More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3196 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3196  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
542 aa  1084    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3091  CheA signal transduction histidine kinases  47.22 
 
 
538 aa  465  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.832082  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0622  CheA signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 
543 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0721  CheA signal transduction histidine kinase  43.15 
 
 
544 aa  451  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0636  CheA signal transduction histidine kinase  43.6 
 
 
544 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.83539e-26 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3199  chemotaxis protein CheA  45.02 
 
 
561 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
770 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
604 aa  307  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
598 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  33.28 
 
 
601 aa  299  7e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
607 aa  298  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 
701 aa  297  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  32.42 
 
 
610 aa  291  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 
696 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 
919 aa  291  3e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0984  chemotaxis sensor histidine kinase  39.1 
 
 
598 aa  288  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
558 aa  289  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 
954 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 
957 aa  286  9e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 
920 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 
919 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 
1031 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 
695 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
728 aa  281  2e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  39.8 
 
 
1089 aa  281  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4316  CheA signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 
674 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  30.66 
 
 
639 aa  280  5e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4452  CheA signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 
680 aa  279  8e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4471  CheA signal transduction histidine kinase  40.21 
 
 
684 aa  279  8e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.710344  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 
681 aa  279  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
878 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 
747 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 
673 aa  279  1e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  33.39 
 
 
742 aa  278  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
760 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
679 aa  278  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
679 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
603 aa  277  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0031  chemotaxis protein histidine kinase, CheA-like  32.66 
 
 
607 aa  277  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 
671 aa  277  3e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 
739 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 
747 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 
713 aa  276  7e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
660 aa  276  7e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 
743 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  33.64 
 
 
552 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  33.64 
 
 
552 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  39.69 
 
 
748 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
671 aa  273  6e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 
673 aa  273  7e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  39.79 
 
 
753 aa  273  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  35.31 
 
 
754 aa  271  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.15 
 
 
754 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  39.03 
 
 
744 aa  271  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
655 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0988  CheA signal transduction histidine kinases  39.79 
 
 
734 aa  270  4e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.581275 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  32.02 
 
 
734 aa  270  5.9999999999999995e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
666 aa  270  7e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
871 aa  269  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  38.7 
 
 
785 aa  269  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  37.05 
 
 
927 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  38.78 
 
 
744 aa  268  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 
1030 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4461  CheA signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 
662 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  36.68 
 
 
758 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 
606 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  36.78 
 
 
734 aa  267  4e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  38.62 
 
 
748 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30990  chemotaxis protein histidine kinase-like protein  39.16 
 
 
819 aa  266  5.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
759 aa  266  8e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 
737 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  38.62 
 
 
758 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
747 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
746 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
747 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
738 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
674 aa  265  2e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
697 aa  265  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0156  chemotaxis protein CheA  38.7 
 
 
747 aa  264  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.93752  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 
733 aa  264  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  35.32 
 
 
770 aa  264  3e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
691 aa  263  4e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 
649 aa  263  4.999999999999999e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  36.53 
 
 
927 aa  263  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  34.34 
 
 
803 aa  263  6.999999999999999e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 
741 aa  263  8e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  35.01 
 
 
934 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  35.01 
 
 
922 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2888  CheA signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 
671 aa  262  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
675 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0942  CheA signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 
670 aa  261  2e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
686 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 
746 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3317  CheA signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
536 aa  261  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
666 aa  261  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2263  CheA signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
741 aa  260  4e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0131466 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  37.69 
 
 
739 aa  260  4e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0361  CheW-like protein  36.05 
 
 
897 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30104  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  34.82 
 
 
770 aa  259  6e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 
709 aa  260  6e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>