More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0721 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0721  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
544 aa  1089    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159017  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0622  CheA signal transduction histidine kinase  57.19 
 
 
543 aa  627  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0636  CheA signal transduction histidine kinase  56.75 
 
 
544 aa  615  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.83539e-26 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3199  chemotaxis protein CheA  52.1 
 
 
561 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3091  CheA signal transduction histidine kinases  48.71 
 
 
538 aa  488  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.832082  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3196  CheA signal transduction histidine kinase  43.25 
 
 
542 aa  456  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
770 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
607 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  35.15 
 
 
610 aa  350  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
598 aa  347  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
604 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
603 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  34.72 
 
 
774 aa  333  4e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
1031 aa  333  6e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0984  chemotaxis sensor histidine kinase  33.61 
 
 
598 aa  332  1e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  33.17 
 
 
769 aa  331  2e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
871 aa  330  3e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  33.01 
 
 
769 aa  329  7e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  33.5 
 
 
601 aa  329  8e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  32.69 
 
 
769 aa  327  4.0000000000000003e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0031  chemotaxis protein histidine kinase, CheA-like  36.06 
 
 
607 aa  324  3e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4461  CheA signal transduction histidine kinase  44.39 
 
 
662 aa  323  6e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4471  CheA signal transduction histidine kinase  45.1 
 
 
684 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.710344  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4452  CheA signal transduction histidine kinase  45.1 
 
 
680 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4316  CheA signal transduction histidine kinase  45.97 
 
 
674 aa  320  5e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 
679 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 
673 aa  317  5e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 
679 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  42.78 
 
 
1089 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 
673 aa  310  2.9999999999999997e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 
728 aa  310  4e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 
919 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  41.02 
 
 
655 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  41.19 
 
 
954 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 
671 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 
674 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  42.63 
 
 
671 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 
920 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
558 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0361  CheW-like protein  41.56 
 
 
897 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30104  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 
957 aa  301  1e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  32.76 
 
 
766 aa  301  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
760 aa  300  4e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 
919 aa  300  6e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
713 aa  299  7e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  39.8 
 
 
770 aa  298  2e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  40.84 
 
 
695 aa  298  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  41.07 
 
 
677 aa  296  4e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  42.89 
 
 
1030 aa  297  4e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
742 aa  294  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  41.24 
 
 
685 aa  293  6e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  38.06 
 
 
770 aa  293  6e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 
679 aa  292  1e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  41.42 
 
 
681 aa  291  1e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 
701 aa  292  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
675 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.69 
 
 
754 aa  291  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 
660 aa  290  6e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  39.79 
 
 
785 aa  289  9e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
686 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 
696 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  39.06 
 
 
748 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 
730 aa  288  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 
729 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  31.36 
 
 
734 aa  287  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 
747 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  38.5 
 
 
758 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
739 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 
747 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 
701 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  40.11 
 
 
691 aa  286  7e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  33.03 
 
 
742 aa  286  9e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 
743 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 
690 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
878 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
741 aa  285  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  37.79 
 
 
803 aa  284  4.0000000000000003e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  38.31 
 
 
692 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  39.28 
 
 
783 aa  282  9e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2222  chemotaxis protein CheA  39.28 
 
 
692 aa  282  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  38.8 
 
 
691 aa  281  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1370  CheA signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
687 aa  281  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0938961  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 
737 aa  280  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 
606 aa  280  6e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 
697 aa  279  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 
686 aa  279  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  38.21 
 
 
927 aa  278  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 
745 aa  278  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 
715 aa  277  4e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  39.22 
 
 
785 aa  277  4e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  37.09 
 
 
754 aa  276  6e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
666 aa  276  6e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  37.98 
 
 
748 aa  276  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  38.26 
 
 
660 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  34.58 
 
 
806 aa  275  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  37.97 
 
 
723 aa  274  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1856  CheA signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 
658 aa  273  6e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0958  CheA signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
1286 aa  273  8.000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  37.86 
 
 
753 aa  272  9e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  37.5 
 
 
744 aa  272  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>