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
607 aa  333  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
598 aa  332  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  34.26 
 
 
601 aa  329  9e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
604 aa  316  6e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 
919 aa  316  7e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
606 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 
603 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 
919 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 
673 aa  306  8.000000000000001e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 
679 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  29.98 
 
 
769 aa  305  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
1031 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  30.76 
 
 
770 aa  305  2.0000000000000002e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 
954 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  29.82 
 
 
769 aa  301  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  33.33 
 
 
742 aa  301  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  41.18 
 
 
1089 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  30.73 
 
 
774 aa  300  3e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4452  CheA signal transduction histidine kinase  41.97 
 
 
680 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
679 aa  299  8e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  29.82 
 
 
769 aa  298  1e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 
920 aa  299  1e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
728 aa  298  2e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  35.13 
 
 
552 aa  296  7e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  35.13 
 
 
552 aa  296  7e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  31.92 
 
 
639 aa  295  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0031  chemotaxis protein histidine kinase, CheA-like  33.77 
 
 
607 aa  295  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
741 aa  294  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  41.75 
 
 
1030 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
871 aa  291  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  32.19 
 
 
766 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 
681 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
742 aa  290  7e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
558 aa  289  8e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4461  CheA signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 
662 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 
957 aa  287  4e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
686 aa  286  8e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
671 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  31.22 
 
 
625 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 
671 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  29.61 
 
 
801 aa  281  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  38.3 
 
 
685 aa  281  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  38.52 
 
 
677 aa  281  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 
760 aa  280  6e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4471  CheA signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 
684 aa  279  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.710344  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  30.56 
 
 
734 aa  278  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
695 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
697 aa  278  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
796 aa  276  6e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
675 aa  276  9e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4316  CheA signal transduction histidine kinase  41.31 
 
 
674 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1336  CheA signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
657 aa  274  3e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280744  normal  0.428976 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
729 aa  274  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 
655 aa  274  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 
674 aa  274  3e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
878 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
713 aa  273  5.000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 
686 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 
682 aa  273  8.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 
701 aa  271  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  34.31 
 
 
692 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  35.24 
 
 
770 aa  270  4e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2888  CheA signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
671 aa  270  5.9999999999999995e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
911 aa  268  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
666 aa  267  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 
702 aa  267  4e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3317  CheA signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
536 aa  266  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  35.98 
 
 
783 aa  266  8e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
679 aa  265  1e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
660 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  36.67 
 
 
785 aa  265  2e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
614 aa  265  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  34.11 
 
 
803 aa  264  3e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  33.09 
 
 
670 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 
745 aa  264  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
654 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  36.65 
 
 
754 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  35.46 
 
 
767 aa  263  6e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 
673 aa  263  8e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  32.7 
 
 
670 aa  263  8e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  30.46 
 
 
910 aa  262  1e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
696 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0236  CheA signal transduction histidine kinases  37.89 
 
 
654 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  29.7 
 
 
888 aa  261  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1584  chemotaxis histidine protein kinase  38.16 
 
 
654 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.678464  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
666 aa  262  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  32.46 
 
 
672 aa  260  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  35.15 
 
 
660 aa  260  4e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2230  CheA signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 
592 aa  260  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.375764  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5007  CheA signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
792 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0579075  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0766  CheA signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 
802 aa  259  8e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>